MIZF - MIZF

HINFP
Идентификаторы
Псевдонимы	HINFP, HiNF-P, MIZF, ZNF743, фактор транскрипции гистона H4
Внешние идентификаторы	OMIM: 607099 MGI: 2429620 ГомолоГен: 9174 Генные карты: HINFP
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[1] Группа 9 | 9 A5.2 Начинать 44,292,440 бп[1] Конец 44,305,671 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание гистонов • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • связывание ферментов • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание хроматина • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • Тело Кахала • нуклеоплазма • ядрышко • ядро клетки Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • установление локализации белка • Контрольная точка повреждения ДНК • регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла • отрицательная регуляция экспрессии генов • транскрипция, ДНК-шаблон • регуляция экспрессии генов • дифференцировка миобластов • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Ремонт ДНК • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • внутриутробное эмбриональное развитие • положительная регуляция экспрессии генов • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • G1 / S переход митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	25988	102423
Ансамбль	ENSG00000172273	ENSMUSG00000032119
UniProt	Q9BQA5	Q8K1K9
RefSeq (мРНК)	NM_001243259 NM_015517 NM_198971	NM_172162
RefSeq (белок)	NP_001230188 NP_056332 NP_945322 NP_001338886 NP_001338887 NP_001338888 NP_001338889 NP_001338890 NP_001338891 NP_001338892 NP_001338893 NP_001338894 NP_001338895 NP_001338898 NP_001338900 NP_001338901 NP_001338903	NP_751894
Расположение (UCSC)	н / д	Chr 9: 44.29 - 44.31 Мб
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции гистона H4 это белок что у людей кодируется HINFP ген.^[4][5]

Функция

HINFP - это белок, который связывается с высококонсервативным мотивом ДНК, обнаруженным в большинстве генов гистона H4. HINFP активирует экспрессию гена H4 посредством взаимодействия с субстратом CDK2 NPAT, который локализован в телах гистонового локуса. HINFP был независимо описан как белок, названный «MBD2-взаимодействующий белок цинкового пальца» (MIZF). Сообщалось, что MIZF взаимодействует с метил-CpG-связывающим белком-2 (MBD2; MIM 603547), компонентом комплекса гистондеацетилазы MeCP1 (HDAC). Считается, что MIZF играет роль в метилировании ДНК и репрессии транскрипции. [Предоставлено OMIM]^[5]

Взаимодействия

Одним из ключевых белков-партнеров HINFP является NPAT, субстрат CDK2, который локализуется в телах гистонового локуса. О MIZF сообщили взаимодействовать с Метил-CpG-связывающий домен, белок 2^[4] и DHX9.^[6]

Рекомендации

1. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032119 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Секимата М., Такахаши А., Мураками-Секимата А., Хомма Y (ноябрь 2001 г.). «Участие нового белка цинкового пальца, MIZF, в репрессии транскрипции за счет взаимодействия с метил-CpG-связывающим белком, MBD2». J. Biol. Chem. 276 (46): 42632–8. Дои:10.1074 / jbc.M107048200. PMID  11553631.
5. "Entrez Gene: цинковый палец, взаимодействующий с MIZF MBD2".
6. Fujita H, Fujii R, Aratani S, Amano T, Fukamizu A, Nakajima T. (апрель 2003 г.). «Антитетические эффекты MBD2a на регуляцию генов». Мол. Клетка. Биол. 23 (8): 2645–57. Дои:10.1128 / MCB.23.8.2645-2657.2003. ЧВК  152551. PMID  12665568.

дальнейшее чтение

• Медина Р., ван дер Дин М., Миле-Чемберленд А., Се Р.Л., ван Вейнен А.Дж., Штейн Дж.Л., Стейн Г.С. (2007). «Путь передачи сигнала клеточного цикла HiNF-P / p220NPAT контролирует негистоновые гены-мишени». Рак Res. 67 (21): 10334–42. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-1560. PMID  17974976.
• Mitra P, Xie R, Harper JW, Stein JL, Stein GS, van Wijnen AJ (2007). «HiNF-P представляет собой бифункциональный регулятор транскрипции гена гистона H4, контролируемого клеточным циклом». J. Cell. Биохим. 101 (1): 181–91. Дои:10.1002 / jcb.21157. PMID  17163457.
• Фукусигэ С., Кондо Э, Гу З., Сузуки Х., Хории А. (2006). «Пальцевый белок RET усиливает MBD2- и MBD4-зависимую репрессию транскрипции». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 351 (1): 85–92. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.10.005. PMID  17049487.
• Пулукури С.М., Рао Дж.С. (2006). «Метилирование промотора CpG-островка и подавление экспрессии гена 14-3-3sigma в клеточных линиях рака простаты LNCaP и Tramp-C1 связано с метил-CpG-связывающим белком MBD2». Онкоген. 25 (33): 4559–72. Дои:10.1038 / sj.onc.1209462. ЧВК  1526774. PMID  16786000.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Миле А., Браастад С.Д., Холмс В.Ф., Митра П., Медина Р., Се Р., Заиди С.К., Йе Икс, Вей Ю., Харпер Дж. В., ван Вейнен А.Дж., Штейн Д.Л., Стейн Г.С. (2005). «HiNF-P напрямую связывает путь циклина E / CDK2 / p220NPAT с регуляцией гена гистона H4 при переходе фазы G1 / S клеточного цикла». Мол. Клетка. Биол. 25 (14): 6140–53. Дои:10.1128 / MCB.25.14.6140-6153.2005. ЧВК  1168814. PMID  15988025.
• Секимата М, Хомма Y (2004). «Регулирование экспрессии гена Rb с помощью MBD2-взаимодействующего белка цинкового пальца MIZF во время миогенной дифференцировки». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 325 (3): 653–9. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.10.090. PMID  15541338.
• Секимата М, Хомма Y (2004). «Последовательно-специфическая репрессия транскрипции с помощью MBD2-взаимодействующего белка цинкового пальца MIZF». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (2): 590–7. Дои:10.1093 / нар / гх249. ЧВК  373363. PMID  14752047.
• Митра П., Се Р.Л., Медина Р., Оганесян Х., Заиди С.К., Вей Ю., Харпер Дж. В., Штейн Дж. Л., ван Вейнен А. Дж., Стейн Г. С. (2003). «Идентификация HiNF-P, ключевого активатора контролируемых клеточным циклом генов гистона H4 в начале S-фазы». Мол. Клетка. Биол. 23 (22): 8110–23. Дои:10.1128 / MCB.23.22.8110-8123.2003. ЧВК  262391. PMID  14585971.