МСК (ген) - MSC (gene)

МСК
Идентификаторы
Псевдонимы	МСК, ABF-1, ABF1, MYOR, bHLHa22, мускулин
Внешние идентификаторы	OMIM: 603628 MGI: 1333884 ГомолоГен: 3738 Генные карты: МСК
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q13.3 Начинать 71,841,549 бп[1] Конец 71,844,468 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 A3 | 1 4,5 см Начинать 14,753,346 бп[2] Конец 14,755,992 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • активность димеризации белков • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • развитие неба • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • развитие жаберных скелетных мышц • транскрипция, ДНК-шаблон • развитие диафрагмы • клеточный ответ на фактор ингибирования лейкемии Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9242	17681
Ансамбль	ENSG00000178860	ENSMUSG00000025930
UniProt	O60682	O88940
RefSeq (мРНК)	NM_005098	NM_010827 NM_001360810
RefSeq (белок)	NP_005089	NP_034957 NP_001347739
Расположение (UCSC)	Chr 8: 71.84 - 71.84 Мб	Chr 1: 14.75 - 14.76 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Мускулин это белок что у людей кодируется МСК ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является транскрипционным репрессор способный связать Электронная коробка элемент либо как гомодимер или как гетеродимер с E2A in vitro. Кодируемый белок также образует гетеродимеры с белками E2A. in vivo. Этот белок способен ингибировать трансактивационную способность E47, белок E2A, в клетках млекопитающих. Этот ген является следующей мишенью В-клетка рецептор преобразование сигнала путь.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000178860 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025930 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Massari ME, Rivera RR, Voland JR, Quong MW, Breit TM, van Dongen JJ, de Smit O, Murre C (июнь 1998 г.). «Характеристика ABF-1, нового основного транскрипционного фактора спираль-петля-спираль, экспрессируемого в активированных В-лимфоцитах». Mol Cell Biol. 18 (6): 3130–9. Дои:10.1128 / mcb.18.6.3130. ЧВК  108895. PMID  9584154.
6. Робб Л., Бродницки Т., Коупленд Н. Г., Гилберт Д. Д., Дженкинс Н. А., Харви Р. П. (май 1999 г.). «Отнесение гена фактора транскрипции спираль-петля-спираль человека мускулин / активированный фактор-1 В-клеток (MSC) к хромосоме 8q21 и его мышиный гомолог (Msc) к проксимальной области хромосомы 1». Геномика. 57 (2): 318–9. Дои:10.1006 / geno.1999.5764. PMID  10198176.
7. «Ген Энтреса: МСК мускулин (активированный В-клеточный фактор-1)».

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Робб Л., Хартли Л., Ван СС и др. (1998). «мускулин: ген основного фактора транскрипции спираль-петля-спираль мыши, экспрессируемый в скелетных мышцах эмбриона». Мех. Dev. 76 (1–2): 197–201. Дои:10.1016 / S0925-4773 (98) 00122-1. PMID  9767165. S2CID  780834.
• Вонг Дж., Фунес-Дюран М., Альберг Дж. И др. (2001). «Характеристика основного белка спираль-петля-спираль, ABF-1: ядерная локализация, транскрипционные свойства и взаимодействие с Id-2». ДНК клетки биол. 20 (8): 465–71. Дои:10.1089/104454901316976091. PMID  11560778.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Knight JC, Китинг Б.Дж., Квятковски Д.П. (2004). «Аллель-специфическая репрессия лимфотоксина-альфа активированным В-клеточным фактором-1». Nat. Genet. 36 (4): 394–9. Дои:10,1038 / ng1331. PMID  15052269.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.