Электронная коробка - E-box

An Электронная коробка (коробка усилителя) - это Элемент ответа ДНК найдено в некоторых эукариоты что действует как белок -связывающий сайт, и было обнаружено, что он регулирует экспрессию генов в нейроны, мышцы, и другие ткани.[1] Его специфическая последовательность ДНК, CANNTG (где N может быть любым нуклеотид ), с палиндромным каноническая последовательность CACGTG,[2] признан и связан факторы транскрипции инициировать ген транскрипция. Как только факторы транскрипции связываются с промоторами через E-бокс, другие ферменты может связываться с промотором и облегчать транскрипцию ДНК в мРНК.

Открытие

Электронная коробка была открыта в сотрудничестве между Сусуму Тонегава и Уолтер Гилберт лаборатории в 1985 году в качестве элемента управления в иммуноглобулин энхансер тяжелой цепи.[3][4] Они обнаружили, что в районе 140 пар оснований в тканеспецифическом элементе энхансера транскрипции было достаточно для разных уровней транскрипции улучшение в разных тканях и последовательностях. Они предположили, что белки, вырабатываемые конкретными тканями, действуют на эти усилители, активируя наборы гены во время дифференцировки клеток.

В 1989 году лаборатория Дэвида Балтимора обнаружила первые два переплета для электронных коробок. белки, E12 и E47.[5] Эти иммуноглобулин усилители могут связываться как гетеродимеры к белкам через bHLH домены. В 1990 году был обнаружен еще один Е-белок, ITF-2A (позже переименованный в E2-2Alt), который может связываться с иммуноглобулин легкая цепь усилители.[6] Два года спустя третий белок, связывающий E-бокс, HEB, был обнаружен путем скрининга кДНК библиотека из HeLa клетки.[7] Сплайс-вариант E2-2 был открыт в 1997 году и, как было обнаружено, ингибирует промоутер специфического для мышц гена.[8]

С тех пор исследователи установили, что E-box влияет на ген транскрипция у нескольких эукариот и обнаружил факторы связывания E-box, которые идентифицируют E-box консенсусные последовательности.[9] В частности, несколько экспериментов показали, что E-box является неотъемлемой частью петли обратной связи транскрипции-трансляции, которая включает циркадные часы.

Привязка

Связывающие белки E-бокса играют главную роль в регуляции транскрипционной активности. Эти белки обычно содержат основная спираль-петля-спираль белок структурный мотив, что позволяет им связываться как димеры.[10] Этот мотив состоит из двух амфипатический α-спирали, разделенных небольшой последовательностью аминокислоты, которые образуют один или несколько β-витков. В гидрофобный взаимодействия между этими α-спиралями стабилизируют димеризацию. Кроме того, каждый bHLH мономер имеет базовую область, которая помогает опосредовать распознавание между bHLH мономер и E-box (основная область взаимодействует с большой канавкой ДНК ). В зависимости от мотива ДНК («CAGCTG» против «CACGTG») белок bHLH имеет различный набор основных остатков.

Относительное положение CTRR и E-Box

Привязка E-box модулируется Zn2+ у мышей. CT-Rich Regions (CTRR) расположены примерно в 23 нуклеотиды перед электронным ящиком важен в привязке электронного ящика, трансактивация (повышенная скорость генетической экспрессии) и транскрипция циркадных генов BMAL1 /NPAS2 и BMAL1 /ЧАСЫ комплексы.[11]

Установлено, что специфичность связывания различных E-боксов играет важную роль в их функции. Электронные ящики с разными функциями имеют разное количество и тип привязки.[12]

Консенсусная последовательность E-бокса обычно CANNTG; однако существуют и другие E-блоки подобных последовательностей, называемые неканоническими E-блоками. К ним относятся, но не ограничиваются:

  • Последовательность CACGTT на 20 п.н. выше мышь Период 2 (PER2 ) ген и регулирует его экспрессию[13]
  • Последовательность CAGCTT, обнаруженная в MyoD основной усилитель[14]
  • CACCTCGTGAC последовательность в проксимальный промоутерский регион человек и крыса APOE, который является белковым компонентом липопротеины.[15]

Роль в циркадных часах

Связь между генами, регулируемыми E-box, и циркадные часы была обнаружена в 1997 году, когда Хао, Аллен и Хардин (Департамент биологии в Техасский университет A&M ) проанализированы ритмичность в период (на ) ген в Drosophila melanogaster.[16] Они обнаружили энхансер циркадной транскрипции выше каждого гена во фрагменте ДНК длиной 69 п.н. В зависимости от уровней белка PER энхансер приводил к высоким уровням мРНК транскрипция как в условиях LD (свет-темнота), так и DD (постоянная темнота). Было обнаружено, что энхансер необходим для высокого уровня экспрессия гена но не из-за циркадной ритмичности. Он также работает независимо как цель комплекса BMAL1 / CLOCK.

Электронный блок играет важную роль в циркадных генах; К настоящему времени идентифицировано девять контролируемых E / E'BOX циркадных генов: PER1, PER2, BHLHB2, BHLHB3, CRY1, ДАД, Nr1d1, Кр1d2, и RORC.[17] Поскольку E-box связан с несколькими циркадными генами, возможно, что гены и белки, связанные с ним, являются «критическими и уязвимыми точками в (циркадной) системе».[18]

E-box является одним из пяти семейств факторов транскрипции, связанных с циркадной фазой, и встречается в большинстве тканей.[19] Всего в SCN обнаружено 320 генов, контролируемых E-box (супрахиазматическое ядро ), печень, аорта, надпочечник, WAT (белая жировая ткань ), мозг, предсердие, желудочек, префронтальная кора, скелетная мышца, ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ (коричневая жировая ткань ) и кость черепа.

Элементы, связанные с ЧАСАМИ, подобные E-box (EL-box; GGCACGAGGC), также важны для поддержания циркадной ритмичности в генах, управляемых часами. Подобно E-box, связанный с E-box элемент, подобный CLOCK, может также индуцировать транскрипцию BMAL1 / CLOCK, что затем может приводить к экспрессии в других генах, содержащих EL-box (Ank, DBP, Nr1d1).[20] Однако есть различия между EL-боксом и обычным E-box. Подавление DEC1 и DEC2 имеет более сильное влияние на E-box, чем на EL-box. Кроме того, HES1, который может связываться с другой консенсусной последовательностью (CACNAG, известный как N-бокс), проявляет эффект подавления в EL-боксе, но не в E-боксе.

И неканонические E-блоки, и последовательности, подобные E-box, имеют решающее значение для циркадных колебаний. Недавние исследования по этому поводу сформировали гипотезу, что канонический или неканонический E-box, за которым следует E-box-подобная последовательность с 6 базовая пара Промежуточный интервал является необходимой комбинацией для циркадной транскрипции.[21] Анализ in silico также предполагает, что такой интервал существует и в других известных генах, управляемых часами.


Роль белков, которые связываются с E-боксами

Есть несколько белков, которые связываются с E-боксом и влияют на транскрипцию гена.

ЧАСЫ-АРНТЛ комплекс

Часы-ARNTL (BMAL1) комплекс является неотъемлемой частью млекопитающее циркадный цикл и жизненно важны для поддержания циркадной ритмичности.

Зная, что связывание активирует транскрипцию каждого гена в промоторной области, исследователи обнаружили в 2002 году, что DEC1 и DEC2 (факторы транскрипции bHLH) репрессировали комплекс CLOCK-BMAL1 посредством прямого взаимодействия с BMAL1 и / или конкуренции за элементы E-box. Они пришли к выводу, что DEC1 и DEC2 были регуляторы молекулярных часов млекопитающих.[22]

В 2006 году Риппергер и Шиблер обнаружили, что связывание этого комплекса с электронным блоком приводит к циркадному ритму. ДАД транскрипция и хроматин переходы (переход от хроматина к факультативный гетерохроматин ).[23] Был сделан вывод, что CLOCK регулирует экспрессию DBP путем связывания с мотивами E-бокса в энхансерных областях, расположенных в первой и второй интроны.

MYC (c-Myc, an онкоген )

МОЙ С (c-Myc ), ген, кодирующий фактор транскрипции Мой с, важен в регулировании распространение клеток и апоптоз.

В 1991 году исследователи проверили, может ли c-Myc связываться с ДНК, димеризовав ее до E12. Димеры Е6, химерный белок, были способны связываться с элементом E-box (GGCCACGTGACC), который распознается другими белками HLH.[24] Экспрессия E6 подавляет функцию c-Myc, что указывает на связь между ними.

В 1996 году было обнаружено, что Myc гетеродимеризуется с МАКСИМУМ и что этот гетеродимерный комплекс может связываться с последовательностью CAC (G / A) TG E-box и активировать транскрипцию.[25]

В 1998 году был сделан вывод, что функция c-Myc зависит от активации транскрипции определенных генов через элементы E-box.[26]

MYOD1 (MyoD)

MyoD происходит от Mrf bHLH семья и ее главная роль миогенез, формирование мышечной ткани.[27] Другие члены в этой семье включают миогенин, Myf5, Myf6, Туман1, и Nex-1.

Когда MyoD связывается с мотивом E-box CANNTG, мышца начинается дифференцировка и экспрессия специфичных для мышц белков.[28] Исследователи удалили различные части рекомбинантной последовательности MyoD и пришли к выводу, что MyoD использовала охватывающие элементы для связывания E-бокса и структуры тетралплекса промоторной последовательности специфичного для мышц гена α7. интегрин и саркомерный sMtCK.

MyoD регулирует HB-EGF (Гепарин-связывающий EGF-подобный фактор роста ), член EGF (Фактор эпидермального роста ) семейство, которое стимулирует рост и пролиферацию клеток.[29] Он играет роль в развитии гепатоцеллюлярная карцинома, рак простаты, рак молочной железы, рак пищевода, и рак желудка.

MyoD также может связываться с неканоническими E-боксами MyoG и регулировать его экспрессию.[30]

MyoG (миогенин)

MyoG принадлежит к семейству факторов транскрипции MyoD. Привязка MyoG-E-Box необходима для нервно-мышечный формирование синапсов как HDAC-Dach2-миогенин сигнальный путь в скелетный экспрессия мышечных генов была идентифицирована.[31] Уменьшение экспрессии MyoG было показано у пациентов с симптомом истощения мышц.[32]

MyoG и MyoD также участвуют в миобласт дифференциация.[33] Они действуют трансактивация катепсин B промоторная активность и индукция экспрессии его мРНК.

TCF3 (E47)

E47 продуцируется альтернативным сращиванием E2A в кодировке bHLH, специфичной для E47. экзоны. Его роль заключается в регулировании тканеспецифической экспрессии и дифференцировки генов. Много киназы были связаны с E47, включая 3pk и MK2. Эти 2 белка образуют комплекс с E47 и снижают его транскрипционную активность.[34] CKII и PKA также показаны фосфорилировать E47 in vitro.[35][36][37]

Подобно другим связывающим белкам E-бокса, E47 также связывается с последовательностью CANNTG в E-боксе. У гомозиготных мышей с нокаутом E2A В-клетки развитие останавливается до стадии DJ аранжировки, и B-клетки не созревают.[38] Было показано, что E47 связывается либо как гетеродимер (с E12)[39] или как гомодимер (но более слабый).[40]

Недавнее исследование

Хотя структурная основа взаимодействия BMAL1 / CLOCK с E-box неизвестна, недавние исследования показали, что bHLH белковые домены BMAL1 / CLOCK очень похожи на другие белки, содержащие bHLH, например Myc / Max, кристаллизованные с помощью E-box.[41] Предполагается, что специфические базы необходимы для поддержки этого связывания с высоким сродством. Кроме того, ограничения последовательности в области вокруг циркадного E-бокса до конца не поняты: считается необходимым, но недостаточным, чтобы E-блоки были случайным образом разнесены друг от друга в генетической последовательности, чтобы происходила циркадная транскрипция. . Недавние исследования с участием E-бокса были направлены на поиск большего количества связывающих белков, а также на открытие дополнительных механизмов для ингибирования связывания.

Исследователи Медицинской школы Нанкинский университет обнаружили, что амплитуда FBXL3 (F-бокс / белок с богатыми повторами лейцином) экспрессируется через E-бокс.[42] Они изучили мышей с дефицитом FBXL3 и обнаружили, что он регулирует петли обратной связи в циркадных ритмах, влияя на продолжительность циркадного периода.

Исследование, опубликованное 4 апреля 2013 г. исследователями из Гарвардская медицинская школа обнаружили, что нуклеотиды по обе стороны от E-бокса влияют на то, какие факторы транскрипции могут связываться с самим E-боксом.[43] Эти нуклеотиды определяют трехмерное пространственное расположение нити ДНК и ограничивают размер связывания. факторы транскрипции. Исследование также обнаружило различия в схемах связывания между in vivo и in vitro пряди.

Рекомендации

  1. ^ Massari, M.E .; Мюрр, К. (2000). «Белки спирали-петли-спирали: регуляторы транскрипции в эукариотических организмах». Молекулярная и клеточная биология. 20 (2): 429–440. CiteSeerX  10.1.1.321.6077. Дои:10.1128 / mcb.20.2.429-440.2000. ЧВК  85097. PMID  10611221.
  2. ^ Чаудхари, Дж; Скиннер, М. К. (май 1999 г.). «Основные белки спираль-петля-спираль могут действовать на E-box внутри элемента сывороточного ответа промотора c-fos, чтобы влиять на индуцированную гормонами активацию промотора в клетках Сертоли». Мол Эндокринол. 13 (5): 774–786. Дои:10.1210 / исправление.13.5.0271. PMID  10319327.
  3. ^ Эфрусси, А; Церковь, GM; Тонегава, S; Гилберт, W (1985). «Специфичные для линии B взаимодействия усилителя иммуноглобулина с клеточными факторами in vivo». Наука. 227 (4683): 134–140. Bibcode:1985Научный ... 227..134E. Дои:10.1126 / science.3917574. PMID  3917574.
  4. ^ Церковь, GM; Эфрусси, А; Гилберт, Вт; Тонегава, S (1985). «Специфичные для клеточного типа контакты с усилителями иммуноглобулинов в ядрах». Природа. 313 (6005): 798–801. Bibcode:1985Натура.313..798C. Дои:10.1038 / 313798a0. PMID  3919308.
  5. ^ Мюрр, К; Mc Caw, P S; Vaessin, H; и другие. (Август 1989 г.). «Взаимодействия между гетерологичными белками спираль-петля-спираль образуют комплексы, которые специфически связываются с общей последовательностью ДНК». Клетка. 58 (3): 537–544. Дои:10.1016/0092-8674(89)90434-0. PMID  2503252.
  6. ^ Henthorn, P; Киледжиан, М; Кадеш, Т. (1990). «Два различных фактора транскрипции, которые связывают мотив микроЕ5 / каппа 2 усилителя иммуноглобулина». Наука. 247 (4941): 467–470. Bibcode:1990Sci ... 247..467H. Дои:10.1126 / science.2105528. PMID  2105528.
  7. ^ Ху С.Дж., Олсон Э.Н.; Кингстон, Р. Э. (1992). "HEB". Mol Cell Biol. 12 (3): 1031–1042. Дои:10.1128 / MCB.12.3.1031. ЧВК  369535. PMID  1312219.
  8. ^ Чен, B; Лим, Р. У. (январь 1997 г.). «Физические и функциональные взаимодействия между ингибиторами транскрипции Id3 и ITF-2b. Доказательства нового механизма, регулирующего экспрессию генов, специфичных для мышц». J Biol Chem. 272 (4): 2459–2463. Дои:10.1074 / jbc.272.4.2459. PMID  8999959.
  9. ^ Мэдж Б .: Электронная коробка. В: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009 г. Дои:10.1007 / SpringerReference_173452
  10. ^ Ellenberger, T; Фасс, Д; Арно, М; Харрисон, С. С. (апрель 1994 г.). «Кристаллическая структура фактора транскрипции E47: распознавание E-бокса димером основной области спираль-петля-спираль». Genes Dev. 8 (8): 970–980. Дои:10.1101 / gad.8.8.970. PMID  7926781.
  11. ^ Муньос; Мишель Брюэр; Рубен Балер (2006). «Модуляция активности комплекса BMAL / CLOCK / E-Box с помощью CT-богатого цис-действующего элемента». Молекулярная и клеточная эндокринология. 252 (1–2): 74–81. Дои:10.1016 / j.mce.2006.03.007. PMID  16650525.
  12. ^ Бозе, Судип; Букфор, Фредрик Р. (2010). «Эпизоды экспрессии гена пролактина в клетках GH3 зависят от селективного связывания промотора множества циркадных элементов». Эндокринология. 151 (5): 2287–2296. Дои:10.1210 / en.2009-1252. ЧВК  2869263. PMID  20215567.
  13. ^ Yoo, S.H .; Ko, C.H .; Lowrey, P.L .; и другие. (2005). «Неканонический энхансер E-box управляет циркадными колебаниями Period2 мыши in vivo». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 102 (7): 2608–2613. Bibcode:2005PNAS..102.2608Y. Дои:10.1073 / pnas.0409763102. ЧВК  548324. PMID  15699353.
  14. ^ Чжан, X .; Patel, S.P .; Маккарти, Дж. Дж .; Рабчевский, А.Г .; Goldhamer, D. J .; Эссер, К. А. (2012). «Неканонический E-box внутри усилителя ядра MyoD необходим для циркадной экспрессии в скелетных мышцах». Нуклеиновые кислоты Res. 40 (8): 3419–3430. Дои:10.1093 / нар / gkr1297. ЧВК  3333858. PMID  22210883.
  15. ^ Салеро, Энрике; Хименес, Сесилио; Зафра, Франсиско (15 марта 2003 г.). «Идентификация неканонического мотива E-бокса в качестве регуляторного элемента в проксимальной области промотора гена аполипопротеина E». Биохимический журнал. 370 (3): 979–986. Дои:10.1042 / BJ20021142. ЧВК  1223214. PMID  12444925.
  16. ^ Хао, Н; Аллен, Д. Л.; Хардин П. Э. (июль 1997 г.). «Циркадный энхансер опосредует PER-зависимый цикл мРНК у Drosophila melanogaster». Mol Cell Biol. 17 (7): 3687–3693. Дои:10.1128 / MCB.17.7.3687. ЧВК  232220. PMID  9199302.
  17. ^ Панда, S; Антох МП; Miller BH; Су AI; Schook AB; Straume M; Schultz PG; Kay SA; Takahashi JS; Хогенеш JB (май 2002 г.). «Скоординированная транскрипция ключевых путей у мыши по циркадным часам». Клетка. 109 (3): 307–320. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00722-5. PMID  12015981.
  18. ^ Херцог, Эрик (октябрь 2007 г.). «Нейроны и сети в суточных ритмах». Обзоры природы Неврология. 8 (10): 790–802. Дои:10.1038 / номер 2215. PMID  17882255.
  19. ^ Ян, июнь; Хайфан Ван; Ютин Лю; Чуньсюань Шао (октябрь 2008 г.). "Анализ регуляторных сетей генов в циркадном ритме млекопитающих". PLOS вычислительная биология. 4 (10): e1000193. Bibcode:2008PLSCB ... 4E0193Y. Дои:10.1371 / journal.pcbi.1000193. ЧВК  2543109. PMID  18846204.
  20. ^ Уэсима, Т; Кавамото Т; Honda KK; Ноширо М; Fujimoto K; Nakao S; Ichinose N; Hashimoto S; Gotoh O; Като Y (декабрь 2012 г.). «Идентификация нового связанного с часами элемента EL-box, участвующего в регуляции циркадных ритмов посредством BMAL1 / CLOCK и HES1». Ген. 510 (2): 118–125. Дои:10.1016 / j.gene.2012.08.022. PMID  22960268.
  21. ^ Накахата, Й; Yoshida M; Такано А; Soma H; Ямамото Т; Ясуда А; Накацу Т; Такуми Т. (январь 2008 г.). «Прямое повторение элементов, подобных E-box, необходимо для клеточно-автономного циркадного ритма часовых генов». БМК Мол Биол. 9 (1): 1. Дои:10.1186/1471-2199-9-1. ЧВК  2254435. PMID  18177499.
  22. ^ Хонма, S; Кавамото, Т.; Такаги, Й; Fujimoto, K; Sato, F; Ноширо, М; Като, Y; Хонма, К. (2002). «Dec1 и Dec2 являются регуляторами молекулярных часов млекопитающих». Природа. 419 (6909): 841–844. Bibcode:2002Натура.419..841H. Дои:10.1038 / природа01123. PMID  12397359.
  23. ^ Ripperger, J A .; Шиблер, У. (март 2006 г.). «Ритмическое связывание CLOCK-BMAL1 с множеством мотивов E-box управляет циркадной транскрипцией Dbp и переходами хроматина» (PDF). Nat. Genet. 38 (3): 369–374. Дои:10,1038 / ng1738. PMID  16474407.
  24. ^ Прендергаст, Г. С; Зифф, Е. Б. (январь 1991 г.). «Связывание ДНК, чувствительной к метилированию, с помощью основной области c-Myc». Наука. 251 (4990): 186–189. Bibcode:1991Научный ... 251..186P. Дои:10.1126 / science.1987636. PMID  1987636.
  25. ^ Desbarats, L; Gaubatz, S; Эйлерс, М. (февраль 1996 г.). «Различие между различными E-бокс-связывающими белками в эндогенном гене-мишени c-myc». Genes Dev. 10 (4): 447–460. Дои:10.1101 / gad.10.4.447. PMID  8600028.
  26. ^ Сяо, Q; Claassen, G; Ши, Дж; Адачи, S; Сейви, Дж; Ханн, С. Р. (декабрь 1998 г.). «Дефектный по трансактивации c-MycS сохраняет способность регулировать пролиферацию и апоптоз». Genes Dev. 12 (24): 3803–3808. Дои:10.1101 / gad.12.24.3803. ЧВК  317265. PMID  9869633.
  27. ^ Mädge B .: E-Box. В: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009. Дои:10.1007 / SpringerReference_173452
  28. ^ Шкловер, Дж; Etzioni, S; Weisman-Shomer, P; Яфе, А; Бенгалия, E; Фрай, М. (2007). «MyoD использует перекрывающиеся, но отдельные элементы для связывания E-бокса и тетраплексных структур регуляторных последовательностей генов, специфичных для мышц». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (21): 7087–7095. Дои:10.1093 / нар / гкм746. ЧВК  2175354. PMID  17942416.
  29. ^ Мэдж Б .: Электронная коробка. В: Schwab M. (Ed.) Encyclopedia of Cancer: SpringerReference (www.springerreference.com). Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2009 г. Дои:10.1007 / SpringerReference_173452
  30. ^ Бергстром, Д. А .; Penn, B.H .; Strand, A .; Perry, R.L .; Rudnicki, M. A .; Тапскотт, С. Дж. (2002). «Промотор-специфическая регуляция связывания MyoD и передача сигнала взаимодействуют с паттерном экспрессии генов». Мол. Клетка. 9 (3): 587–600. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00481-1. PMID  11931766.
  31. ^ Тан, H; Гольдман, Д. (2006). «Зависящая от активности регуляция гена в скелетных мышцах опосредуется каскадом передачи сигнала гистондеацетилазы (HDAC) -Dach2-миогенин». Proc Natl Acad Sci USA. 103 (45): 16977–16982. Bibcode:2006ПНАС..10316977Т. Дои:10.1073 / pnas.0601565103. ЧВК  1636564. PMID  17075071.
  32. ^ Рамамурти, S; Донохью, М; Бак, М. (2009). «Снижение экспрессии Jun-D и миогенина при истощении мышц при кахексии человека». Am J Physiol Endocrinol Metab. 297 (2): E392–401. Дои:10.1152 / ajpendo.90529.2008. ЧВК  2724118. PMID  19470832.
  33. ^ Джейн, Д.Т .; Morvay, L.C .; Koblinski, J .; и другие. (2002). «Доказательства того, что элементы промотора E-box и факторы транскрипции MyoD играют роль в индукции экспрессии гена катепсина B во время дифференцировки миобластов человека». Биол. Chem. 383 (12): 1833–1844. Дои:10.1515 / BC.2002.207. PMID  12553720.
  34. ^ Нойфельд, Бернд; Гросс-Вильд, Энн; Хоффмайер, Анжелика; Jordan, Bruce W. M .; Чен, Пэйфэн; Динев, Драгомир; Людвиг, Стефан; Рапп, Ульф Р. (7 июля 2000 г.). "Серин / треонинкиназы 3pK и MAPK-активированная протеинкиназа 2 взаимодействуют с основным транскрипционным фактором E47 спираль-петля-спираль и подавляют его транскрипционную активность". Журнал биологической химии. 275 (27): 20239–20242. Дои:10.1074 / jbc.C901040199. PMID  10781029.
  35. ^ Джонсон, Салли Э .; Ван, Сюэянь; Харди, Серж; Тапаровски, Элизабет Дж .; Конечны, Стивен Ф. (апрель 1996 г.). «Казеинкиназа II увеличивает транскрипционную активность MRF4 и MyoD независимо от их прямого фосфорилирования». Молекулярная и клеточная биология. 16 (4): 1604–1613. Дои:10.1128 / MCB.16.4.1604. ЧВК  231146. PMID  8657135.
  36. ^ Слоан, Стивен Р .; Шен, Чун-Пын; Маккаррик-Уолмсли, Рут; Кадеш, Том (декабрь 1996). «Фосфорилирование E47 как потенциальный детерминант B-клеточной специфической активности». Молекулярная и клеточная биология. 16 (12): 6900–6908. Дои:10.1128 / MCB.16.12.6900. ЧВК  231693. PMID  8943345.
  37. ^ Шен, Чун-Пын; Кадеш, Том (август 1995). «Связывание B-клеточной ДНК гомодимером E47». Молекулярная и клеточная биология. 15 (8): 4518–4524. Дои:10.1128 / MCB.15.8.4518. ЧВК  230691. PMID  7623842.
  38. ^ Бэйн, Гретхен; Maandag, Els C .; Изон, Дэвид Дж .; Амсен, Дерк; Kruisbeek, Ada M .; Weintraub, Bennett C .; Кроп, Ян; Schlissel, Mark S .; Фини, Энн Дж .; ван Роон, Мариан; ван дер Валк, Мартин; te Riele, Hein P.J .; Бернс, Антон; Мюрр, Корнелиус (2 декабря 1994). «Белки E2A необходимы для правильного развития В-клеток и инициации перестройки генов иммуноглобулина». Клетка. 79 (5): 885–92. Дои:10.1016/0092-8674(94)90077-9. PMID  8001125.
  39. ^ Лассар, Эндрю Б .; Дэвис, Роберт Л .; Wright, Woodring E .; Кадеш, Том; Мюрр, Корнелиус; Воронова, Анна; Балтимор, Дэвид; Вайнтрауб, Гарольд (26 июля 1991 г.). «Функциональная активность миогенных белков HLH требует гетероолигомеризации с E12 / E47-подобными белками in vivo». Клетка. 66 (2): 305–15. Дои:10.1016 / 0092-8674 (91) 90620-Е. PMID  1649701.
  40. ^ Мюрр, Корнелиус; Маккоу, Патрик Шенлебер; Vaessin, H .; Caudy, M .; Jan, L.Y .; Ян, Ю.Н .; Кабрера, Карлос V .; Бускин, Жан Н .; Hauschka, Стивен Д .; Лассар, Эндрю Б .; Вайнтрауб, Гарольд; Балтимор, Дэвид (11 августа 1989 г.). «Взаимодействия между гетерологичными белками спираль-петля-спираль образуют комплексы, которые специфически связываются с общей последовательностью ДНК». Клетка. 58 (3): 537–44. Дои:10.1016/0092-8674(89)90434-0. PMID  2503252.
  41. ^ Muñoz, E; Брюэр, М; Балер Р. (сентябрь 2002 г.). «Циркадная транскрипция: мысли вне электронного ящика». J Biol Chem. 277 (39): 36009–36017. Дои:10.1074 / jbc.m203909200. PMID  12130638.
  42. ^ Ши, G; Xing, L; Лю, Z; и другие. (2013). «Двойная роль FBXL3 в циркадных петлях обратной связи млекопитающих важна для определения периода и надежности часов». Proc Natl Acad Sci U S A. 110 (12): 4750–5. Bibcode:2013ПНАС..110.4750С. Дои:10.1073 / pnas.1302560110. ЧВК  3606995. PMID  23471982.
  43. ^ Gordân, R; Шен, н. Дрор, я; Чжоу, Т; Хортон, Дж; Rohs, R; Булык МЛ. (Апрель 2013 г.). «Геномные области, фланкирующие сайты связывания E-Box, влияют на специфичность связывания ДНК факторов транскрипции bHLH через форму ДНК». Сотовый представитель. 3 (4): 1093–104. Дои:10.1016 / j.celrep.2013.03.014. ЧВК  3640701. PMID  23562153.

внешняя ссылка