MTERF1 - MTERF1

MTERF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3 МВА, 3MVB, 3Н6С, 3N7Q, 5CO0, 5CRJ, 5CKY, 5CRK
Идентификаторы
Псевдонимы	MTERF1, MTERF, фактор терминации митохондриальной транскрипции 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602318 MGI: 3704243 ГомолоГен: 5073 Генные карты: MTERF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q21.2 Начинать 91,692,008 бп[1] Конец 91,880,702 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 A1 | 5 Начинать 4,192,367 бп[2] Конец 4,197,651 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание двухцепочечной ДНК • Связывание РНК Сотовый компонент • митохондриальный матрикс • митохондриальный нуклеоид • митохондрия • цитозоль Биологический процесс • прекращение митохондриальной транскрипции • митохондриальная организация • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • Геометрическое изменение ДНК • ДНК-шаблонная транскрипция, терминация Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7978	208595
Ансамбль	ENSG00000127989	ENSMUSG00000053178
UniProt	Q99551	B9EJ57
RefSeq (мРНК)	NM_001301134 NM_001301135 NM_006980	NM_001042670
RefSeq (белок)	NP_001288063 NP_001288064 NP_008911	NP_001036135
Расположение (UCSC)	Chr 7: 91,69 - 91,88 Мб	Chr 5: 4.19 - 4.2 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор терминации митохондриальной транскрипции 1, также известный как MTERF1, это белок который у человека кодируется MTERF ген.^[5][6][7][8]

Этот ген кодирует митохондриальный транскрипция фактор завершения. Этот белок участвует в ослаблении транскрипции митохондриального генома; это ослабление позволяет более высокий уровень экспрессии 16S рибосомная РНК относительно тРНК ген ниже по течению. Продукт этого гена имеет три лейциновая молния мотивы, заключенные в скобки двумя основными доменами, которые все необходимы для связывания ДНК. Есть свидетельства того, что для этого протеина молнии участвуют во внутримолекулярных взаимодействиях, которые устанавливают трехмерную структуру, необходимую для связывания ДНК.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000127989 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053178 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: фактор терминации митохондриальной транскрипции MTERF».
6. Дага А., Миколь В., Хесс Д., Эберсолд Р., Аттарди Г. (апрель 1993 г.). «Молекулярная характеристика фактора терминации транскрипции митохондрий человека». J. Biol. Chem. 268 (11): 8123–30. PMID  7681833.
7. Асин-Каюела Дж., Хельм М., Аттарди Дж. (Апрель 2004 г.). «Переход от мономера к тримеру фактора терминации транскрипции митохондрий человека (mTERF) связан с потерей активности in vitro». J. Biol. Chem. 279 (15): 15670–7. Дои:10.1074 / jbc.M312537200. PMID  14744862.
8. Асин-Кайуэла Дж., Швенд Т., Фарге Дж., Густафссон С.М. (июль 2005 г.). «Фактор терминации транскрипции митохондрий человека (mTERF) полностью активен in vitro в нефосфорилированной форме». J. Biol. Chem. 280 (27): 25499–505. Дои:10.1074 / jbc.M501145200. PMID  15899902.

дальнейшее чтение

• Дага А., Микол В., Хесс Д. и др. (1993). «Молекулярная характеристика фактора терминации транскрипции митохондрий человека». J. Biol. Chem. 268 (11): 8123–30. PMID  7681833.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Фернандес-Сильва П., Мартинес-Азорин Ф, Миколь В., Аттарди Г. (1997). «Фактор терминации митохондриальной транскрипции человека (mTERF) является белком мульти-застежки-молнии, но связывается с ДНК в качестве мономера, что свидетельствует о внутримолекулярных взаимодействиях лейциновой застежки-молнии». EMBO J. 16 (5): 1066–79. Дои:10.1093 / emboj / 16.5.1066. ЧВК  1169706. PMID  9118945.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Конструирование и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК с обогащением по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (1999). «К полной последовательности человеческого генома». Genome Res. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR и др. (2003). «Хромосома 7 человека: последовательность ДНК и биология». Наука. 300 (5620): 767–72. Дои:10.1126 / science.1083423. ЧВК  2882961. PMID  12690205.
• Хиллиер Л.В., Фултон Р.С., Фултон Л.А. и др. (2003). «Последовательность ДНК хромосомы 7 человека». Природа. 424 (6945): 157–64. Дои:10.1038 / природа01782. PMID  12853948.
• Асин-Кайуэла Дж, Хелм М., Аттарди Дж. (2004). «Переход от мономера к тримеру фактора терминации транскрипции митохондрий человека (mTERF) связан с потерей активности in vitro». J. Biol. Chem. 279 (15): 15670–7. Дои:10.1074 / jbc.M312537200. PMID  14744862.
• Прието-Мартин А., Монтойя Дж., Мартинес-Азорин Ф. (2004). «Фосфорилирование фактора терминации транскрипции митохондрий крыс (mTERF) необходимо для терминации транскрипции, но не для связывания с ДНК». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (7): 2059–68. Дои:10.1093 / нар / гх528. ЧВК  407814. PMID  15087485.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Асин-Кайуэла Дж., Швенд Т., Фарге Дж., Густафссон С.М. (2005). «Фактор терминации транскрипции митохондрий человека (mTERF) полностью активен in vitro в нефосфорилированной форме». J. Biol. Chem. 280 (27): 25499–505. Дои:10.1074 / jbc.M501145200. PMID  15899902.
• Hyvärinen AK, Pohjoismäki JL, Reyes A, et al. (2007). «Фактор терминации транскрипции митохондрий mTERF модулирует приостановку репликации в митохондриальной ДНК человека». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (19): 6458–74. Дои:10.1093 / нар / гкм676. ЧВК  2095818. PMID  17884915.