MYCBP2 - MYCBP2

MYCBP2
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	3GBW, 3HWJ
Идентификаторы
Псевдонимы	MYCBP2, PAM, Myc-bp2, Phr, MYC-связывающий белок 2, убиквитин-лигаза E3, PHR1, MYC-связывающий белок 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 610392 MGI: 2179432 ГомолоГен: 9005 Генные карты: MYCBP2
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 13 (человек)
Конец	77,327,094 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 14 (мышь)
Конец	103,346,814 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• GO: 0001948 связывание с белками; • связывание ионов металлов; • трансферазная активность; • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов; • связывание ионов цинка; • Ran связывание GTPase; • активность гомодимеризации белков; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы;
Сотовый компонент	• мембрана; • ядро клетки; • цитоплазма; • цитоскелет; • цитоскелет микротрубочек; • аксон; • проекция клетки; • внутриклеточная мембраносвязанная органелла;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • убиквитинирование белков; • транскрипция, ДНК-шаблон; • управление аксоном двигательного нейрона; • ведение аксона жабрдиомоторного нейрона; • проекция центральной нервной системы нейрон аксоногенез; • регулирование локализации белка; • отрицательная регуляция катаболического процесса белков; • клеточный морфогенез, участвующий в дифференцировке нейронов; • нервно-мышечный процесс; • регуляция организации цитоскелета; • регулирование наведения аксонов; • положительная регуляция убиквитинирования белков; • циркадная регуляция экспрессии генов; • ритмический процесс;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	23077
	105689
	ENSG00000005810
	ENSMUSG00000033004
	O75592
	Q7TPH6
	NM_015057
	NM_207215
	NP_055872
	NP_997098
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Вероятная E3 убиквитин-протеинлигаза MYCBP2 также известен как myc-связывающий белок 2 или белок ассоциируется с myc (PAM) - это фермент что у людей кодируется MYCBP2 ген.^[5]^[6]

Структура

PAM содержит N-концевой лейциновая молния, центральный МОЙ С -обвязка, и C-терминал гистон -связывающие домены гомологии белков.^[5]

Взаимодействия

MYCBP2 был показан взаимодействовать с Мой с.^[5]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000005810 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033004 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б ^c Гуо Q, Се Дж., Данг CV, Лю Э. Т., епископ Дж. М. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация большого Myc-связывающего белка, который содержит RCC1-подобные повторы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (16): 9172–7. Дои:10.1073 / пнас.95.16.9172. ЧВК 21311. PMID 9689053.
^ «Ген Entrez: MYCBP2 MYC-связывающий белок 2».

дальнейшее чтение

Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О, Нагасе Т. (2002). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК Res. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID 12168954.
Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (6): 355–64. Дои:10.1093 / днарес / 5.6.355. PMID 10048485.
Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК 310934. PMID 11042152.
Мурти В., Хан С., Бошам Р. Л., Смит Н., Хаддад Л. А., Ито Н., Рамеш В. (2004). «Pam и его ортолог highwire взаимодействуют и могут негативно регулировать комплекс TSC1.TSC2». J. Biol. Chem. 279 (2): 1351–8. Дои:10.1074 / jbc.M310208200. PMID 14559897.
Бранденбергер Р., Вэй Х., Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (2004). «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку ES-клеток человека». Nat. Биотехнология. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID 15146197.
Пьер С.К., Хойслер Дж., Бирод К., Гайсслингер Г., Шолих К. (2004). «PAM опосредует длительное ингибирование передачи сигналов цАМФ сфингозин-1-фосфатом». EMBO J. 23 (15): 3031–40. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600321. ЧВК 514936. PMID 15257286.
Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК 514446. PMID 15302935.
Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С., Уэллс С. Д., Фосетт Дж. П., Кулкарни С., Метальников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вудгетт Дж. Р., Лангеберг Л. К., Скотт Дж. Д., Поусон Т. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Гао X, Патель ТБ (2005). «Остатки гистидина 912 и 913 в белке, связанном с Myc, необходимы для ингибирования активности аденилатциклазы». Мол. Pharmacol. 67 (1): 42–9. Дои:10.1124 / моль 104.005355. PMID 15470080.
Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, обычно подавляемого при раке». Мол. Cell. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.

Эта статья о ген на хромосома человека 13 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000005810 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000033004 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid9689053-5] а ^б ^c Гуо Q, Се Дж., Данг CV, Лю Э. Т., епископ Дж. М. (сентябрь 1998 г.). «Идентификация большого Myc-связывающего белка, который содержит RCC1-подобные повторы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (16): 9172–7. Дои:10.1073 / пнас.95.16.9172. ЧВК 21311. PMID 9689053.

[entrez-6] «Ген Entrez: MYCBP2 MYC-связывающий белок 2».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]