Вспомогательный компонент мультисинтетазного комплекса р38 - Multisynthetase complex auxiliary component p38

AIMP2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4DPG, 4YCU, 4YCW, 5A34, 5A1N, 5A5H
Идентификаторы
Псевдонимы	AIMP2, JTV-1, JTV1, P38, PRO0992, вспомогательный компонент мультисинтетазного комплекса p38, многофункциональный белок 2, взаимодействующий с аминоацил тРНК синтетазным комплексом, HLD17
Внешние идентификаторы	OMIM: 600859 MGI: 2385237 ГомолоГен: 4594 Генные карты: AIMP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p22.1 Начните 6,009,255 бп[1] Конец 6,023,834 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 G2 Начните 143,902,704 бп[2] Конец 143,909,847 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0032947 активность молекулярного адаптера Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • ядро клетки • цитозоль • мультиферментный комплекс аминоацил-тРНК синтетазы Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • дифференциация клеток • Дифференцировка пневмоцитов II типа • положительная регуляция гибели нейронов • положительная регуляция убиквитинирования белков • аминоацилирование тРНК для трансляции белков • биосинтез белка • отрицательное регулирование пролиферации клеток • апоптотический процесс • положительная регуляция активности аминоацил-тРНК лигазы • сборка макромолекулярного комплекса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7965	231872
Ансамбль	ENSG00000106305	ENSMUSG00000029610
UniProt	Q13155	Q8R010
RefSeq (мРНК)	NM_006303 NM_001326606 NM_001326607 NM_001326609 NM_001326611 NM_018570 NM_001326610 NM_001362785 NM_001362787	NM_001172146 NM_146165
RefSeq (белок)	NP_001313535 NP_001313536 NP_001313538 NP_001313539 NP_001313540 NP_006294 NP_001349714 NP_001349716	NP_001165617 NP_666277
Расположение (UCSC)	Chr 7: 6.01 - 6.02 Мб	Chr 5: 143,9 - 143,91 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Многофункциональный белок 2, взаимодействующий с комплексом аминоацил тРНК синтетазы является фермент что у людей кодируется AIMP2 ген.^[5][6][7]

Функция

Ген JTV1 расположен на хромосоме 7p22, фланкированной двумя генами, HRI и PMS2. JTV1 и HRI слегка перекрываются и расположены «хвост к хвосту». JTV1 и PMS2 разделены примерно 200 парами оснований и расположены друг к другу. JTV1 транскрибируется в противоположном направлении по сравнению с HRI и PMS2. Функция продукта гена JTV1 неизвестна.^[7]

Взаимодействия

Было показано, что вспомогательный компонент мультисинтетазного комплекса p38 взаимодействовать с участием Паркин (лигаза),^[8] P53^[6] и КАРС.^[9][10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106305 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029610 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Николаидес NC, Kinzler KW, Vogelstein B (сентябрь 1995 г.). «Анализ 5'-области PMS2 выявляет гетерогенные транскрипты и новый перекрывающийся ген». Геномика. 29 (2): 329–34. Дои:10.1006 / geno.1995.9997. PMID  8666379.
6. Хан Дж.М., Пак Би Джей, Пак С.Г., О Й.С., Чой С.Дж., Ли С.В., Хван С.К., Чанг Ш., Чо М.Х., Ким С. (август 2008 г.). «AIMP2 / p38, каркас для комплекса мульти-тРНК-синтетазы, отвечает на генотоксические стрессы через p53». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 105 (32): 11206–11. Bibcode:2008PNAS..10511206H. Дои:10.1073 / pnas.0800297105. ЧВК  2516205. PMID  18695251.
7. «Энтрез Ген: JTV1, ген JTV1».
8. Corti O, Hampe C, Koutnikova H, Darios F, Jacquier S, Prigent A, Robinson JC, Pradier L, Ruberg M, Mirande M, Hirsch E, Rooney T., Fournier A, Brice A (июнь 2003 г.). «Субъединица p38 комплекса аминоацил-тРНК синтетазы является субстратом Паркина: связывая биосинтез белка и нейродегенерацию». Молекулярная генетика человека. 12 (12): 1427–37. Дои:10.1093 / hmg / ddg159. PMID  12783850.
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
10. Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, Siatecka M, Mirande M (январь 1999 г.). «Сборка макромолекул аминоацил-тРНК синтетаз: идентификация белок-белковых взаимодействий и характеристика основного белка». Журнал молекулярной биологии. 285 (1): 183–95. Дои:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID  9878398.

дальнейшее чтение

• Парк С.Г., Эвалт К.Л., Ким С. (октябрь 2005 г.). «Функциональное расширение аминоацил-тРНК синтетаз и их взаимодействующих факторов: новые взгляды на домработниц». Тенденции в биохимических науках. 30 (10): 569–74. Дои:10.1016 / j.tibs.2005.08.004. PMID  16125937.
• Рашевский В. (1978). «Защитное действие ряда новых солей монопиридиния и их влияние на« старение »ацетилхолинэстеразы, ингибируемое флуостигмином». Польский журнал фармакологии и фармации. 29 (6): 603–7. PMID  600859.
• Norcum MT (август 1991 г.). «Структурный анализ высокомолекулярного комплекса аминоацил-тРНК синтетазы. Действие нейтральных солей и детергентов». Журнал биологической химии. 266 (23): 15398–405. PMID  1651330.
• Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, Siatecka M, Mirande M (январь 1999 г.). «Сборка макромолекул аминоацил-тРНК синтетаз: идентификация белок-белковых взаимодействий и характеристика основного белка». Журнал молекулярной биологии. 285 (1): 183–95. Дои:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID  9878398.
• Кан Дж., Ким Т., Ко Ю.Г., Ро С.Б., Пак С.Г., Ким М.Дж., Квон Х.Д., Ким С. (октябрь 2000 г.). «Белок теплового шока 90 опосредует белок-белковые взаимодействия между аминоацил-тРНК синтетазами человека». Журнал биологической химии. 275 (41): 31682–8. Дои:10.1074 / jbc.M909965199. PMID  10913161.
• Ан Х., Ким С., Ли Би Джей (май 2003 г.). «Структура раствора и связывание p43 мотива лейциновой молнии p38: взаимодействия спиральной спирали опосредуют ассоциацию между p38 и p43». Письма FEBS. 542 (1–3): 119–24. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00362-4. PMID  12729910. S2CID  39222196.
• Corti O, Hampe C, Koutnikova H, Darios F, Jacquier S, Prigent A, Robinson JC, Pradier L, Ruberg M, Mirande M, Hirsch E, Rooney T., Fournier A, Brice A (июнь 2003 г.). «Субъединица p38 комплекса аминоацил-тРНК синтетазы представляет собой субстрат Паркина: связывающий биосинтез белка и нейродегенерацию». Молекулярная генетика человека. 12 (12): 1427–37. Дои:10.1093 / hmg / ddg159. PMID  12783850.
• Ким MJ, Пак Би Джей, Кан Й.С., Ким ХД, Пак Дж. Х., Кан Дж. У., Ли С. В., Хан Дж. М., Ли Х. В., Ким С. (июль 2003 г.). «Подавление FUSE-связывающего белка и c-myc кофактором тРНК-синтетазы p38 требуется для дифференцировки клеток легких». Природа Генетика. 34 (3): 330–6. Дои:10.1038 / ng1182. PMID  12819782. S2CID  41006480.
• Сампат П., Мазумдер Б., Сешадри В., Гербер К.А., Чаватт Л., Кинтер М., Тинг С.М., Дигнам Д.Д., Ким С., Дрисколл Д.М., Фокс П.Л. (октябрь 2004 г.). «Неканоническая функция глутамил-пролил-тРНК синтетазы: ген-специфическое подавление трансляции». Ячейка. 119 (2): 195–208. Дои:10.1016 / j.cell.2004.09.030. PMID  15479637. S2CID  18944876.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Милштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.