Mycobacterium africanum - Mycobacterium africanum
Mycobacterium africanum | |
---|---|
Научная классификация | |
Королевство: | |
Тип: | |
Заказ: | |
Подотряд: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | М. africanum |
Биномиальное имя | |
Mycobacterium africanum Castets et al. 1969 г.,[1] ATCC 25420 |
Mycobacterium africanum это разновидность Микобактерии это чаще всего встречается в странах Западной Африки, где, по оценкам, является причиной до 40% случаев туберкулеза легких.[2] Симптомы инфекции напоминают симптомы М. туберкулез.
Он является членом Комплекс микобактерий туберкулеза.[3]
Таксономия
Есть семь основных линий передачи Комплекс микобактерий туберкулеза (MTBC), с линиями 5 и 6, классифицированными как Mycobacterium africanum. Линия 5 MTBC М. africanum тип 1, западноафриканский 1 (MAF1), и классифицируется на основе характерной делеции региона дифференциации (RD) 711. MAF1 обычно встречается в районе Гвинейского залива. Линия MTBC 6 также известна как М. africanum тип 1, западноафриканский 2 (MAF2), и классифицируется на основе делеции RD702. MAF2 распространен в Западной Африке. М. africanum тип 2, восточноафриканский, ранее считался штаммом Mycobacterium africanum; недавно он был реклассифицирован как Микобактерии туберкулеза генотип «Уганда» в подлинии линии MTBC 4.[4]
История
М. africanum был впервые описан как подвид в пределах MTBC с фенотипическими характеристиками, промежуточными между М. туберкулез и М. bovis, основанный на биохимическом исследовании Castets в 1968 году. Ранний генетический анализ показал, что он отличался от М. туберкулез из-за геномной делеции RD9 и различных GyrB нуклеотидной последовательности и отличается от M. bovis из-за интактных RD12 и RD4.[5]
Микробиология
М. africanum растет в среде, содержащей пируват, в условиях низкого содержания кислорода и образует характерные «дисгонические» колонии. В отличие от М. туберкулез, М. africanum проявляет каталазную активность, является нитрат-отрицательным и чувствителен к гидразиду тиопен-2-карбоновой кислоты (TCH) и пиразинамиду (PZA). М. africanum также растет медленнее, чем М. туберкулез, обычно на развитие колоний уходит 10 недель, а не от 3 до 4 для М. туберкулез.[6]
Эпидемиология
М. africanum чаще всего встречается в странах Западной Африки.[7] Это инфекция только у людей, которая передается воздушно-капельным путем от людей с открытыми случаями заболевания.
Не совсем понятно, почему распределение М. africanum ограничивается Западной Африкой, и лишь единичные случаи обнаруживаются в других регионах.[8] Филогенетические данные показывают, что М. africanum на ранней стадии ответвления от современных линий Mtb в Америке, Европе и Азии. Некоторые исследования показывают, что М. africanum адаптирован для населения Западной Африки. М. africanum могут уступить место другим линиям Mtb в других регионах; однако генетические исследования не обнаружили разницы в количестве генов вирулентности или генетическом разнообразии между М. туберкулез и М. africanum. Резервуаров животных для Mycobacterium africanum несмотря на то, что были обнаружены различные дикие животные.[9]
Он имеет такую же степень заразности, что и обычный М. туберкулез организма, но вероятность развития клинического заболевания у иммунокомпетентного человека менее высока.[10] Тем не мение, М. africanum с большей вероятностью перейдет от инфекции к заболеванию у ВИЧ-инфицированного пациента. В странах, где М. africanum эндемичен, он представляет собой важный оппортунистическая инфекция более поздних стадий заболевания ВИЧ.[11]
Патогенез
Не совсем понятно, как генетические различия между М. africanum и М. туберкулез вызывают более низкую патогенность первых. Однако известно, что область различия 9 (RD9) отсутствует в М. africanum но присутствует в М. туберкулез.[12]
М. africanum также имеет заметные различия в катаболизме и метаболизме липидов. Кроме того, пути вирулентности, такие как регулон dosR / Rv0081 или регуляция ESAT-6, нарушаются в М. africanum.[13]
Уход
Из-за схожих симптомов и разных условий роста между Микобактерии туберкулеза и africanum, методы посева не позволяют поставить диагноз. Генотипирование на основе молекулярной биологии улучшило идентификацию. В частности, «сполиготипирование» или «типирование спейсерного олигонуклеотида» представляет собой основанный на быстрой полимеразной цепной реакции метод генотипирования штаммов в MTBC. Недавно были разработаны экспресс-тесты бокового кровотока на основе антигена mpt64, обнаруженного у всех членов MTBC.[14]
М. africanum имеет более низкую скорость прогрессирования от латентного периода к активной болезни, чем М. туберкулез. М. africanum туберкулез лечится по той же схеме, что и туберкулез, вызванный М. туберкулез. Общая скорость излечения аналогична, но чем больше М. africanum пациенты, вероятно, будут ВИЧ-положительными, у них может быть более высокая смертность от других заболеваний, связанных с ВИЧ.[15]
Тип штамма
ATCC 25420 = CIP 105147
Рекомендации
- ^ Кастеты, М .; Rist, N .; Бойсверт, Х. (1969). "La varété africaine du bacille tuberculeux humain". Médecine d'Afrique Noire. 16: 321–2.
- ^ де Йонг, В .; Антонио, М .; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum - Обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке». PLOS забытые тропические болезни. 4 (9): e744. Дои:10.1371 / journal.pntd.0000744. ЧВК 2946903. PMID 20927191.
- ^ Vasconcellos SE, Huard RC, Niemann S и др. (2010). "Отличные генотипические профили двух основных кладов Mycobacterium africanum". BMC Infect. Dis. 10: 80. Дои:10.1186/1471-2334-10-80. ЧВК 2859774. PMID 20350321.
- ^ де Йонг, В .; Антонио, М .; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum - Обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке». PLOS забытые тропические болезни. 4 (9): e744. Дои:10.1371 / journal.pntd.0000744. ЧВК 2946903. PMID 20927191.
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость комплекса Mycobacterium tuberculosis: ее роль в биологии, эпидемиологии и контроле. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019. Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. Дои:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632.
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость комплекса Mycobacterium tuberculosis: ее роль в биологии, эпидемиологии и контроле. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019. Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. Дои:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632.
- ^ де Йонг, В .; Антонио, М .; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum - Обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке». PLOS забытые тропические болезни. 4 (9): e744. Дои:10.1371 / journal.pntd.0000744. ЧВК 2946903. PMID 20927191.
- ^ де Йонг, В .; Антонио, М .; Ганье, С. (28 сентября 2010 г.). «Mycobacterium africanum - Обзор важной причины туберкулеза человека в Западной Африке». PLOS забытые тропические болезни. 4 (9): e744. Дои:10.1371 / journal.pntd.0000744. ЧВК 2946903. PMID 20927191.
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость комплекса Mycobacterium tuberculosis: ее роль в биологии, эпидемиологии и контроле. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019. Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. Дои:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632.
- ^ де Йонг, В .; Hill, P .; Aiken, A .; Awine, T .; Мартин, А .; Adetifa, I .; Jackson-Sillah, D .; Fox, A .; DeRiemer, K .; Gagneux, S .; Borgdorff, M .; McAdam, K .; Corrah, T .; Small, P .; Адегбола Р. (2008). «Развитие активного туберкулеза, но не передача, зависит от линии Mycobacterium tuberculosis в Гамбии». Журнал инфекционных болезней. 198 (7): 1037–1043. Дои:10.1086/591504. ЧВК 2597014. PMID 18702608.
- ^ де Йонг, В .; Hill, P .; Brookes, R .; Otu, J .; Петерсон, К .; Small, P .; Адегбола Р. (14 октября 2005 г.). «Mycobacterium africanum: новый условно-патогенный микроорганизм при ВИЧ-инфекции?». СПИД. 19 (15): 1714–1715. Дои:10.1097 / 01.aids.0000185991.54595.41. PMID 16184053.
- ^ Брош Р., Гордон С.В., Мармисс М. и др. (Март 2002 г.). "Новый эволюционный сценарий для Микобактерии туберкулеза сложный". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (6): 3684–9. Bibcode:2002PNAS ... 99.3684B. Дои:10.1073 / pnas.052548299. ЧВК 122584. PMID 11891304.
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость комплекса Mycobacterium tuberculosis: ее роль в биологии, эпидемиологии и контроле. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019. Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. Дои:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632.
- ^ Йебоа-Ману, Дороти; de Jong, Bouke C .; Гере, Флориан (2017). «Биология и эпидемиология Mycobacterium africanum». В Себастьяне Ганье (ред.). Штаммовая изменчивость комплекса Mycobacterium tuberculosis: ее роль в биологии, эпидемиологии и контроле. Успехи экспериментальной медицины и биологии. 1019. Чам: Издательство Springer International. С. 117–133. Дои:10.1007/978-3-319-64371-7_6. ISBN 978-3-319-64371-7. PMID 29116632.
- ^ де Йонг, В .; Hill, P .; Brookes, R .; Otu, J .; Петерсон, К .; Small, P .; Адегбола Р. (14 октября 2005 г.). «Mycobacterium africanum: новый условно-патогенный микроорганизм при ВИЧ-инфекции?». СПИД. 19 (15): 1714–1715. Дои:10.1097 / 01.aids.0000185991.54595.41. PMID 16184053.
Библиография
- Скерман, В.Б.Д .; McGowan, V .; Снит, P.H.A. (Январь 1980 г.). «Утвержденные списки бактериальных названий». Int. J. Syst. Бактериол. 30 (1): 225–420. Дои:10.1099/00207713-30-1-225.
внешняя ссылка
- «Mycobacterium africanum». Браузер таксономии NCBI. 33894.
- Типовой штамм Mycobacterium africanum в BacНырять - База метаданных по бактериальному разнообразию