NSFL1C - NSFL1C

NSFL1C
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1SS6
Идентификаторы
Псевдонимы	NSFL1C, P47, UBX1, UBXD10, UBXN2C, dJ776F14.1, кофактор NSFL1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606610 MGI: 3042273 ГомолоГен: 41114 Генные карты: NSFL1C
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20p13 Начните 1,442,162 бп[1] Конец 1,473,842 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 G3 Начните 151,494,182 бп[2] Конец 151,511,414 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание липидов • связывание убиквитина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфолипидов • активность регулятора протеинфосфатазы • Связывание АТФазы Сотовый компонент • Стек Гольджи • клеточная мембрана • аппарат Гольджи • цитоскелет промежуточных филаментов • Комплекс VCP-NSFL1C • ядро клетки • нуклеоплазма • хромосома • цитозоль • центросома полюса веретена • цитоплазма • центр организации микротрубочек • цитоскелет Биологический процесс • Липидный бислой слияния • повторная сборка ядерной оболочки • Организация Гольджи • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • сборка аутофагосом • регуляция активности фосфопротеинфосфатазы • установление ориентации митотического веретена • положительная регуляция разделения митотических центросом • отрицательная регуляция локализации белка на центросоме Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	55968	386649
Ансамбль	ENSG00000088833	ENSMUSG00000027455
UniProt	Q9UNZ2	Q9CZ44
RefSeq (мРНК)	NM_001206736 NM_016143 NM_018839 NM_182483	NM_001291074 NM_198326
RefSeq (белок)	NP_001193665 NP_057227 NP_061327	NP_001278003 NP_938085
Расположение (UCSC)	Chr 20: 1.44 - 1.47 Мб	Chr 2: 151,49 - 151,51 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

NSFL1 кофактор p47 это белок что у людей кодируется NSFL1C ген.^[5][6]

N-этилмалеимид-чувствительный фактор (NSF) и валозин-содержащий белок (p97) - это две АТФазы, которые, как известно, участвуют в слиянии транспортных пузырьков и мембран-мишеней и слияниях между мембранными компартментами. Тример белка, кодируемого этим геном, связывает гексамер цитозольного p97 и необходим для p97-опосредованного возобновления роста цистерн Гольджи из митотических фрагментов Гольджи. Для этого гена было обнаружено множество вариантов транскриптов, кодирующих несколько различных изоформ.^[6]

Взаимодействия

NSFL1C был показан взаимодействовать с участием Валозин-содержащий белок.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000088833 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027455 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (ноябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гемопоэтических стволовых / клетках-предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
6. «Ген Энтреза: NSFL1C NSFL1 (p97) кофактор (p47)».
7. Учияма, Кейджи; Йокитало Эйджа; Линдман Мерви; Джекман Марк; Кано Фуми; Мурата Масаюки; Чжан Сяодун; Кондо Хисао (июнь 2003 г.). «Локализация и фосфорилирование p47 важны для разборки-сборки по Гольджи во время клеточного цикла». J. Cell Biol. Соединенные Штаты. 161 (6): 1067–79. Дои:10.1083 / jcb.200303048. ISSN  0021-9525. ЧВК  2173005. PMID  12810701.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Кондо Х., Рабуй С., Ньюман Р. и др. (1997). «p47 представляет собой кофактор p97-опосредованного слияния мембран». Природа. 388 (6637): 75–8. Дои:10.1038/40411. PMID  9214505. S2CID  32646222.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Rabouille C, Kondo H, Newman R, et al. (1998). «Синтаксин 5 является общим компонентом опосредованных NSF и p97 путей повторной сборки цистерн Гольджи из митотических фрагментов Гольджи in vitro». Ячейка. 92 (5): 603–10. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81128-9. PMID  9506515. S2CID  17285800.
• Ху RM, Хан ZG, Song HD и др. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Bibcode:2000PNAS ... 97.9543H. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Bibcode:2001Натура.414..865D. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Мейер HH, Ван Y, Уоррен G (2002). «Прямое связывание конъюгатов убиквитина адапторными комплексами p97 млекопитающих, p47 и Ufd1 – Npl4». EMBO J. 21 (21): 5645–52. Дои:10.1093 / emboj / cdf579. ЧВК  131076. PMID  12411482.
• Учияма К., Джокитало Э., Кано Ф. и др. (2003). «VCIP135, новый важный фактор для p97 / p47-опосредованного слияния мембран, необходим для сборки Гольджи и ER in vivo». J. Cell Biol. 159 (5): 855–66. Дои:10.1083 / jcb.200208112. ЧВК  2173386. PMID  12473691.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Нагахама М., Сузуки М., Хамада Ю. и др. (2003). "SVIP представляет собой новый белок, взаимодействующий с VCP / p97, экспрессия которого вызывает клеточную вакуолизацию". Мол. Биол. Ячейка. 14 (1): 262–73. Дои:10.1091 / mbc.02-07-0115. ЧВК  140243. PMID  12529442.
• Учияма К., Джокитало Э., Линдман М. и др. (2003). «Локализация и фосфорилирование p47 важны для разборки-сборки по Гольджи во время клеточного цикла». J. Cell Biol. 161 (6): 1067–79. Дои:10.1083 / jcb.200303048. ЧВК  2173005. PMID  12810701.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.