Транспортеры NicO - NicO transporters

В Семейство транспортеров никеля / кобальта (NicO) (TC № 2.A.113 ) является членом Суперсемейство экспортеров лизина (LysE).^[1] Репрезентативный список белков, принадлежащих к семейству NicO, можно найти в База данных классификации транспортеров.^[2]

Гомология

Гомологи семейства NicO имеют разные прогнозируемые топологии: 6, 7 и 8 TMS. Один из таких гомологов, RcnA (YohM; ТК № 2.A.113.1.1 ) из Кишечная палочка (274 aas) имеет 6 предполагаемых трансмембранных сегментов (TMS) в расположении 3 + 3 с большой гидрофильной петлей между предполагаемыми TMS 3 и 4.^[3] Несколько гомологов RcnA (например, гомолог RcnA из Ralstonia solanacearum; ТК № 2.A.113.1.3; CAD17703) имеют 7 предполагаемых TMS (4 + 3). Еще один гомолог, UreH из Methanocaldococcus janaschii (ТК № 2.A.113.1.4 ) имеет 6 предполагаемых TMS в более характерной схеме 3 + 3 TMS. Семья NicO в LysE суперсемейство может иметь общее происхождение с TOG суперсемейство, потеряв TMS 1 и 4 в топологии суперсемейства 8 TMS TOG.^[2]

Функция

Считается, что этот белок катализирует Co²⁺ и Ni²⁺ отток.^[3]

Общая реакция, катализируемая белками семейства NicO, вероятно:

[Ni²⁺ или Co²⁺] (дюйм) → [Ni²⁺ или Co²⁺] (из).

Смотрите также

• Семья NiCoT, семейство переносчиков никеля / кобальта в суперсемействе TOG
• Никель
• Кобальт
• База данных классификации транспортеров
• Транспортный белок

дальнейшее чтение

• Ивиг, Джеффри С .; Роу, Джессика Л .; Чиверс, Питер Т. (01.10.2006). «Гомеостаз никеля в Escherichia coli - путь оттока rcnR-rcnA и его связь с функцией NikR». Молекулярная микробиология 62 (1): 252–262.Дои:10.1111 / j.1365-2958.2006.05369.x. ISSN  1365-2958.
• Марреро, Жаннетт; Аулинг, Георг; Кото, Орхидея; Нис, Дитрих Х. (1 января 2007 г.). «Устойчивость к высокому уровню кобальта и никеля, но, вероятно, отсутствие оттока через оболочку: устойчивость к металлам у кубинского штамма Serratia marcescens C-1». Микробная экология 53 (1): 123–133. Дои:10.1007 / s00248-006-9152-7. ISSN  0095-3628. PMID  17186148.
• Протченко Ольга; Родригес-Суарес, Роберто; Андрофи, Рэйчел; Бусси, Ховард; Филпотт, Кэролайн К. (28 июля 2006 г.). «Скрининг генов поглощения гема определяет семейство FLC, необходимое для импорта FAD в эндоплазматический ретикулум». Журнал биологической химии 281 (30): 21445–21457.Дои:10.1074 / jbc.M512812200. ISSN  0021-9258.PMID  16717099.

Рекомендации

1. Цу, Брайан В .; Сайер, Милтон Х. (01.01.2015). «Суперсемейство LysE транспортных белков, участвующих в физиологии и патогенезе клетки». PLOS ONE. 10 (10): e0137184. Bibcode:2015PLoSO..1037184T. Дои:10.1371 / journal.pone.0137184. ISSN  1932-6203. ЧВК  4608589. PMID  26474485.
2. "Семья транспортеров никеля / кобальта (NicO)". База данных классификации транспортеров. Получено 2016-02-29.
3. Родрига, Аньес; Эффантин, Жеральдин; Мандран-Бертело, Мари-Андре (2005-04-15). «Идентификация rcnA (yohM), гена устойчивости к никелю и кобальту в Escherichia coli». Журнал бактериологии. 187 (8): 2912–2916. Дои:10.1128 / JB.187.8.2912-2916.2005. ISSN  0021-9193. ЧВК  1070376. PMID  15805538.