Экспортер лизина - Lysine exporter - Wikipedia
| D- и L-лизин, экспортер гистидина и аргинина (LysE) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | LysE, он же CGL1262 | ||||||||
| Pfam | PF01810 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR001123 | ||||||||
| TCDB | 2.A.75 | ||||||||
| OPM суперсемейство | 248 | ||||||||
| Белок OPM | 2n4x | ||||||||
| |||||||||
Экспортеры лизина площадь надсемейство из трансмембранные белки [1][2] какой экспорт аминокислоты, липиды и тяжелый металл ионы.[2] Они обеспечивают ионный гомеостаз, сыграйте роль в клеточная оболочка сборки и защиты от чрезмерной концентрации тяжелых металлов в цитоплазма. Надсемейство было названо на основании раннего открытия Белок-носитель LysE из Коринебактерии глутамикум.
Семьи
2.A.75 - Семейство экспортеров L-лизина (LysE)
2.A.76 - Устойчивость к семейству гомосерин / треонин (RhtB)
2.A.77 - Семейство устойчивости к кадмию (CadD)
2.A.95 - Семейство переносчиков нейтральных аминокислот (NAAT) 6TMS
2.A.106 - CA2+:ЧАС+ Семейство антипортеров-2 (CaCA2)
2.A.107 - Mn2+ Семья экспортеров (MntP)
2.A.108 - Семейство железных / свинцовых транспортеров (ILT)
2.A.109 - Семейство сопротивлений к теллуру и ионам (TerC)
2.A.113 - Семейство транспортеров никеля и кобальта (NicO)
2.A.116 - Семейство пептидогликолипидных белков (GAP)
5.A.1 - Семейство оксидоредуктазы D с дисульфидной связью (DsbD)
Семья LysE
Два члена семейства LysE (LysE of Коринебактерии глутамикум (ТК № 2.A.75.1.1 ) и ArgO из Кишечная палочка) были функционально охарактеризованы, но функционально не охарактеризованные гомологи закодированы в геномах многих бактерий, включая Bacillus subtilis, Микобактерии туберкулеза, Aeromonas salmonicida, Helicobacter pylori, Холерный вибрион и Yersinia pestis. Таким образом, члены семейства LysE широко распространены в Грамотрицательный и Грамположительные бактерии.
Структура
Эти белки имеют длину 190-240 аминокислотных остатков и шесть гидрофобных участков. PhoA-анализ слияния LysE C. glutamicum предоставили доказательства 5 типологии трансмембранного α-спирального гаечного ключа (TMS) с N-концом внутри и C-концом снаружи.[3] Однако некоторые данные свидетельствуют о топологии 6 TMS.[4]
Функция
LysE, по-видимому, катализирует однонаправленный отток L-лизина (и других основных аминокислот, таких как L-аргинин) и обеспечивает единственный путь выведения L-лизина. Источником энергии считается движущая сила протона (H+ антипорт). В Кишечная палочка Гомолог ArgO (ТК № 2.A.75.1.2 ) истечения аргинин и возможно лизин и канаванин также.[5]
Ранние исследования показали, что семейство LysE связано с семейством RhtB (TC № 2.A.76 ), а также семейство CadD (ТК № 2.A.77 ), основываясь как на схожих размерах и топологиях их членов, так и на результатах PSI-BLAST.[3]
Обобщенная транспортная реакция
Обобщенная транспортная реакция для LysE:
Лизин (в) + [нГн+ (out) или nOH− (вход)] Лизин (ушел) + [нГн+ (in) или nOH− (из)].
Рекомендации
Эта статья включает текст доступно под CC BY 4.0 лицензия.
- ^ Vrljic M, Garg J, Bellmann A, Wachi S, Freudl R, Malecki MJ, Sahm H, Kozina VJ, Eggeling L, Saier MH, Eggeling L, Saier MH (ноябрь 1999 г.). «Суперсемейство LysE: топология экспортера лизина LysE из Corynebacterium glutamicum, парадима нового суперсемейства трансмембранных транслокаторов растворенных веществ». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии. 1 (2): 327–36. PMID 10943564.
- ^ а б Tsu BV, Saier MH (01.01.2015). «Суперсемейство LysE транспортных белков, участвующих в физиологии и патогенезе клетки». PLOS ONE. 10 (10): e0137184. Bibcode:2015PLoSO..1037184T. Дои:10.1371 / journal.pone.0137184. ЧВК 4608589. PMID 26474485.
- ^ а б Vrljic M, Sahm H, Eggeling L (декабрь 1996 г.). «Новый тип транспортера с новым типом клеточной функции: экспорт L-лизина из Corynebacterium glutamicum». Молекулярная микробиология. 22 (5): 815–26. Дои:10.1046 / j.1365-2958.1996.01527.x. PMID 8971704. S2CID 26112791.
- ^ Saier, MH Jr. "2.A.75 Семейство экспортеров L-лизина (LysE)". База данных классификации транспортеров. Группа компаний Saier Lab Bioinformatics / SDSC.
- ^ Nandineni MR, Gowrishankar J (июнь 2004 г.). «Доказательства экспортера аргинина, кодируемого yggA (argO), который регулируется регулятором транскрипции LysR-типа ArgP в Escherichia coli». Журнал бактериологии. 186 (11): 3539–46. Дои:10.1128 / JB.186.11.3539-3546.2004. ЧВК 415761. PMID 15150242.
