Ортонаировирус - Orthonairovirus

Ортонаировирус
Vir001485-f1.gif
ONSR.Nairo.Fig2.v3 WEB Dugbe virus.png
Ортонаировирус Крымско-Конго геморрагической лихорадки вирион и геном
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Негарнавирикота
Класс:Ellioviricetes
Заказ:Буньявиралес
Семья:Nairoviridae
Род:Ортонаировирус
Типовой вид
Дугбе ортонаировирус

Ортонаировирус это род в семье Nairoviridae порядка Буньявиралес которые включают вирусы с циркулярным, одноцепочечная РНК с отрицательным смыслом. Он получил свое название от болезни овец Найроби, поражающей желудочно-кишечный тракт овец и коз.[2] Подавляющее большинство, а возможно, и все вирусы этого рода являются клещевые вирусы которые могут иметь хозяина - человека или других позвоночных.[3]

Структура

В вирионы для вирусов этого рода имеют сферическую форму.[4] Их размер составляет примерно 80–120 нм в диаметре, причем 50% их веса приходится на белки, а 20–30% - на липиды.[5] Рибонуклеокапсид представляет собой нитевидную форму, имеющую длину около 200–300 нм и ширину около 2–2,5 нм.[5]

Эти нуклеокапсиды окружены единой оболочкой, которая имеет выступы из гликопротеинов, выступающих из ее поверхности. Эти выступы равномерно покрывают поверхность вириона и имеют длину около 5–10 нм.[5] Они помогают прикрепиться к рецептору хозяина в репликация.

Геном

Вирус крымско-конголезской геморрагической лихорадки (CCHFV) геном

Геномы наировирусов отрицательный смысл, одноцепочечная РНК. Полный геном составляет примерно 17 100–22 800 нуклеотиды длинный и делится на три сегмента: большой, средний и маленький.[3] Большой сегмент имеет длину около 11000–14400 нуклеотидов (11–14,4 т.п.н.) и кодирует вирусную полимеразу.[5][4] Средний сегмент имеет длину около 4400–6300 нуклеотидов (4,4–6,3 т.п.н.) и кодирует гликопротеины G¬n и Gc.[5][4] Небольшой сегмент составляет около 1700-2100 нуклеотидов (1,7-2,1 т.п.н.), и он кодирует нуклеокапсид белок.[3][5][4]

Геном имеет на конце повторяющиеся последовательности, причем последовательности повторяются на обоих концах. Концевые нуклеотиды образуют пары оснований, нековалентно замкнуты, кольцевая РНК.[5] Оба конца 5 ’и 3’ имеют консервативные области длиной 9 нуклеотидов. Последовательности: 5-й: UCUCAAAGA и 3-й: AGAGUUUCU.[5]

Репликация

Жизненный цикл наировируса

Наировирусы прикрепляются к рецептору хозяина с помощью димера гликопротеина Gn-Gc.[4] Тогда вирус эндоцитозированный в клетку-хозяин через везикул. Сегменты рибонуклеокапсида высвобождаются в цитоплазма, начиная транскрипция.[4] Транскрипция и репликация происходят внутри клетки, и вновь синтезированные вирионы высвобождаются подающий надежды.

Передача и распространение

Члены этого вирусного рода заражают множество разных позвоночное животное хозяева, и передаются в виде тиков.[5]

Представители рода Nairovirus можно найти во всем мире, где бы они ни находились. членистоногие переносчики и позвоночные хозяева встречаются вместе.[4]

Клиническое значение

На сегодняшний день только четыре вируса этого рода признаны патогенами человека:

  • Вирус крымско-конголезской геморрагической лихорадки
  • Вирус Дугбе
  • Вирус Найробийской болезни овец
  • Kasokero вирус.

Пятый - вирус Эрве - также может быть патогенным для человека.

Эволюция

Филогенетический анализ показал, что эти вирусы делятся на две основные монофилетические группы: твердые (Иксодовые ) и мягкий (Аргасиды ) тик-векторные группы.[6] По ископаемым и филогенетическим данным расхождение между твердыми и мягкими клещами 120 миллион лет назад и 92 миллион лет назад. Это говорит о том, что наировирусы были связаны с этими клещами более 100 миллионов лет.

Кроме того, наировирусы, переносимые клещами из родов Аргас, Кариос и Орнитодорос образуют три отдельных монофилетических клона, что снова подтверждает предположение о совместном видении вируса хозяина.

Серогруппы твердотельных клещей:

  • Крымско-Конго геморрагическая лихорадка
  • Найробийская болезнь овец
  • Сахалин
  • Тамды

Серогруппы клещей с мягким телом:

  • Хьюз
  • Дера Гази Хан
  • Калюб

Переносчики клещей для серогрупп Kasokero и Thiafora в настоящее время не известны.

Таксономия

Ортонаировирус найробийской болезни овец (NSD) - вирус-прототип этого рода.[3][7] NSD обнаружен в Восточной и Центральной Африке и вызывает острый геморрагический гастроэнтерит у овец и коз. Род насчитывает 15 видов:

Серогруппы

Род делится как минимум на девять серогруппы. Серогруппы Хьюза и Сахалина являются родственными группами. Внутри каждой серогруппы имеется ряд связанных вирусов:

Крымско-Конго серогруппа геморрагической лихорадки

Вирус крымско-конголезской геморрагической лихорадки
Вирус Хазара
Вирус тофла

Серогруппа Дера Гази Хан

Вирус Абу Хаммада
Вирус Абу-Мина

Серогруппа Хьюза:

Каспий вирус
Фараллон вирус
Вирус Хьюза
Вирус острова Тупик
Вирус Пунте Салинас
Вирус Раза
Вирус Сольдадо
Вирус Zirqa

Kasokero серогруппа

Kasokero вирус
Вирус Leopards Hill
Вирус йога

Найробийская серогруппа болезни овец

Вирус Дугбе
Вирус Ганджама
Вирус Купе
Вирус Найробийской болезни овец

Калюб серогруппа

Вирус бандии
Chim вирус
Вирус герани
Калюб вирус

Сахалинская серогруппа

Вирус Авалон
Парамушир вирус
Сахалинский вирус
Вирус тилламук

Тамди серогруппа

Бурана вирус
Вирус Тамди

Тиафора серогруппа

Вирус Эрве
Вирус тиафора

Неклассифицированный

Вирус Ахуна
Вирус Арташат
Бурана вирус
Вирус Госсаса
Иссык-Кульский вирус
Кетера вирус
Вирус Южного залива
Вирус Тамди
Вирус Узун Агач

Рекомендации

  1. ^ Таксономия вирусов: выпуск 2018 г., EC 50, Вашингтон, округ Колумбия, июль 2018 г., ратификация электронной почты, октябрь 2018 г. (MSL № 33) https://talk.ictvonline.org/taxonomy/
  2. ^ "Девятый отчет ICTV (2011 г.) Bunyaviridae" (HTML). Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Получено 31 января 2019. Найро: болезнь овец из Найроби, первое зарегистрированное заболевание, вызванное вирусом-участником.
  3. ^ а б c d Крэбтри, Мэри Б., Розмари Санг и Барри Р. Миллер. «Вирус Купе, новый вирус в семействе Bunyaviridae, род Nairovirus, Кения». Новые инфекционные заболевания 15 (2009): 147–54.
  4. ^ а б c d е ж грамм «Наировирус». Наировирус. Вирусная зона. <http://www.expasy.ch/viralzone/all_by_species/251.html >.
  5. ^ а б c d е ж грамм час я Бюхен-Осмонд, Корнелия. «00.011.0.03. Наировирус». ICTVdb Описание вирусов. 25 апреля 2006 г. Международный комитет по таксономии вирусов. 17 апреля 2009 г. <http://phene.cpmc.columbia.edu/ICTVdB/00.011.0.03.htm В архиве 2008-09-05 на Wayback Machine >.
  6. ^ Honig JE, Osborne JC, Nichol ST (2004) Высокая генетическая изменчивость вирусов рода Nairovirus отражает разнообразие их преобладающих клещей-хозяев. Вирусология 318 (1): 10-16
  7. ^ Клеркс, Джон П.М., Хорди Казальс, и Дэвид Х.Л. Бишоп. «Структурные характеристики найровирусов (род Nairovirus, Bunyaviridae)». Журнал общей вирусологии 55 (1981): 165–78.

внешняя ссылка