PAIP1 - PAIP1

PAIP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1JH4, 3NTW, 3RK6
Идентификаторы
Псевдонимы	PAIP1, поли (A) связывающий белок, взаимодействующий с белком 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605184 MGI: 2384993 ГомолоГен: 4709 Генные карты: PAIP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5п12 Начинать 43,526,267 бп[1] Конец 43,557,758 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 D2.3 Начинать 119,428,601 бп[2] Конец 119,458,218 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • активность активатора перевода • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • трансляционная инициация • стабилизация мРНК • регулирование перевода • положительное регулирование перевода • регулирование инициации трансляции Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10605	218693
Ансамбль	ENSG00000172239	ENSMUSG00000025451
UniProt	Q9H074	Q8VE62
RefSeq (мРНК)	NM_006451 NM_182789 NM_183323	NM_001079849 NM_145457
RefSeq (белок)	NP_006442 NP_877590 NP_899152	NP_001073318 NP_663432
Расположение (UCSC)	Chr 5: 43,53 - 43,56 Мб	Chr 13: 119.43 - 119.46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Полиаденилат-связывающий белок, взаимодействующий с белком 1 это белок что у людей кодируется PAIP1 ген.^[5][6][7]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, взаимодействует с поли (A) -связывающим белком и с кэп-связывающим комплексом eIF4A. Он участвует в инициации трансляции и биосинтезе белка. Сверхэкспрессия этого гена в клетках COS7 стимулирует трансляцию. В этом локусе происходит альтернативный сплайсинг, и были идентифицированы три варианта транскрипта, кодирующие три различные изоформы.^[7]

Взаимодействия

PAIP1 был показан взаимодействовать с PABPC1.^[5][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000172239 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025451 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Craig AW, Haghighat A, Yu AT, Sonenberg N (апрель 1998 г.). «Взаимодействие полиаденилат-связывающего белка с гомологом eIF4G PAIP усиливает трансляцию». Природа. 392 (6675): 520–3. Дои:10.1038/33198. PMID  9548260. S2CID  10891925.
6. Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
7. «Ген Entrez: белок 1, связывающий поли (A) связывающий белок PAIP1».
8. Рой Дж., Де Крещенцо Дж., Халегпур К., Каведжян А., О'Коннор-МакКорт М., Соненберг Н. (июнь 2002 г.). «Paip1 взаимодействует с поли (A) связывающим белком через два независимых связывающих мотива». Мол. Клетка. Биол. 22 (11): 3769–82. Дои:10.1128 / MCB.22.11.3769-3782.2002. ЧВК  133836. PMID  11997512.

дальнейшее чтение

• Грей Н.К., Коллер Дж. М., Диксон К. С., Викенс М. (2000). «Множественные части поли (А) -связывающего белка стимулируют трансляцию in vivo». EMBO J. 19 (17): 4723–33. Дои:10.1093 / emboj / 19.17.4723. ЧВК  302064. PMID  10970864.
• Гроссет С., Чен С.Й., Сюй Н., Соненберг Н., Жакмен-Саблон Х., Шю А.Б. (2000). «Механизм трансляционного обмена мРНК: взаимодействие между поли (А) хвостом и детерминантой, кодирующей РНК c-fos через белковый комплекс». Клетка. 103 (1): 29–40. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00102-1. PMID  11051545. S2CID  18135412.
• Khaleghpour K, Свиткин YV, Крейг AW, DeMaria CT, Deo RC, Burley SK, Sonenberg N (2001). «Репрессия трансляции новым партнером человеческого поли (A) связывающего белка, Paip2». Мол. Клетка. 7 (1): 205–16. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00168-X. PMID  11172725.
• Deo RC, Зоненберг Н., Берли СК (2001). «Рентгеновская структура белка гиперпластических дисков человека: ортолог С-концевого домена поли (А) -связывающего белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (8): 4414–9. Дои:10.1073 / pnas.071552198. ЧВК  31849. PMID  11287654.
• Рой Дж., Де Крещенцо Дж., Халегпур К., Каведжян А., О'Коннор-Маккорт М., Соненберг Н. (2002). «Paip1 взаимодействует с поли (A) связывающим белком через два независимых связывающих мотива». Мол. Клетка. Биол. 22 (11): 3769–82. Дои:10.1128 / MCB.22.11.3769-3782.2002. ЧВК  133836. PMID  11997512.
• Фортна А, Ким И, Макларен Э, Маршалл К., Хан Дж., Мелтесен Л., Брентон М., Хинк Р., Бургерс С., Эрнандес-Буссард Т., Каримпур-Фард А., Глюк Д., МакГавран Л., Берри Р., Поллак Дж., Сикела JM (2004). «Дупликация и потеря генов, специфичных для происхождения, в эволюции человека и великой обезьяны». ПЛОС Биол. 2 (7): E207. Дои:10.1371 / journal.pbio.0020207. ЧВК  449870. PMID  15252450.