PARP2 - PARP2

PARP2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3KCZ, 3 кДж, 4PJV, 4TVJ, 4ZZX, 4ZZY, 5DSY, 5Д5К
Идентификаторы
Псевдонимы	PARP2, ADPRT2, ADPRTL2, ADPRTL3, ARTD2, PARP-2, pADPRT-2, поли (ADP-рибоза) полимераза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607725 MGI: 1341112 ГомолоГен: 4004 Генные карты: PARP2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q11.2 Начинать 20,343,582 бп[1] Конец 20,357,905 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 26,25 см | 14 C1 Начинать 50,807,841 бп[2] Конец 50,821,301 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Активность ДНК-лигазы (АТФ) • трансферазная активность, перенос гликозильных групп • НАД + АДФ-рибозилтрансферазная активность • активность протеина АДФ-рибозилазы • НАД ДНК АДФ-рибозилтрансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • ядрышко • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • Лигирование ДНК, участвующее в репарации ДНК • отстающее удлинение прядей • АДФ-рибозилирование белков • Ремонт ДНК • внешний апоптотический сигнальный путь • базисно-эксцизионная пластика • пептидил-серин АДФ-рибозилирование • положительное регулирование роста клеток, участвующих в развитии клеток сердечной мышцы • отрицательная регуляция гибели нейронов • восстановление двухниточного разрыва • поли-АДФ-рибозилирование белков • АДФ-рибозилирование ДНК • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10038	11546
Ансамбль	ENSG00000129484	ENSMUSG00000036023
UniProt	Q9UGN5	O88554
RefSeq (мРНК)	NM_001042618 NM_005484	NM_009632
RefSeq (белок)	NP_001036083 NP_005475	NP_033762
Расположение (UCSC)	Chr 14: 20.34 - 20.36 Мб	Chr 14: 50,81 - 50,82 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Поли [АДФ-рибоза] полимераза 2 является фермент что у людей кодируется PARP2 ген.^[5][6][7] Это один из PARP семейство ферментов.

Функция

Этот ген кодирует поли (АДФ-рибозил) трансферазу-подобную 2 белок, который содержит каталитический домен и способен катализировать реакцию поли (АДФ-рибозилирования). Этот белок имеет каталитический домен, который гомологичен поли (АДФ-рибозил). трансфераза, но отсутствует N-концевой ДНК-связывающий домен, который активирует C-концевой каталитический домен поли (АДФ-рибозил) трансферазы. Основные остатки в N-концевой области этого белка могут обладать потенциальными ДНК-связывающими свойствами и могут участвовать в ядерный и / или ядрышковый нацеливание на белок. Были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскриптов, кодирующих разные изоформы.^[7]

В виде растений Arabidopsis thaliana, PARP2 играет более значительную роль, чем PARP1, в защитных ответах на повреждение ДНК и бактериальный патогенез.^[8] PARP2 растений несет N-концевые ДНК-связывающие мотивы SAP, а не ДНК-связывающие мотивы Zn-finger белков PARP1 растений и животных.^[8]

Препараты-ингибиторы PARP

Немного Ингибитор PARP противораковые препараты (в первую очередь нацеленные на PARP1) также ингибируют PARP2, например нирапариб.

Взаимодействия

PARP2 был показан взаимодействовать с XRCC1.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000129484 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036023 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Йоханссон М (май 1999 г.). «Семейство генов поли (АДФ-рибозы) полимеразы человека (ADPRTL): клонирование кДНК двух новых гомологов поли (АДФ-рибозы) полимеразы». Геномика. 57 (3): 442–5. Дои:10.1006 / geno.1999.5799. PMID  10329013.
6. Йеламос Дж., Шрайбер В., Данцер Ф. (апрель 2008 г.). «К специфическим функциям поли (АДФ-рибоза) полимеразы-2». Тенденции в молекулярной медицине. 14 (4): 169–78. Дои:10.1016 / j.molmed.2008.02.003. PMID  18353725.
7. «Ген Entrez: семейство поли (АДФ-рибоза) полимераз PARP2, член 2».
8. Сонг Дж., Кепплер Б.Д., Мудрый Р.Р., Бент А.Ф. (май 2015 г.). «PARP2 является преобладающей поли (АДФ-рибозой) полимеразой в повреждении ДНК арабидопсиса и иммунных ответах». PLoS Genetics. 11 (5): e1005200. Дои:10.1371 / journal.pgen.1005200. ЧВК  4423837. PMID  25950582.
9. Schreiber V, Amé JC, Dollé P, Schultz I, Rinaldi B, Fraulob V, Ménissier-de Murcia J, de Murcia G (июнь 2002 г.). «Поли (АДФ-рибоза) полимераза-2 (PARP-2) необходима для эффективной эксцизионной репарации ДНК в сочетании с PARP-1 и XRCC1». Журнал биологической химии. 277 (25): 23028–36. Дои:10.1074 / jbc.M202390200. PMID  11948190.

дальнейшее чтение

• Башфорд К.Л., Шанс Б, Ллойд Д., Пул Р.К. (январь 1980 г.). «Колебания окислительно-восстановительных состояний в синхронно делящихся культурах Acanthamoeba castellanii и Schizosaccharomyces pombe». Биофизический журнал. 29 (1): 1–11. Bibcode:1980BpJ .... 29 .... 1B. Дои:10.1016 / S0006-3495 (80) 85114-9. ЧВК  1328658. PMID  7260241.
• Бергаммер Х., Эбнер М., Маркштайнер Р., Ауэр Б. (апрель 1999 г.). «pADPRT-2: новый ген полимеризующейся (ADP-рибозил) трансферазы млекопитающих, родственный усеченным гомологам pADPRT у растений и Caenorhabditis elegans». Письма FEBS. 449 (2–3): 259–63. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00448-2. PMID  10338144.
• Amé JC, Rolli V, Schreiber V, Niedergang C, Apiou F, Decker P, Muller S, Höger T., Ménissier-de Murcia J, de Murcia G (июнь 1999). «PARP-2, новая поли (АДФ-рибоза) полимераза, зависимая от повреждений ДНК млекопитающих». Журнал биологической химии. 274 (25): 17860–8. Дои:10.1074 / jbc.274.25.17860. PMID  10364231.
• Still IH, Vince P, Cowell JK (декабрь 1999 г.). «Идентификация нового гена (ADPRTL1), кодирующего потенциальный белок поли (ADP-рибозил) трансферазы». Геномика. 62 (3): 533–6. Дои:10.1006 / geno.1999.6024. PMID  10644454.
• Schreiber V, Amé JC, Dollé P, Schultz I, Rinaldi B, Fraulob V, Ménissier-de Murcia J, de Murcia G (июнь 2002 г.). «Поли (АДФ-рибоза) полимераза-2 (PARP-2) необходима для эффективной эксцизионной репарации ДНК в сочетании с PARP-1 и XRCC1». Журнал биологической химии. 277 (25): 23028–36. Дои:10.1074 / jbc.M202390200. PMID  11948190.
• Саксена А., Вонг Л.Х., Калицис П., Эрл Э., Шаффер Л.Г., Чу К.Х. (сентябрь 2002 г.). «Поли (АДФ-рибоза) полимераза 2 локализуется в активных центромерах млекопитающих и взаимодействует с PARP-1, Cenpa, Cenpb и Bub3, но не с Cenpc». Молекулярная генетика человека. 11 (19): 2319–29. Дои:10.1093 / hmg / 11.19.2319. PMID  12217960.
• Маланга М., Althaus FR (февраль 2004 г.). «Поли (АДФ-рибоза) реактивирует застопорившуюся топоизомеразу I ДНК и вызывает повторное запечатывание разрыва цепи ДНК». Журнал биологической химии. 279 (7): 5244–8. Дои:10.1074 / jbc.C300437200. PMID  14699148.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (январь 2006 г. ). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Геномные исследования. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Маэда Y, Хантер TC, Loudy DE, Davé V, Schreiber V, Whitsett JA (апрель 2006 г.). «PARP-2 взаимодействует с TTF-1 и регулирует экспрессию сурфактантного белка-B». Журнал биологической химии. 281 (14): 9600–6. Дои:10.1074 / jbc.M510435200. PMID  16461352.
• Chevanne M, Calia C, Zampieri M, Cecchinelli B, Caldini R, Monti D, Bucci L, Franceschi C, Caiafa P (июнь 2007 г.). «Окислительная репарация повреждений ДНК и экспрессия parp 1 и parp 2 в иммортализованных вирусом Эпштейна-Барра В-лимфоцитах от молодых субъектов, пожилых людей и долгожителей». Исследования омоложения. 10 (2): 191–204. Дои:10.1089 / rej.2006.0514. PMID  17518695.
• Лян Ю.К., Сюй Ц.Й., Яо Ю.Л., Ян В.М. (февраль 2013 г.). «PARP-2 регулирует гены, связанные с клеточным циклом, посредством деацетилирования и метилирования гистонов независимо от поли (АДФ-рибозилирования)». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 431 (1): 58–64. Дои:10.1016 / j.bbrc.2012.12.092. PMID  23291187.
• Сонг Дж., Кепплер Б.Д., Мудрый Р.Р., Бент А.Ф. (май 2015 г.). «PARP2 является преобладающей поли (АДФ-рибозой) полимеразой в повреждении ДНК арабидопсиса и иммунных ответах». PLoS Genetics. 11 (5): e1005200. Дои:10.1371 / journal.pgen.1005200. ЧВК  4423837. PMID  25950582.

внешняя ссылка

• PARP2 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• PARP2 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.