PDLIM7 - PDLIM7

PDLIM7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Q3G
Идентификаторы
Псевдонимы	PDLIM7, LMP1, LMP3, PDZ и LIM домен 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 605903 MGI: 1914649 ГомолоГен: 3980 Генные карты: PDLIM7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q35.3 Начните 177,483,394 бп[1] Конец 177,497,606 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 B1 Начните 55,495,795 бп[2] Конец 55,513,676 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание актина • связывание альфа-актинина в мышцах Сотовый компонент • цитоплазма • взъерошить • цитоскелет • ядро клетки • стрессовое волокно • очаговая адгезия • актиновый цитоскелет • цитозоль • Z диск • нитчатый актин Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • дифференциация клеток • положительная регуляция дифференцировки остеобластов • рецептор-опосредованного эндоцитоза • организация актинового цитоскелета • окостенение • управление аксоном • развитие сердца • развитие мышечной структуры Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9260	67399
Ансамбль	ENSG00000196923	ENSMUSG00000021493
UniProt	Q9NR12	Q3TJD7
RefSeq (мРНК)	NM_005451 NM_203352 NM_203353 NM_213636	NM_001114087 NM_001114088 NM_026131
RefSeq (белок)	NP_005442 NP_976227 NP_998801	NP_001107559 NP_001107560 NP_080407
Расположение (UCSC)	Chr 5: 177,48 - 177,5 Мб	Chr 13: 55,5 - 55,51 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

PDZ и белок домена LIM 7 это белок что у людей кодируется PDLIM7 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является представителем семейства белков, состоящих из консервативных доменов PDZ и LIM. Предполагается, что LIM домены функционируют при узнавании белок-белок в различных контекстах, включая транскрипцию и развитие генов, а также в цитоскелетном взаимодействии. Домены LIM этого белка связываются с протеинкиназами, тогда как домен PDZ связывается с актиновыми филаментами. Продукт гена участвует в сборке комплекса, связанного с актиновыми филаментами, необходимого для передачи митогенного сигнала ret / ptc2. Биологическая функция, вероятно, будет функцией адаптера с доменом PDZ, локализующим LIM-связывающие белки в актиновых филаментах как скелетных мышц, так и немышечных тканей. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множеству вариантов транскриптов.^[6]

Взаимодействия

PDLIM7 был показан взаимодействовать с TPM2.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196923 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021493 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лю Ю., Волос Г.А., Боден С.Д., Виггесварапу М., Титус Л. (март 2002 г.). «Сверхэкспрессированные белки минерализации LIM не требуют доменов LIM для индукции костной ткани». Журнал исследований костей и минералов. 17 (3): 406–14. Дои:10.1359 / jbmr.2002.17.3.406. PMID  11874232. S2CID  26089809.
6. «Ген Entrez: PDLIM7, PDZ и LIM домен 7 (загадка)».
7. Гай PM, Кенни Д.А., Гилл Г.Н. (июнь 1999 г.). «Домен PDZ загадки белка LIM связывается с бета-тропомиозином». Молекулярная биология клетки. 10 (6): 1973–84. Дои:10.1091 / mbc.10.6.1973. ЧВК  25398. PMID  10359609.

дальнейшее чтение

• Бах I (март 2000 г.). «Домен LIM: регулирование ассоциацией». Механизмы развития. 91 (1–2): 5–17. Дои:10.1016 / S0925-4773 (99) 00314-7. PMID  10704826. S2CID  16093470.
• Ву Р.Й., Гилл Г.Н. (октябрь 1994 г.). «Распознавание домена LIM тирозин-содержащего крутого поворота». Журнал биологической химии. 269 (40): 25085–90. PMID  7929196.
• Курода С., Токунага С., Киёхара Ю., Хигучи О, Кониси Н., Мидзуно К. и др. (Декабрь 1996 г.). «Белково-белковое взаимодействие LIM-доменов цинкового пальца с протеинкиназой C». Журнал биологической химии. 271 (49): 31029–32. Дои:10.1074 / jbc.271.49.31029. PMID  8940095.
• Дурик К., Гилл Г. Н., Тейлор С. С. (апрель 1998 г.). «Shc и Enigma оба необходимы для митогенной передачи сигналов Ret / ptc2». Молекулярная и клеточная биология. 18 (4): 2298–308. Дои:10.1128 / mcb.18.4.2298. ЧВК  121481. PMID  9528800.
• Гай PM, Кенни Д.А., Гилл Г.Н. (июнь 1999 г.). «Домен PDZ загадки белка LIM связывается с бета-тропомиозином». Молекулярная биология клетки. 10 (6): 1973–84. Дои:10.1091 / mbc.10.6.1973. ЧВК  25398. PMID  10359609.
• Borrello MG, Mercalli E, Perego C, Degl'Innocenti D, Ghizzoni S, Arighi E, et al. (Август 2002 г.). «Дифференциальное взаимодействие белка Enigma с двумя изоформами RET». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 296 (3): 515–22. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00886-0. PMID  12176011.
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг А.К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005Натура 433 ... 77А. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Сангадала С., Боден С.Д., Виггесварапу М., Лю Й., Титус Л. (июнь 2006 г.). «Минерализующий белок-1 LIM усиливает реакцию костного морфогенетического белка за счет нового взаимодействия с Smurf1, что приводит к снижению убиквитинирования Smads». Журнал биологической химии. 281 (25): 17212–9. Дои:10.1074 / jbc.M511013200. PMID  16611643.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руаль Дж. Ф. и др. (Май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Баррес Р., Гремо Т., Гуаль П., Гонсалес Т., Гугенхайм Дж., Тран А. и др. (Ноябрь 2006 г.). «Enigma взаимодействует с адаптерным белком с доменами PH и SH2, чтобы контролировать индуцированное инсулином ремоделирование актинового цитоскелета и транслокацию транспортера глюкозы 4». Молекулярная эндокринология. 20 (11): 2864–75. Дои:10.1210 / me.2005-0455. ЧВК  1892539. PMID  16803868.