ПОГЗ - POGZ

ПОГЗ
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Э72, 2N3A
Идентификаторы
Псевдонимы	ПОГЗ, ZNF280E, ZNF635, ZNF635m, MRD37, WHSUS, переносимый элемент pogo с доменом ZNF, переносимый элемент pogo, полученный с доменом ZNF
Внешние идентификаторы	OMIM: 614787 MGI: 2442117 ГомолоГен: 9022 Генные карты: ПОГЗ
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.3 Начинать 151,402,724 бп[1] Конец 151,459,494 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F2.1 Начинать 94,837,567 бп[2] Конец 94,882,326 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • Связывание ДНК с последовательностью корового промотора РНК-полимеразы II Сотовый компонент • цитоплазма • хромосома • ядерный хроматин • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • гистон-метилтрансферазный комплекс Биологический процесс • сборка кинетохор • клеточный цикл • митотическое сцепление сестринских хроматид • деление клеток • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция экспрессии генов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23126	229584
Ансамбль	ENSG00000143442	ENSMUSG00000038902
UniProt	Q7Z3K3	Q8BZH4
RefSeq (мРНК)	NM_001194937 NM_001194938 NM_015100 NM_145796 NM_207171	NM_001165948 NM_172683 NM_001368811 NM_001368812
RefSeq (белок)	NP_001181866 NP_001181867 NP_055915 NP_665739 NP_997054	NP_001159420 NP_766271 NP_001355740 NP_001355741
Расположение (UCSC)	Chr 1: 151.4 - 151.46 Мб	Chr 3: 94,84 - 94,88 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Мобильный элемент Pogo с доменом ZNF это белок что у людей кодируется ПОГЗ ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, кажется цинковый палец белок, содержащий транспозаза домен в C-конец.

Было обнаружено, что этот белок взаимодействует с фактором транскрипции. SP1 в дрожжевой двугибридной системе. По крайней мере три альтернативно соединенных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы наблюдались.^[6]

Клиническое значение

Гетерозиготная мутация причин ПОГЗ Синдром Уайта-Саттона.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143442 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038902 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Gunther M, Laithier M, Brison O (декабрь 2000 г.). «Набор белков, взаимодействующих с фактором транскрипции Sp1, идентифицированный в результате двухгибридного скрининга». Mol Cell Biochem. 210 (1–2): 131–42. Дои:10.1023 / А: 1007177623283. PMID  10976766.
6. «Entrez Gene: мобильный элемент POGZ pogo с доменом ZNF».
7. "Запись OMIM - № 616364 - СИНДРОМ БЕЛОГО САТТОНА; WHSUS". www.omim.org. Получено 2018-11-23.

дальнейшее чтение

• Охира М., Морохаши А., Накамура Ю. и др. (2003). «Проект кДНК олигокапирования нейробластомы: к пониманию генезиса и биологии нейробластомы». Рак Lett. 197 (1–2): 63–8. Дои:10.1016 / S0304-3835 (03) 00085-5. PMID  12880961.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.
• Грегори С.Г., Барлоу К.Ф., Маклей К.Э. и др. (2006). «Последовательность ДНК и биологическая аннотация хромосомы 1 человека». Природа. 441 (7091): 315–21. Дои:10.1038 / природа04727. PMID  16710414.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Секи Н., Охира М., Нагасе Т. и др. (1998). «Характеристика клонов кДНК в библиотеках кДНК, фракционированных по размеру, из человеческого мозга». ДНК Res. 4 (5): 345–9. Дои:10.1093 / днарес / 4.5.345. PMID  9455484.