POLR1D - POLR1D

POLR1D
Идентификаторы
Псевдонимы	POLR1D, AC19, POLR1C, RPA16, RPA9, RPAC2, RPC16, RPO1-3, TCS2, субъединица D полимеразы (РНК) I, субъединица D РНК-полимеразы I, РНК-полимераза I и субъединица D III
Внешние идентификаторы	OMIM: 613715 MGI: 108403 ГомолоГен: 22239 Генные карты: POLR1D
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 13 (человек)[1] Группа 13q12.2 Начните 27,620,742 бп[1] Конец 27,744,237 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 G3 Начните 147,077,050 бп[2] Конец 147,111,597 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • активность димеризации белков • Активность РНК-полимеразы III • ДНК-направленная активность 5'-3 'РНК-полимеразы • GO: 0001948 связывание с белками • Активность РНК-полимеразы I Сотовый компонент • цитозоль • нуклеоплазма • ДНК-направленный комплекс РНК-полимеразы I • ДНК-направленный комплекс РНК-полимеразы III • ядро клетки Биологический процесс • прекращение транскрипции РНК-полимеразы I • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • транскрипция, ДНК-шаблон • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы I • положительное регулирование выработки интерферона I типа • транскрипция с промотора РНК-полимеразы III Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	51082	20018
Ансамбль	ENSG00000186184	ENSMUSG00000029642
UniProt	P0DPB5	P97304
RefSeq (мРНК)	NM_001206559 NM_015972 NM_152705 NM_001374407	NM_009087 NM_181730
RefSeq (белок)	NP_001193488 NP_057056 NP_689918 NP_001361336	NP_033113 NP_859419
Расположение (UCSC)	Chr 13: 27,62 - 27,74 Мб	Chr 5: 147.08 - 147.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-направленные РНК-полимеразы I и III субъединицы RPAC2 это белок что у людей кодируется POLR1D ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

POLR1D был показан взаимодействовать с участием POLR1C.^[8][9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000186184 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029642 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (октябрь 2000 г.). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Геномные исследования. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
6. Ху П, Ву С., Сунь Й., Юань СС, Кобаяши Р., Майерс М. П., Эрнандес Н. (ноябрь 2002 г.). «Характеристика человеческой РНК-полимеразы III позволяет определить ортологи субъединиц РНК-полимеразы III Saccharomyces cerevisiae» (PDF). Молекулярная и клеточная биология. 22 (22): 8044–55. Дои:10.1128 / MCB.22.22.8044-8055.2002. ЧВК  134740. PMID  12391170.
7. «Ген Entrez: полипептид D полимеразы (РНК) I POLR1D, 16 кДа».
8. Яо Й, Ямамото К., Ниси Й, Ноги Й, Мурамацу М. (декабрь 1996 г.). «Субъединица 16 кДа мышиной РНК-полимеразы I, способная связываться с субъединицей 40 кДа, является гомологом дрожжевой субъединицы AC19 РНК-полимераз I и III». Журнал биологической химии. 271 (51): 32881–5. Дои:10.1074 / jbc.271.51.32881. PMID  8955128.
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.

дальнейшее чтение

• Яо Й, Ямамото К., Ниси Й, Ноги Й, Мурамацу М. (декабрь 1996 г.). «Субъединица 16 кДа мышиной РНК-полимеразы I, способная связываться с субъединицей 40 кДа, является гомологом дрожжевой субъединицы AC19 РНК-полимераз I и III». Журнал биологической химии. 271 (51): 32881–5. Дои:10.1074 / jbc.271.51.32881. PMID  8955128.
• Dundr M, Hoffmann-Rohrer U, Hu Q, Grummt I., Rothblum LI, Phair RD, Misteli T (ноябрь 2002 г.). «Кинетическая основа для РНК-полимеразы млекопитающих in vivo». Наука. 298 (5598): 1623–6. Дои:10.1126 / science.1076164. PMID  12446911.
• Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (февраль 2004 г.). «Физическая и функциональная карта пути передачи сигнала TNF-альфа / NF-каппа B человека». Природа клеточной биологии. 6 (2): 97–105. Дои:10.1038 / ncb1086. PMID  14743216.
• Ямамото К., Ямамото М., Ханада К., Ноги Й., Мацуяма Т., Мурамацу М. (июль 2004 г.). «Множественные белок-белковые взаимодействия фактора PAF49, связанного с РНК-полимеразой I, и роль PAF49 в транскрипции рРНК». Молекулярная и клеточная биология. 24 (14): 6338–49. Дои:10.1128 / MCB.24.14.6338-6349.2004. ЧВК  434256. PMID  15226435.
• Андерсен Дж.С., Лам Ю.В., Леунг А.К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.