PPAN - PPAN

PPAN
Идентификаторы
Псевдонимы	PPAN, BXDC3, SSF, SSF-1, SSF1, SSF2, гомолог Питера Пэна (Drosophila), гомолог Питера Пэна
Внешние идентификаторы	OMIM: 607793 MGI: 2178445 ГомолоГен: 5690 Генные карты: PPAN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19p13.2 Начните 10,106,362 бп[1] Конец 10,112,012 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A3 Начните 20,888,175 бп[2] Конец 20,892,178 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание рРНК • Связывание РНК Сотовый компонент • ядрышко • прерибосома, предшественник большой субъединицы • ядро клетки Биологический процесс • сборка большой субъединицы рибосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	56342	235036
Ансамбль	ENSG00000130810	ENSMUSG00000004100
UniProt	Q9NQ55	Q91YU8
RefSeq (мРНК)	NM_001346139 NM_001346141 NM_020230	NM_145610
RefSeq (белок)	NP_001035754 NP_001185619	NP_663585
Расположение (UCSC)	Chr 19: 10.11 - 10.11 Мб	Chr 9: 20,89 - 20,89 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Подавитель гомолога SWI4 1 это белок что у людей кодируется PPAN ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является эволюционно консервативным белком, подобным дрожжевому SSF1, а также продукту гена peterpan гена дрозофилы (PPAN). SSF1, как известно, участвует во втором этапе сплайсинга мРНК. И SSF1, и PPAN необходимы для роста и пролиферации клеток. Было обнаружено, что этот ген котранскриптируется с P2RY11 / P2Y (11), непосредственно расположенным ниже по течению геном на хромосоме, который кодирует рецептор АТФ. Было обнаружено, что химерные транскрипты этого гена и P2RY11 повсеместно присутствуют и регулируются во время гранулоцитарной дифференцировки. Сообщалось, что экзогенная экспрессия этого гена снижает независимый от закрепления рост некоторых опухолевых клеток.^[6]

Хотя PPAN участвует в биогенезе рибосом, он не только локализуется в ядрышках, но и в митохондриях. Истощение PPAN провоцирует апоптоз как было отмечено увеличением количества p53 и его целевой ген стр.21, BAX-управляемая деполяризация митохондрий, высвобождение цитохрома с, а также каспазозависимое расщепление PARP.^[7] Недавние исследования показали, что PPAN участвует в регуляции митохондриального гомеостаза, предположительно через модуляцию аутофагия.^[8] Более того, PPAN необходим для правильного цикла клеток, поскольку подавление PPAN в раковых клетках приводит к остановке клеточного цикла, не зависящей от p53.^[9]

Один из интронов PPAN кодирует Малая ядрышковая РНК SNORD105.^[10]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130810 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000004100 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Welch PJ, Marcusson EG, Li QX, Beger C, Krüger M, Zhou C и др. (Июнь 2000 г.). «Идентификация и проверка гена, участвующего в контроле роста клеток, не зависящего от закрепления, с использованием библиотеки рандомизированных шпилечных рибозимов». Геномика. 66 (3): 274–83. Дои:10.1006 / geno.2000.6230. PMID  10873382.
6. «Ген Entrez: гомолог Питера Пэна PPAN (Drosophila)».
7. Пфистер А.С., Кейл М., Кюль М. (апрель 2015 г.). "Целевой белок Wnt, Питер Пэн, определяет новый p53-независимый путь ядерной реакции на стресс". Журнал биологической химии. 290 (17): 10905–18. Дои:10.1074 / jbc.M114.634246. ЧВК  4409253. PMID  25759387.
8. https://www.mdpi.com/2073-4409/8/8/894
9. Кейл М., Мейер М.Т., Даннхейсиг Д.П., Мерц Л.Д., Филипп М., Pfister AS (май 2019 г.). «Потеря белка Питера Пэна связана с дефектами клеточного цикла и апоптозом». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Исследование молекулярных клеток. 1866 (5): 882–895. Дои:10.1016 / j.bbamcr.2019.01.010. PMID  30716409.
10. Виталий П., Ройо Х., Зейтц Х., Bachellerie JP, Hüttenhofer A, Cavaillé J (ноябрь 2003 г.). «Идентификация 13 новых управляющих РНК человека». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (22): 6543–51. Дои:10.1093 / нар / gkg849. ЧВК  275545. PMID  14602913.

дальнейшее чтение

• Communi D, Govaerts C, Parmentier M, Boeynaems JM (декабрь 1997 г.). «Клонирование пуринергического рецептора P2Y человека, связанного с фосфолипазой C и аденилилциклазой». Журнал биологической химии. 272 (51): 31969–73. Дои:10.1074 / jbc.272.51.31969. PMID  9405388.
• Мигеон Дж. К., Гарфинкель М. С., Эдгар Б. А. (июнь 1999 г.). «Клонирование и характеристика питера пэна, нового гена дрозофилы, необходимого для роста личинок». Молекулярная биология клетки. 10 (6): 1733–44. Дои:10.1091 / mbc.10.6.1733. ЧВК  25365. PMID  10359593.
• Суарес-Уэрта Н., Бойнаемс Дж. М., Communi D (август 2000 г.). «Клонирование, геномная организация и распределение тканей человеческого Ssf-1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 275 (1): 37–42. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3259. PMID  10944437.
• Communi D, Suarez-Huerta N, Dussossoy D, Savi P, Boeynaems JM (май 2001 г.). «Котранскрипция и межгенный сплайсинг генов P2Y11 и SSF1 человека». Журнал биологической химии. 276 (19): 16561–6. Дои:10.1074 / jbc.M009609200. PMID  11278528.
• Андерсен Дж. С., Лион К. Э., Фокс А. Х, Люнг А. К., Лам Ю. В., Стин Х и др. (Январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Текущая биология. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Duhant X, Schandené L, Bruyns C, Gonzalez NS, Goldman M, Boeynaems JM, Communi D (июль 2002 г.). «Внеклеточные адениновые нуклеотиды ингибируют активацию CD4 + Т-лимфоцитов человека». Журнал иммунологии. 169 (1): 15–21. Дои:10.4049 / jimmunol.169.1.15. PMID  12077223.
• Scherl A, Couté Y, Déon C, Callé A, Kindbeiter K, Sanchez JC и др. (Ноябрь 2002 г.). «Функциональный протеомный анализ ядрышка человека». Молекулярная биология клетки. 13 (11): 4100–9. Дои:10.1091 / mbc.E02-05-0271. ЧВК  133617. PMID  12429849.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж. И др. (Август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (14): 5391–6. Bibcode:2006PNAS..103.5391N. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.