Индекс отцовства - Paternity Index

В тестирование на отцовство, Индекс отцовства (PI) - это расчетное значение, созданное для одного генетический маркер или же локус (хромосомное расположение или место ДНК интересующая последовательность) и связана со статистической силой или весом этого локуса в пользу или против отцовства с учетом фенотипов тестируемых участников и сценария наследования. Фенотип обычно относится к физическим характеристикам, таким как план тела, цвет, поведение и т. д. у организмов. Однако термин, используемый в области ДНК-тестирования отцовства, относится к тому, что наблюдается непосредственно в лаборатории. Лаборатории, участвующие в тестировании отцовства и других областях идентификации человека, используют панели генетического тестирования, которые содержат батарею локусов (множественное число для локуса), каждый из которых выбирается из-за обширного аллельный вариации внутри и между популяциями. Предполагается, что эти генетические вариации не наделяют человека физическими и / или поведенческими атрибутами, несущими аллельный набор (а), и поэтому не подвергаются селективному давлению и следуют паттернам наследования Харди Вайнберга.

Произведением индивидуальных ИП является ИПЦ (комбинированный индекс отцовства), который в конечном итоге используется для расчета вероятности отцовства в отчетах об испытаниях на отцовство. Требования к минимальной вероятности отцовства в делах штата различаются между штатами, но AABB требует в своих Стандартах для лабораторий тестирования взаимоотношений (в настоящее время в 9-м издании)[1] следует сообщить минимум 99,0%, если испытуемый мужчина «не исключен» как биологический отец рассматриваемого ребенка. Государственный департамент США требует минимальной вероятности отцовства в 99,5% для всех иммиграционных дел.[2]

В расчетах PI используются частоты аллелей генерируется из установленных баз данных населения[3] наиболее часто использующий Короткие тандемные повторы.[3]

Поскольку частоты аллелей могут быть либо сгенерированы собственными силами, либо опубликованы, PI могут различаться в зависимости от компании. Это понятный феномен и оправданный для членов сообщества тестировщиков.[нужна цитата ]

Расчеты

PI - это отношение правдоподобия[4] который генерируется путем сравнения двух вероятностей, где PI = X / Y:

  1. Числитель («X») - вероятность что мы наблюдаем фенотипы тестируемых участников в сценарии наследования, учитывая, что тестируемый мужчина является истинным биологическим отцом. Проще говоря, вероятность того, что какое-то событие произойдет при определенном наборе обстоятельств или условий. Этот расчет предполагает, что испытуемые представляют собой «истинное трио / дуэт» (что объясняется двумя абзацами ниже) или, другими словами, проверенные родители являются настоящими биологическими родителями.
  2. Знаменатель («Y») - вероятность того, что мы наблюдаем фенотипы тестируемых участников в сценарии наследования, учитывая, что истинным биологическим отцом является случайный мужчина. Проще говоря, вероятность того, что какое-то событие произойдет при другом наборе обстоятельств или условий. Этот расчет предполагает, что тестируемые люди являются «ложным трио / дуэтом» или, другими словами, тестируемые родители не являются настоящими биологическими родителями.

В общем, X / Y можно перевести как: Вероятность увидеть наблюдаемые фенотипы в X / Y раз выше, если тестируемый мужчина является истинным биологическим отцом, чем если бы истинным биологическим отцом был непроверенный, неродственный, случайно выбранный мужчина из той же расовой популяции.

Существует 14 возможных комбинаций отцовства по трио и 5 возможных комбинаций отцовства по дуэту.[5]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Руководство по стандартам для лабораторий тестирования взаимоотношений (9-е изд.). ISBN  978-1-56395-293-7.[страница нужна ]
  2. ^ «Процедуры тестирования на родство ДНК». Бюро консульских дел.
  3. ^ а б Budowle, B; Ши, B; Незгода, С; Чакраборти, Р. (2001). «Данные локусов CODIS STR из 41 выборки». Журнал судебной медицины. 46 (3): 453–89. Дои:10.1520 / JFS14996J. PMID  11372982.
  4. ^ Баур, депутат; Elston, RC; Gürtler, H; Хеннингсен, К; Хуммель, К; Мацумото, Н; Майр, Вт; Морис, JW; и другие. (1986). «Никаких заблуждений в формулировке индекса отцовства». Американский журнал генетики человека. 39 (4): 528–36. ЧВК  1683973. PMID  3766545.
  5. ^ http://dna-view.com/patform.htm

дальнейшее чтение

внешняя ссылка