Phikmvvirus - Phikmvvirus

Phikmvvirus
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Дуплоднавирия
Королевство:Heunggongvirae
Тип:Уровирикота
Учебный класс:Caudoviricetes
Заказ:Caudovirales
Семья:Автографивирусы
Подсемейство:Крыловирины
Род:Phikmvvirus
Типовой вид
Вирус псевдомонады phiKMV

Phikmvvirus это род вирусы который заразить бактерии. В настоящее время в этом роду насчитывается 16 видов, включая типовые виды. Вирус псевдомонады phiKMV.[1][2]Бактериофаг phiKMV[3] и его родственники, как известно, очень ядовитый фаги, производящие большие (3–15 мм (0,12–0,59 дюйма) в диаметре) прозрачные бляшки на восприимчивом хозяине.[4][5] Единственным зарегистрированным исключением является фаг LKA1, который дает небольшие бляшки (1 мм (0,039 дюйма)), окруженные ореолом. В то время как все остальные P. aeruginosa-специфические фикмввирусы используют Пили IV типа как первичный рецептор, частицы LKA1 прикрепляются к бактериальному липополисахарид слой.

Таксономия

Признаны следующие виды:[2]

Вирусология

Электронно-микроскопический визуализация очищенных фаговых частиц показала, что эти фаги являются типичными членами Podoviridae, с диаметром головки примерно 60 нм (2,4×10−6 в) и короткий хвост длиной 8–10 нм. Хотя фаг phiKMV напоминает хорошо изученный подовирус Т7 в общем и целом геном архитектура, это был первый известный Т7-подобный фаг который кодировал одну субъединицу РНК-полимераза ген вниз по течению ДНК гены метаболизма, а не в ранней геномной области. На основании этих свойств род Phikmvvirus классифицируется в Автографивирусы.[6]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
PhikmvvirusХвост-ХвостТ = 7Без оболочкиЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Попадание в хозяйскую клетку достигается за счет абсорбции в хозяйской клетке. Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем лизиса и белков холина / эндолизина / спанина. Бактерии служат естественным хозяином. Пути передачи - пассивное распространение.[1]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
PhikmvvirusБактерииНиктоИнъекцияЛизисЦитоплазмаЦитоплазмаПассивная диффузия

Рекомендации

  1. ^ а б «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  2. ^ а б «Таксономия вирусов: выпуск 2019 г.». talk.ictvonline.org. Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 4 мая 2020.
  3. ^ Лавин, Роб; Буркальцева Мария В .; Роббен, Йохан; Sykilinda, Nina N .; Курочкина, Лидия П .; Гримонпрез, Барбара; Джонкс, Барт; Крылов, Виктор Н .; и другие. (2003). "Геном бактериофага φKMV, Т7-подобного вируса, заражающего Синегнойная палочка". Вирусология. 312 (1): 49–59. Дои:10.1016 / S0042-6822 (03) 00123-5. PMID  12890620.
  4. ^ Ceyssens, P.-J .; Lavigne, R .; Mattheus, W .; Chibeu, A .; Hertveldt, K .; Mast, J .; Роббен, Дж .; Volckaert, Г. (2006). "Геномный анализ Синегнойная палочка Фаги LKD16 и LKA1: создание подгруппы KMV в супергруппе T7 ». Журнал бактериологии. 188 (19): 6924–31. Дои:10.1128 / JB.00831-06. ЧВК  1595506. PMID  16980495.
  5. ^ Lammens, E .; Ceyssens, P.-J .; Voet, M .; Hertveldt, K .; Lavigne, R .; Volckaert, Г. (2009). «Репрезентативный анализ различий (RDA) геномов бактериофагов». Журнал микробиологических методов. 77 (2): 207–13. Дои:10.1016 / j.mimet.2009.02.006. PMID  19232531.
  6. ^ Лавин, Роб; Сето, Дональд; Махадеван, Падманабхан; Ackermann, Hans-W .; Кропинский, Эндрю М. (2008). «Объединение классической и молекулярной таксономической классификации: анализ Podoviridae с использованием инструментов на основе BLASTP». Исследования в области микробиологии. 159 (5): 406–14. Дои:10.1016 / j.resmic.2008.03.005. PMID  18555669.

внешняя ссылка