Сайт связывания праймера - Primer binding site
| Сайт связывания праймера ВИЧ (PBS) | |
|---|---|
 Предсказанный вторичная структура и сохранение последовательности HIV_PBS | |
| Идентификаторы | |
| Символ | HIV_PBS |
| Рфам | RF00375 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Снг |
| Домен (ы) | Эукариоты; Вирусы |
| ТАК | ТАК: 0000233 |
| PDB структуры | PDBe |
А сайт связывания праймера это область, край из нуклеотид последовательность где РНК или же ДНК одноцепочечный грунтовка связывает начать репликация. Сайт связывания праймера находится на одном из двух дополнительный пряди двухцепочечного нуклеотид полимер в цепи, которая должна быть скопирована, или находится внутри одноцепочечной нуклеотидной полимерной последовательности.[1]
А ПЦР сайт связывания праймера - это сайт, где полимеразной цепной реакции (ПЦР) грунтовка связывается для первичной дупликации комплемента к существующей последовательности ДНК или РНК.
В ВИЧ сайт связывания праймера представляет собой структурированный Элемент РНК в геномах ретровирусы которому тРНК обязывает инициировать обратная транскрипция. В ВИЧ тРНК - это тРНК (3) (Lys).[2] хотя он может использовать другие тРНК.[3] Состоит из 18 нуклеотиды и следует за U5 регион 5'-длинный терминальный повтор (LTR) ретровируса.[4]
Рекомендации
- ^ Берг, Джереми М .; Тимочко, Джон Л. и Страйер, Люберт. (ок. 2002). «Репликация ДНК обеих цепей происходит быстро с определенных стартовых сайтов». Биохимия. Нью-Йорк: W.H. Freeman and Co.
- ^ Beerens, N; Groot F; Беркхоут Б (2001). «Инициирование обратной транскрипции ВИЧ-1 регулируется сигналом активации праймера». J Biol Chem. 276 (33): 31, 247–31, 256. Дои:10.1074 / jbc.M102441200. PMID 11384976.
- ^ Das, AT; Klaver B; Беркхут Б (1995). «Снижение репликации мутантов вируса иммунодефицита человека типа 1, которые используют праймеры обратной транскрипции, отличные от природной тРНК (3) (Lys)». J Virol. 69 (5): 3, 090–3, 097. ЧВК 189010. PMID 7707537.
- ^ Дамгаард К.К., Андерсен Э.С., Кнудсен Б., Городкин Дж., Кьемс Дж. (2004). «Взаимодействие РНК в 5'-области генома ВИЧ-1». Дж Мол Биол. 336 (2): 369–379. Дои:10.1016 / j.jmb.2003.12.010. PMID 14757051.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |