Протеопедия - Proteopedia

Протеопедия
Proteopedia logo.gif
Тип бизнесаНекоммерческая
Тип сайта
Интернет-энциклопедия
Доступно ванглийский
СделаноДжоэл Л. Сассман, Эран Ходис и Хайме Прилуски
URLпротеопедия.org
КоммерческийНет
Запущен2007; 13 лет назад (2007)
Текущее состояниеВ сети

Протеопедия это вики, 3D энциклопедия белки и другие молекулы.[1][2][3][4]Сайт содержит страницу для каждой записи в Банк данных белков (> 130000 страниц), а также страницы, которые более подробно описывают структуры белков в целом, такие как ацетилхолинэстераза,[5] гемоглобин,[6] и фотосистема II[7] с Jmol вид, который выделяет функциональные сайты и лиганды. В нем используется инструмент для создания сцен, поэтому пользователям не нужно изучать язык сценариев JSmol для создания настраиваемых молекулярных сцен. Пользовательские сцены легко прикрепляются к «зеленым ссылкам» в описательном тексте, который отображает эти сцены в JSmol. Веб-браузер - это все, что нужно для доступа к сайту и трехмерной информации; установка программ просмотра не требуется.

Proteopedia был лауреатом премии 2010 года за лучший веб-сайт от Ученый журнал.[8]

Правовые аспекты

Условия лицензирования

Все материалы, добавленные пользователями, бесплатны и покрываются Лицензия свободной документации GNU. Протеопедия размещается в Израильском центре структурной протеомики[9] на Институт науки Вейцмана.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Ходис Э., Прилуски Дж., Мартц Э., Силман И., Моулт Дж., Сассман Дж. Л. (2008). «Протеопедия - научная вики, преодолевающая разрыв между трехмерной структурой и функцией биомакромолекул». Геном Биол. 9 (8): R121. Дои:10.1186 / gb-2008-9-8-r121. ЧВК  2575511. PMID  18673581.
  2. ^ Марц Э (2009). "Proteopedia.Org: научная" Wiki ", преодолевающая разрыв между трехмерной структурой и функцией биомакромолекул". Биополимеры. 92 (1): 76–7. Дои:10.1002 / bip.21126. PMID  19117028.
  3. ^ Ходис Э., Прилуски Дж., Сассман Дж. Л. (2010). «Proteopedia: совместный виртуальный трехмерный веб-ресурс, посвященный структуре и функциям белков и биомолекул». Биохимия и молекулярная биология образование. 38 (5): 341–2. Дои:10.1002 / bmb.20431. PMID  21567857.
  4. ^ Прилуски, Дж; Hodis, E .; Canner, D .; Decatur, W. A .; Oberholser, K .; Martz, E .; Берчанский, А .; Harel, M .; Сассман, Дж. Л. (август 2011 г.). «Proteopedia: отчет о состоянии совместной трехмерной сетевой энциклопедии белков и других биомолекул». Журнал структурной биологии. 175 (2): 244–252. Дои:10.1016 / j.jsb.2011.04.011. PMID  21536137.
  5. ^ «Ацетилхолинэстераза». Протеопедия.
  6. ^ «Гемоглобин». Протеопедия.
  7. ^ «Фотосистема II». Протеопедия.
  8. ^ Луиджи К. (сентябрь 2010 г.). "Web Gems Представляем победителей первого ежегодного конкурса Labbies, наши призы лабораторий за лучшее веб-мультимедиа: Победитель веб-сайта: Proteopedia". Ученый. 24 (9): 47. Очень увлекательно. Я долго смотрел и играл (и учился) с ним. Очень информативный и хороший ресурс.
  9. ^ "Израильский центр структурной протеомики".

внешняя ссылка