QKI - QKI

QKI
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4JVH
Идентификаторы
Псевдонимы	QKI, Hqk, QK, QK1, QK3, hqkI, содержащий домен KH, связывание РНК, домен KH, содержащий связывание РНК
Внешние идентификаторы	OMIM: 609590 MGI: 97837 ГомолоГен: 11059 Генные карты: QKI
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q26 Начните 163,414,000 бп[1] Конец 163,578,592 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 A1 | 17 7,75 см Начните 10,202,601 бп[2] Конец 10,319,854 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка домена SH3 • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • связывание мРНК • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • синапс Биологический процесс • дифференциация клеток • транспорт мРНК • обработка мРНК • васкулогенез • развитие многоклеточного организма • оболочка аксонов • дифференциация мышечных клеток • положительная регуляция экспрессии генов • процесс биосинтеза длинноцепочечных жирных кислот • Сплайсинг РНК • развитие сперматид • миелинизация • 3'-UTR-опосредованная дестабилизация мРНК • регулирование перевода • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9444	19317
Ансамбль	ENSG00000112531	ENSMUSG00000062078
UniProt	Q96PU8	Q9QYS9
RefSeq (мРНК)	NM_001301085 NM_006775 NM_206853 NM_206854 NM_206855	NM_001159516 NM_001159517 NM_021881
RefSeq (белок)	NP_001288014 NP_006766 NP_996735 NP_996736 NP_996737	NP_001152988 NP_001152989 NP_068681
Расположение (UCSC)	Chr 6: 163,41 - 163,58 Мб	Chr 17: 10.2 - 10.32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомолог Quaking, связывание РНК домена KH (мышь), также известен как QKI, это белок который у человека кодируется QKI ген.^[5][6]

QKI принадлежит к семейству РНК-связывающих белков, называемых белками STAR, для Sигнал Твыкуп и Астимулирование рNA.^[7] У них есть ГНРНПК домен гомологии (KH), встроенный в область из 200 аминокислот, называемую доменом GSG. Другие члены этого семейства включают SAM68 (KHDRBS1 ) и SF1 .^[8] Еще два новых участника KHDRBS3^[9] и KHDRBS2.^[10]

Ген QKI считается важным при шизофрении,^[11][12] и QKI контролирует трансляцию многих генов, связанных с олигодендроцитами.

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112531 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000062078 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: QKI quaking гомолог, связывание РНК домена KH (мышь)».
6. Saccomanno L, Loushin C, Jan E, Punkay E, Artzt K, Goodwin EB (октябрь 1999 г.). «Белок STAR QKI-6 является репрессором трансляции». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (22): 12605–10. Bibcode:1999PNAS ... 9612605S. Дои:10.1073 / пнас.96.22.12605. ЧВК  23011. PMID  10535969.
7. Vernet C, Artzt K (декабрь 1997 г.). «STAR, семейство генов, участвующих в передаче сигнала и активации РНК». Тенденции Genet. 13 (12): 479–84. Дои:10.1016 / S0168-9525 (97) 01269-9. PMID  9433137.
8. Чен Т., Ричард С. (август 1998 г.). «Структурно-функциональный анализ Qk1: ​​летальная точечная мутация при сотрясении мышей предотвращает гомодимеризацию». Мол. Cell. Биол. 18 (8): 4863–71. Дои:10.1128 / MCB.18.8.4863. ЧВК  109071. PMID  9671495.
9. Венейблс Дж. П., Вернет К., Чу С. Л., Эллиотт Д. Д., Каумидоу Р. Б., Ву Дж., Кук Г. Дж., Артц К., Eperon IC (июнь 1999 г.). «T-STAR / ETOILE: новый родственник SAM68, который взаимодействует с РНК-связывающим белком, участвующим в сперматогенезе». Гм. Мол. Genet. 8 (6): 959–69. Дои:10,1093 / hmg / 8.6.959. PMID  10332027.
10. Ван Л., Сюй Дж, Цзэн Л., Е Икс, Ву Цюй, Дай Дж, Джи Ц, Гу С, Чжао Ц., Се И, Мао Ю. (декабрь 2002 г.). «Клонирование и характеристика нового человеческого STAR-домена, содержащего кДНК KHDRBS2». Мол. Биол. Представитель. 29 (4): 369–75. Дои:10.1023 / А: 1021246109101. PMID  12549823. S2CID  21864405.
11. Аберг К., Саетре П., Яреборг Н., Джазин Э. (май 2006 г.). «QKI человека, потенциальный регулятор экспрессии мРНК генов, связанных с олигодендроцитами человека, участвующих в шизофрении». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (19): 7482–7. Bibcode:2006PNAS..103.7482A. Дои:10.1073 / pnas.0601213103. ЧВК  1464365. PMID  16641098.
12. Арутюнян В., Кацель П., Драчева С., Дэвис К.Л. (октябрь 2006 г.). «Человеческий гомолог гена QKI, пораженный тяжелой дисмиелинизацией,« дрожащий »фенотип мышей: пониженная регуляция во многих областях мозга при шизофрении». Am J Psychiatry. 163 (10): 1834–7. Дои:10.1176 / ajp.2006.163.10.1834. PMID  17012699.

дальнейшее чтение

• Робертсон Н.Г., Хетарпал У., Гутьеррес-Эспелета Г.А. и др. (1995). «Выделение новых и известных генов из библиотеки кДНК улитки человеческого плода с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Геномика. 23 (1): 42–50. Дои:10.1006 / geno.1994.1457. PMID  7829101.
• Саккоманно Л., Лушин С., Ян Е. и др. (1999). «Белок STAR QKI-6 является репрессором трансляции». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 96 (22): 12605–10. Bibcode:1999PNAS ... 9612605S. Дои:10.1073 / пнас.96.22.12605. ЧВК  23011. PMID  10535969.
• Ли З.З., Кондо Т., Мурата Т. и др. (2002). «Экспрессия Hqk, кодирующего белок, связывающий РНК KH, изменена в глиоме человека». Jpn. J. Cancer Res. 93 (2): 167–77. Дои:10.1111 / j.1349-7006.2002.tb01255.x. ЧВК  5926958. PMID  11856480.
• Ву Джи, Рид РБ, Грабовски П.Дж., Артцт К. (2002). «Функция дрожания при миелинизации: регулирование альтернативного сплайсинга». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (7): 4233–8. Bibcode:2002PNAS ... 99,4233 Вт. Дои:10.1073 / pnas.072090399. ЧВК  123631. PMID  11917126.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Мур Флорида, Ярузельская Дж., Фокс М.С. и др. (2003). «Пумилио-2 человека экспрессируется в эмбриональных стволовых клетках и половых клетках и взаимодействует с DAZ (удалено при азооспермии) и DAZ-подобными белками». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (2): 538–43. Bibcode:2003ПНАС..100..538М. Дои:10.1073 / pnas.0234478100. ЧВК  141031. PMID  12511597.
• Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC и др. (2003). «РНК-связывающий белок Sam68 является субстратом in vivo для белка аргинин-N-метилтрансферазы 1». Мол. Биол. Ячейка. 14 (1): 274–87. Дои:10.1091 / mbc.E02-08-0484. ЧВК  140244. PMID  12529443.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Ичимура К., Мунгалл А.Дж., Фиглер Х. и др. (2006). «Небольшие области перекрывающихся делеций на 6q26 в человеческих астроцитарных опухолях, идентифицированные с использованием массива фрагментов 6-й хромосомы-CGH». Онкоген. 25 (8): 1261–71. Дои:10.1038 / sj.onc.1209156. ЧВК  2760128. PMID  16205629.
• Аберг К., Саетре П., Линдхольм Э. и др. (2006). «Человеческий QKI, новый ген-кандидат шизофрении, участвующий в миелинизации». Am. J. Med. Genet. B Neuropsychiatr. Genet. 141 (1): 84–90. Дои:10.1002 / ajmg.b.30243. PMID  16342280. S2CID  11733591.
• Аберг К., Саетре П., Яреборг Н., Джазин Э. (2006). «QKI человека, потенциальный регулятор экспрессии мРНК генов, связанных с олигодендроцитами человека, участвующих в шизофрении». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (19): 7482–7. Bibcode:2006PNAS..103.7482A. Дои:10.1073 / pnas.0601213103. ЧВК  1464365. PMID  16641098.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С. и др. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Арутюнян В., Кацель П., Драчева С., Дэвис К.Л. (2006). «Человеческий гомолог гена QKI, пораженный тяжелой дисмиелинизацией,« дрожащий »фенотип мышей: пониженная регуляция во многих областях мозга при шизофрении». Американский журнал психиатрии. 163 (10): 1834–7. Дои:10.1176 / ajp.2006.163.10.1834. PMID  17012699.
• Чжао Л., Тянь Д., Ся М. и др. (2006). «Спасение qkV дисмиелинизации одной изоформой селективного РНК-связывающего белка QKI». J. Neurosci. 26 (44): 11278–86. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.2677-06.2006. ЧВК  6674528. PMID  17079655.