KHDRBS3 - KHDRBS3

KHDRBS3
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	5ELR, 5ELS, 5EMO, 5ELT, 5EL3
Идентификаторы
Псевдонимы	KHDRBS3, Etle, SALP, SLM-2, SLM2, T-STAR, TSTAR, etoile, содержащий домен KH, связывание РНК, связанный с трансдукцией сигнала 3, содержащий домен связывания KH РНК, связанный с передачей сигнала 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 610421 MGI: 1313312 ГомолоГен: 4780 Генные карты: KHDRBS3
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 8 (человек)
Конец	135,656,722 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 15 (мышь)
Конец	69,101,211 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• Привязка домена SH3; • GO: 0001948 связывание с белками; • Связывание РНК; • связывание нуклеиновой кислоты; • специфическое связывание белкового домена; • идентичное связывание с белками;
Сотовый компонент	• ядро клетки; • нуклеоплазма;
Биологический процесс	• регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция, ДНК-шаблон; • обработка мРНК; • регуляция сплайсинга мРНК через сплайсосомы; • олигомеризация белков;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10656
	13992
	ENSG00000131773
	ENSMUSG00000022332
	O75525
	Q9R226
	NM_006558
	NM_010158
	NP_006549
	NP_034288
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

KH-домен, содержащий РНК-связывающий белок 3, связанный с сигнальной трансдукцией это белок что у людей кодируется KHDRBS3 ген.^[5]^[6]^[7]

Взаимодействия

KHDRBS3 был показан взаимодействовать с SIAH1.^[8]^[9]

KHDRBS3 взаимодействует со сплайсинговым белком Sam68 и онкогеном метадгерин в клетках рака простаты.^[10]

Клиническое значение

Было показано, что экспрессия KHDRBS3 (T-STAR) увеличивается в рак простаты ткань по сравнению с окружающей доброкачественной тканью.^[10] Экспрессия KHDRBS3 коррелирует с mpMRI сигнал, измеренный по шкале Лайкерта, по системе, аналогичной PI-RADS.^[10] Хотя все еще обсуждается, сигнал mpMRI коррелирует с более высоким Оценка Глисона и размер опухоли, в дополнение к гистопатологический особенности, связанные с клинически агрессивным раком простаты.^[11]^[12]

В клеточных линиях рака предстательной железы KHDRBS3, по-видимому, регулируется андрогеном, при этом снижение экспрессии мРНК происходит после добавления синтетического андрогена. R1881 в клетки.^[10]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131773 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022332 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J и др. (Июнь 1999 г.). «T-STAR / ETOILE: новый родственник SAM68, который взаимодействует с РНК-связывающим белком, участвующим в сперматогенезе». Молекулярная генетика человека. 8 (6): 959–69. Дои:10,1093 / hmg / 8.6.959. PMID 10332027.
^ Ли Дж., Берр Дж. Г. (ноябрь 1999 г.). "Salpalpha и Salpbeta, задерживающие рост гомологи Sam68". Ген. 240 (1): 133–47. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00421-7. PMID 10564820.
^ «Ген Entrez: KHDRBS3, содержащий домен KH, связывание РНК, передача сигнала, связанная 3».
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Венейблс Дж. П., Дэлглиш К., Паронетто М. П., Скитт Л., Торнтон Дж. К., Сондерс П. Т. и др. (Июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека. 13 (14): 1525–34. Дои:10,1093 / hmg / ddh165. PMID 15163637.
^ ^а ^б ^c ^d Luxton HJ, Simpson BS, Mills IG, Brindle NR, Ahmed Z, Stavrinides V, et al. (Август 2019 г.). «Онкоген Метадгерин взаимодействует с известными белками сплайсинга YTHDC1, Sam68 и T-STAR и играет новую роль в альтернативном сплайсинге мРНК». Рак. 11 (9): 1233. Дои:10.3390 / Cancers11091233. ЧВК 6770463. PMID 31450747.
^ Норрис Дж. М., Кармона Эчеверрия Л. М., Ботт С. Р., Браун Л. К., Бернс-Кокс Н., Даддеридж Т. и др. (Май 2020 г.). «Какой тип рака простаты систематически игнорируется с помощью многопараметрической магнитно-резонансной томографии? Анализ когорты PROMIS». Европейская урология. 78 (2): 163–170. Дои:10.1016 / j.eururo.2020.04.029. ЧВК 7397509. PMID 32370911.
^ Норрис Дж. М., Кармона Эчеверрия Л. М., Симпсон Б. С., Аллен С., Болл Р., Фриман А. и др. (Апрель 2020 г.). «Видимость рака простаты на многопараметрической магнитно-резонансной томографии: высокий класс по шкале Глисона и увеличенный объем опухоли - не единственные важные гистопатологические признаки». BJU International. 126 (2): 237–239. Дои:10.1111 / bju.15085. PMID 32319152.

дальнейшее чтение

Ди Фрушио М., Чен Т., Ричард С. (март 1999 г.). «Характеристика Sam68-подобных белков млекопитающих SLM-1 и SLM-2: SLM-1 является субстратом Src во время митоза». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (6): 2710–5. Bibcode:1999PNAS ... 96.2710D. Дои:10.1073 / pnas.96.6.2710. ЧВК 15834. PMID 10077576.
Венейблс Дж. П., Эллиотт Д. Д., Макарова О. В., Макаров Е. М., Кук Х. Дж., Eperon IC (март 2000 г.). «RBMY, вероятный фактор сперматогенеза человека, и другие белки hnRNP G взаимодействуют с Tra2beta и влияют на сплайсинг». Молекулярная генетика человека. 9 (5): 685–94. Дои:10,1093 / hmg / 9,5,685. PMID 10749975.
Стосс О., Ольбрих М., Хартманн А.М., Кениг Х., Меммотт Дж., Андредис А., Штамм С. (март 2001 г.). «Белок семейства STAR / GSG rSLM-2 регулирует выбор альтернативных сайтов сплайсинга». Журнал биологической химии. 276 (12): 8665–73. Дои:10.1074 / jbc.M006851200. PMID 11118435.
Сугимото Ю., Морита Р., Амано К., Шах ПУ, Паскуаль-Кастровьехо И., Хан С. и др. (Август 2001 г.). «Ген T-STAR: точное картирование области-кандидата на абсансную эпилепсию у детей на 8q24 и мутационный анализ у пациентов». Исследования эпилепсии. 46 (2): 139–44. Дои:10.1016 / S0920-1211 (01) 00274-1. PMID 11463515. S2CID 28713407.
Кул Дж., Ван Заане В., ван дер Эб А.Дж., Терлет С. (ноябрь 2001 г.). «Подавление T-STAR, белка, ингибирующего рост, после иммортализации, опосредованной SV40». Рост и дифференциация клеток. 12 (11): 535–41. PMID 11714634.
Reddy TR, Suhasini M, Xu W., Yeh LY, Yang JP, Wu J и др. (Февраль 2002 г.). «Роль белков домена KH (Sam68-подобных белков млекопитающих и сотрясающих белков) в посттранскрипционной регуляции репликации ВИЧ». Журнал биологической химии. 277 (8): 5778–84. Дои:10.1074 / jbc.M106836200. PMID 11741900.
Côté J, Boisvert FM, Boulanger MC, Bedford MT, Richard S (январь 2003 г.). «РНК-связывающий белок Sam68 является субстратом in vivo для белка аргинин-N-метилтрансферазы 1». Молекулярная биология клетки. 14 (1): 274–87. Дои:10.1091 / mbc.E02-08-0484. ЧВК 140244. PMID 12529443.
Венейблс Дж. П., Дэлглиш К., Паронетто М. П., Скитт Л., Торнтон Дж. К., Сондерс П. Т. и др. (Июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека. 13 (14): 1525–34. Дои:10,1093 / hmg / ddh165. PMID 15163637.
Коэн С.Д., Доран П.П., Блаттнер С.М., Меркл М., Ван Г.К., Шмид Х. и др. (Июль 2005 г.). «Sam68-подобный белок 2 млекопитающих, идентифицированный цифровым дифференциальным дисплеем и выраженный подоцитами, индуцируется протеинурией и участвует в выборе места сплайсинга фактора роста эндотелия сосудов». Журнал Американского общества нефрологов. 16 (7): 1958–65. Дои:10.1681 / ASN.2005020204. PMID 15901763.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Чжан Л., Го Л., Пэн И, Чен Б. (июль 2006 г.). «Экспрессия гена T-STAR связана с регуляцией активности теломеразы в линии клеток рака толстой кишки человека HCT-116». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 12 (25): 4056–60. Дои:10.3748 / wjg.v12.i25.4056. ЧВК 4087721. PMID 16810759.
Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Эта статья о ген на хромосома человека 8 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131773 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022332 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10332027-5] Venables JP, Vernet C, Chew SL, Elliott DJ, Cowmeadow RB, Wu J и др. (Июнь 1999 г.). «T-STAR / ETOILE: новый родственник SAM68, который взаимодействует с РНК-связывающим белком, участвующим в сперматогенезе». Молекулярная генетика человека. 8 (6): 959–69. Дои:10,1093 / hmg / 8.6.959. PMID 10332027.

[pmid10564820-6] Ли Дж., Берр Дж. Г. (ноябрь 1999 г.). "Salpalpha и Salpbeta, задерживающие рост гомологи Sam68". Ген. 240 (1): 133–47. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00421-7. PMID 10564820.

[entrez-7] «Ген Entrez: KHDRBS3, содержащий домен KH, связывание РНК, передача сигнала, связанная 3».

[pmid16189514-8] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н. и др. (Октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid15163637-9] Венейблс Дж. П., Дэлглиш К., Паронетто М. П., Скитт Л., Торнтон Дж. К., Сондерс П. Т. и др. (Июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека. 13 (14): 1525–34. Дои:10,1093 / hmg / ddh165. PMID 15163637.

[:0-10] а ^б ^c ^d Luxton HJ, Simpson BS, Mills IG, Brindle NR, Ahmed Z, Stavrinides V, et al. (Август 2019 г.). «Онкоген Метадгерин взаимодействует с известными белками сплайсинга YTHDC1, Sam68 и T-STAR и играет новую роль в альтернативном сплайсинге мРНК». Рак. 11 (9): 1233. Дои:10.3390 / Cancers11091233. ЧВК 6770463. PMID 31450747.

[11] Норрис Дж. М., Кармона Эчеверрия Л. М., Ботт С. Р., Браун Л. К., Бернс-Кокс Н., Даддеридж Т. и др. (Май 2020 г.). «Какой тип рака простаты систематически игнорируется с помощью многопараметрической магнитно-резонансной томографии? Анализ когорты PROMIS». Европейская урология. 78 (2): 163–170. Дои:10.1016 / j.eururo.2020.04.029. ЧВК 7397509. PMID 32370911.

[12] Норрис Дж. М., Кармона Эчеверрия Л. М., Симпсон Б. С., Аллен С., Болл Р., Фриман А. и др. (Апрель 2020 г.). «Видимость рака простаты на многопараметрической магнитно-резонансной томографии: высокий класс по шкале Глисона и увеличенный объем опухоли - не единственные важные гистопатологические признаки». BJU International. 126 (2): 237–239. Дои:10.1111 / bju.15085. PMID 32319152.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]