REG3G - REG3G

REG3G
Идентификаторы
Псевдонимы	REG3G, LPPM429, PAP IB, PAP-1B, PAP1B, PAPIB, REG III, REG-III, UNQ429, регенерирующий член семейства 3 гамма
Внешние идентификаторы	OMIM: 609933 MGI: 109406 ГомолоГен: 128216 Генные карты: REG3G
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п12 Начинать 79,025,686 бп[1] Конец 79,028,505 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 C3 Начинать 78,466,269 бп[2] Конец 78,468,872 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание углеводов • связывание пептидогликана • связывание олигосахаридов • активность трансмембранного сигнального рецептора Сотовый компонент • цитоплазма • внеклеточная область • внеклеточный Биологический процесс • положительное регулирование заживления ран • положительная регуляция пролиферации кератиноцитов • отрицательная регуляция дифференцировки кератиноцитов • воспалительная реакция • острофазовый ответ • MyD88-зависимый сигнальный путь толл-подобных рецепторов • защитный ответ на грамположительные бактерии • антимикробный гуморальный ответ • антимикробный гуморальный иммунный ответ, опосредованный антимикробным пептидом • положительное регулирование пролиферации клеток • ответ на пептидный гормон • нарушение клеточной стенки в другом организме Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	130120	19695
Ансамбль	ENSG00000143954	ENSMUSG00000030017
UniProt	Q6UW15	O09049
RefSeq (мРНК)	NM_001008387 NM_001270040 NM_198448	NM_011260
RefSeq (белок)	NP_001008388 NP_001256969 NP_940850	NP_035390
Расположение (UCSC)	Chr 2: 79.03 - 79.03 Мб	Chr 6: 78.47 - 78.47 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Регенерация островкового белка 3 гамма (также регенерирующий островковый белок III-гамма) является белок что у людей кодируется REG3G ген.^[5][6][7][8]

Клетки кишечника продуцируют REG3G (или REG3 гамма) посредством стимуляции толл-подобные рецепторы (TLR) по патоген-ассоциированные молекулярные паттерны (PAMP). Гамма REG3 специально нацелена Грамположительные бактерии потому что он связывается с их поверхностью пептидогликан слой. Это один из нескольких антимикробных пептидов, производимых клетки Панета.^[9]

Примечания и ссылки

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000143954 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000030017 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Кларк Х.Ф., Гурни А.Л., Абая Э., Бейкер К., Болдуин Д., Кисть Дж., Чен Дж., Чоу Б., Чуи С., Кроули С., Керрелл Б., Деуэл Б., Дауд П., Итон Д., Фостер Дж., Гримальди К., Гу Q , Hass PE, Heldens S, Huang A, Kim HS, Klimowski L, Jin Y, Johnson S, Lee J, Lewis L, Liao D, Mark M, Robbie E, Sanchez C, Schoenfeld J, Seshagiri S, Simmons L, Singh Дж., Смит В., Стинсон Дж., Вагтс А., Вандлен Р., Ватанабе С., Вианд Д., Вудс К., Се М. Х., Янсура Д., Йи С, Ю Дж, Юань Дж, Чжан М, Чжан З, Годдард А., Вуд В. И., Годовски П., Грей А. (октябрь 2003 г.). «Инициатива по открытию секретируемого белка (SPDI), широкомасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: биоинформатическая оценка». Genome Res. 13 (10): 2265–70. Дои:10.1101 / гр.1293003. ЧВК  403697. PMID  12975309.
6. Ната К., Лю И, Сюй Л., Икеда Т., Акияма Т., Ногучи Н., Кавагути С., Ямаути А., Такахаши И., Шервани Н. Дж., Оногава Т., Такасава С., Окамото Х. (сентябрь 2004 г.). «Молекулярное клонирование, экспрессия и хромосомная локализация нового гена семейства REG человека, REG III». Ген. 340 (1): 161–70. Дои:10.1016 / j.gene.2004.06.010. PMID  15556304.
7. Лорин Э, Манивал X, Монжеляр С., Бидо С., Берже-Лефранк Ж.Л., Эрард М., Вердье Ж.М. (март 2005 г.). «PAP IB, новый член семейства генов Reg: клонирование, экспрессия, структурные свойства и эволюция путем дупликации гена» (PDF). Биохим. Биофиз. Acta. 1727 (3): 177–87. Дои:10.1016 / j.bbaexp.2005.01.011. PMID  15777617.
8. «Ген Entrez: регенерация REG3G, полученная из островков 3-гамма».
9. Abreu MT (февраль 2010 г.). «Передача сигналов толл-подобных рецепторов в кишечном эпителии: как распознавание бактериями влияет на функцию кишечника». Nat. Преп. Иммунол. 10 (2): 131–44. Дои:10.1038 / nri2707. PMID  20098461. S2CID  21789611.

Библиография

• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Лаурин Э., Манивал X, Монжелар С. и др. (2005). «PAP IB, новый член семейства генов Reg: клонирование, экспрессия, структурные свойства и эволюция путем дупликации гена». Биохим. Биофиз. Acta. 1727 (3): 177–87. Дои:10.1016 / j.bbaexp.2005.01.011. PMID  15777617.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Чжан З., Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Brandl K, Plitas G, Schnabl B, DeMatteo RP, Pamer EG (2007). «MyD88-опосредованные сигналы индуцируют бактерицидный лектин RegIII гамма и защищают мышей от кишечной инфекции Listeria monocytogenes». J. Exp. Med. 204 (8): 900–1891. Дои:10.1084 / jem.20070563. ЧВК  2118673. PMID  17635956.