RNF12 - RNF12

RLIM
Идентификаторы
Псевдонимы	RLIM, NY-REN-43, RNF12, белок безымянного пальца, взаимодействие домена LIM, MRX61, TOKAS
Внешние идентификаторы	OMIM: 300379 MGI: 1342291 ГомолоГен: 7920 Генные карты: RLIM
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq13.2 Начинать 74,582,976 бп[1] Конец 74,614,624 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X 46,42 см | X Г Начинать 103,957,163 бп[2] Конец 103,981,284 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание ионов металлов • трансферазная активность • активность убиквитин-протеинтрансферазы • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • транскрипционный репрессорный комплекс • ядро клетки • цитозоль • нуклеоплазма Биологический процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция, ДНК-шаблон • убиквитинирование белков • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • полиубиквитинирование белков • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • отрицательная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • случайная инактивация Х-хромосомы • регулирование дозовой компенсации инактивацией Х-хромосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51132	19820
Ансамбль	ENSG00000131263	ENSMUSG00000056537
UniProt	Q9NVW2	Q9WTV7
RefSeq (мРНК)	NM_183353 NM_016120	NM_011276 NM_001358205
RefSeq (белок)	NP_057204 NP_899196	NP_035406 NP_001345134
Расположение (UCSC)	Chr X: 74,58 - 74,61 Мб	Chr X: 103.96 - 103.98 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза RLIM является фермент что у людей кодируется RLIM ген.^[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок цинкового пальца RING-H2. Было показано, что это убиквитиновая протеинлигаза, которая нацелена на связывание домена LIM 1 (LDB1 / CLIM) и вызывает протеасомозависимую деградацию LDB1. Этот белок и LDB1 являются ко-репрессорами LHX1 / LIM-1, фактора транскрипции гомеодомена. Сообщалось об альтернативно сплайсированных вариантах транскрипта, кодирующих один и тот же белок.^[6] Функционирует у самок мышей как регулятор инактивации Х-хромосомы.

Взаимодействия

RNF12 был показан взаимодействовать с Рецептор эстрогена альфа.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131263 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056537 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B., Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (ноябрь 1999 г.). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой». Int. J. Рак. 83 (4): 456–64. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19991112) 83: 4 <456 :: AID-IJC4> 3.0.CO; 2-5. PMID  10508479.
6. «Энтрез Ген: белок 12 безымянного пальца RNF12».
7. Johnsen SA, Güngör C, Prenzel T, Riethdorf S, Riethdorf L, Taniguchi-Ishigaki N, Rau T., Tursun B, Furlow JD, Sauter G, Scheffner M, Pantel K, Gannon F, Bach I (январь 2009 г.). «Регулирование эстроген-зависимой транскрипции кофакторами LIM CLIM и RLIM при раке груди». Рак Res. 69 (1): 128–36. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-1630. ЧВК  2713826. PMID  19117995.

дальнейшее чтение

• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Хиратани И., Ямамото Н., Мотидзуки Т., Омори С.Ю., Тайра М. (2003). «Селективная деградация избытка Ldb1 с помощью Rnf12 / RLIM обеспечивает надлежащие уровни экспрессии Ldb1 и стехиометрию Xlim-1 / Ldb1 в функциях организатора Xenopus». Разработка. 130 (17): 4161–75. Дои:10.1242 / dev.00621. PMID  12874135.
• Остендорф HP, Пейрано Р.И., Петерс М.А., Шлютер А., Боссенц М., Шеффнер М., Бах И. (2002). «Убиквитинин-зависимый обмен кофактора на факторах транскрипции гомеодомена LIM». Природа. 416 (6876): 99–103. Дои:10.1038 / 416099a. PMID  11882901.
• Остендорф ХП, Боссенц М., Минчева А., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Лихтер П., Бах I (2000). «Функциональная характеристика гена, кодирующего RLIM, корепрессора факторов гомеодомена LIM». Геномика. 69 (1): 120–30. Дои:10.1006 / geno.2000.6311. PMID  11013082.
• Бах I, Родригес-Эстебан С., Каррьер С., Бхушан А., Кронес А., Роуз Д. В., Гласс С. К., Андерсен Б., Изписуа Бельмонте Дж. К., Розенфельд М. Г. (1999). «RLIM ингибирует функциональную активность факторов транскрипции гомеодомена LIM посредством рекрутирования комплекса гистондеацетилазы». Nat. Genet. 22 (4): 394–9. Дои:10.1038/11970. PMID  10431247.
• Шин Дж., Боссенц М., Чунг И, Ма Х, Байрон М., Танигучи-Исигаки Н., Чжу Х, Цзяо Б., Холл Л.Л., Грин М.Р., Джонс С.Н., Херманс-Боргмейер И., Лоуренс Дж. Б., Бах I. «Материнский Rnf12 / RLIM необходим для инактивации импринтированной Х-хромосомы у мышей». Природа. 467 (7318): 977–81. Дои:10.1038 / природа09457. ЧВК  2967734. PMID  20962847.
• Цзяо Б., Танигучи-Исигаки Н., Гюнгор С., Петерс М.А., Чен Ю.В., Ритдорф С., Друнг А., Арониан Л.Г., Шин Дж., Пагнис Р., Пантел К., Тачибана Т., Льюис Б.К., Йонсен С.А., Бах I. «Функциональная активность RLIM / Rnf12 регулируется зависимым от фосфорилирования ядерно-цитоплазматическим перемещением». Клетка Mol Biol. 24 (19): 3085–96. Дои:10.1091 / mbc.E13-05-0239. ЧВК  3784382. PMID  23904271.