RRAGA - RRAGA

RRAGA
Идентификаторы
Псевдонимы	RRAGA, FIP-1, FIP1, RAGA, связанное с Ras связывание GTP A
Внешние идентификаторы	OMIM: 612194 MGI: 1915691 ГомолоГен: 68522 Генные карты: RRAGA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9п22.1 Начинать 19,049,427 бп[1] Конец 19,051,025 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 C4 Начинать 86,575,668 бп[2] Конец 86,577,285 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • активность гомодимеризации белков • Связывание GTP • связывание фосфопротеина • GO: 0001948 связывание с белками • ГТФазная активность • связывание убиквитин-протеин-лигазы • активность гетеродимеризации белков Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • ГАТОР1 комплекс • лизосомальная мембрана • лизосома • ядро клетки • ЭГО комплекс • Gtr1-Gtr2 GTPase комплекс Биологический процесс • клеточный ответ на аминокислотное голодание • смерть клетки • положительная регуляция цитолиза • положительная регуляция передачи сигналов TORC1 • локализация клеточного белка • модуляция вирусом морфологии или физиологии хозяина • остановка клеточного цикла • клеточный ответ на аминокислотный стимул • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция аутофагии • положительная регуляция передачи сигналов TOR • апоптотический процесс • убиквитинирование белков • регуляция макроаутофагии • клеточный ответ на голодание • регуляция аутофагии Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10670	68441
Ансамбль	ENSG00000155876	ENSMUSG00000070934
UniProt	Q7L523	Q80X95
RefSeq (мРНК)	NM_006570	NM_178376
RefSeq (белок)	NP_006561	NP_848463
Расположение (UCSC)	Chr 9: 19.05 - 19.05 Мб	Chr 4: 86,58 - 86,58 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связанный с Ras GTP-связывающий белок A это белок что у людей кодируется RRAGA ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

RRAGA была показана взаимодействовать с NOL8^[8] и RRAGC.^[9][10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000155876 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070934 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Schürmann A, Brauers A, Massmann S, Becker W, Joost HG (декабрь 1995 г.). «Клонирование нового семейства GTP-связывающих белков млекопитающих (raga d, RagBs, RagB1) с отдаленным сходством с Ras-родственными GTPases». Журнал биологической химии. 270 (48): 28982–8. Дои:10.1074 / jbc.270.48.28982. PMID  7499430.
6. Ли И, Кан Дж, Хорвиц М.С. (февраль 1997 г.). «Взаимодействие аденовирусного 14,7-килодальтонного белкового ингибитора цитолиза фактора некроза опухоли альфа с новым членом суперсемейства ГТФаз сигнальных преобразователей». Журнал вирусологии. 71 (2): 1576–82. Дои:10.1128 / JVI.71.2.1576-1582.1997. ЧВК  191215. PMID  8995684.
7. «Ген Entrez: RRAGA Ras-связанное с GTP связывание A».
8. Секигучи Т., Тодака Ю., Ван И, Хиросе Э, Накашима Н., Нисимото Т. (февраль 2004 г.). «Новый ядрышковый белок человека, Nop132, связывается с белками G, RRAG A / C / D». Журнал биологической химии. 279 (9): 8343–50. Дои:10.1074 / jbc.M305935200. PMID  14660641.
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
10. Секигучи Т., Хиросе Э, Накашима Н., Ии М., Нисимото Т. (март 2001 г.). «Новые белки G, Rag C и Rag D, взаимодействуют с GTP-связывающими белками, Rag A и Rag B». Журнал биологической химии. 276 (10): 7246–57. Дои:10.1074 / jbc.M004389200. PMID  11073942.

дальнейшее чтение

• Хиросе Э., Накашима Н., Сэкигути Т., Нисимото Т. (январь 1998 г.). «RagA является функциональным гомологом S. cerevisiae Gtr1p, участвующим в пути Ran / Gsp1-GTPase». Журнал клеточной науки. 111 (Pt 1) (1): 11–21. PMID  9394008.
• Секигучи Т., Хиросе Э, Накашима Н., Ии М., Нисимото Т. (март 2001 г.). «Новые белки G, Rag C и Rag D, взаимодействуют с GTP-связывающими белками, Rag A и Rag B». Журнал биологической химии. 276 (10): 7246–57. Дои:10.1074 / jbc.M004389200. PMID  11073942.
• Секигучи Т., Тодака Ю., Ван И, Хиросе Э, Накашима Н., Нисимото Т. (февраль 2004 г.). «Новый ядрышковый белок человека, Nop132, связывается с белками G, RRAG A / C / D». Журнал биологической химии. 279 (9): 8343–50. Дои:10.1074 / jbc.M305935200. PMID  14660641.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.