RUFY1 - RUFY1

RUFY1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2YQM, 2YW8
Идентификаторы
Псевдонимы	RUFY1, RABIP4, ZFYVE12, RUN и FYVE домен, содержащий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 610327 MGI: 2429762 ГомолоГен: 23522 Генные карты: RUFY1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q35.3 Начинать 179,550,554 бп[1] Конец 179,610,012 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.3 Начинать 50,389,286 бп[2] Конец 50,431,125 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • связывание липидов • Привязка домена SH3 • Привязка домена SH2 Сотовый компонент • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • мембрана • цитоплазма • цитозоль • ядерное пятнышко • мембрана ранней эндосомы • эндосома • ядро клетки Биологический процесс • транспорт белка • эндоцитоз • процесс биосинтеза фосфатидилинозита • регуляция эндоцитоза • передача сигнала, опосредованная малой GTPase Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	80230	216724
Ансамбль	ENSG00000284260 ENSG00000176783	ENSMUSG00000020375
UniProt	Q96T51	Q8BIJ7
RefSeq (мРНК)	NM_001040451 NM_001040452 NM_025158	NM_172557
RefSeq (белок)	NP_001035541 NP_001035542 NP_079434	NP_766145
Расположение (UCSC)	Chr 5: 179,55 - 179,61 Мб	Chr 11: 50.39 - 50.43 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок 1, содержащий RUN и FYVE домен это белок что у людей кодируется RUFY1 ген.^[5][6] Он назван в честь ПРОБЕГ и FYVE домены, которые он содержит.

Взаимодействия

RUFY1 был показан взаимодействовать с BMX.^[5]

Рекомендации

1. ENSG00000176783 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000284260, ENSG00000176783 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020375 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ян Дж, Ким О, Ву Дж, Цю Ю (август 2002 г.). «Взаимодействие между тирозинкиназой Etk и белком RUFY1, содержащим RUN-домен и домен FYVE. Возможная роль ETK в регуляции переноса везикул». J. Biol. Chem. 277 (33): 30219–26. Дои:10.1074 / jbc.M111933200. PMID  11877430.
6. "Entrez Gene: RUFY1 RUN и домен FYVE, содержащий 1".

дальнейшее чтение

• Кормонт М, Мари М, Галмиш А, Хофман П, Ле Маршан-Брюстель Y (2001). «FYVE-finger-содержащий белок, Rabip4, является эффектором Rab4, участвующим в раннем эндосомном движении». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (4): 1637–42. Дои:10.1073 / pnas.031586998. ЧВК  29309. PMID  11172003.
• Fouraux MA, Deneka M, Ivan V, van der Heijden A, Raymackers J, van Suylekom D, van Venrooij WJ, van der Sluijs P, Pruijn GJ (2004). «Rabip4 'является эффектором rab5 и rab4 и регулирует транспорт через ранние эндосомы». Мол. Биол. Клетка. 15 (2): 611–24. Дои:10.1091 / mbc.E03-05-0343. ЧВК  329268. PMID  14617813.
• Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Genome Res. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.