Буфер для анализа радиоиммунопреципитации - Radioimmunoprecipitation assay buffer

Буфер для анализа радиоиммунопреципитации (Буфер RIPA) - это буфер для лизиса привыкший лизировать клетки и ткани для радио иммунопреципитация проба (RIPA).[1][2] Этот буфер более денатурирует, чем НП-40 или же Тритон Х-100 потому что он содержит ионные детергенты SDS и дезоксихолат натрия в качестве активных компонентов и особенно полезен для разрушения ядерных мембран при приготовлении ядерных экстрактов. Буфер RIPA дает низкий фон, но может денатурировать киназы.

Рецепт приготовления

Рецепты буферов RIPA незначительно различаются у разных авторов и могут включать:

  • 10-50 мМ Трис -HCl (10 мМ фосфат натрия может использоваться вместо), pH 7–8
  • 150 мМ NaCl для поддержания осмотического давления, близкого к физиологическому.
  • неионогенные моющие средства (1% Triton X-100 или НП-40 ) для предотвращения неспецифических взаимодействий между белками или с пробиркой
  • анионные моющие средства (0,1-0,5% дезоксихолат, 0.1-0.5% SDS ). Это необходимо оптимизировать для каждого анализа: чем выше концентрация, тем чище результат, но тем ниже сигнал.

Следующие ингредиенты не являются обязательными и включаются по мере необходимости:

  • Протеаза ингибиторы (1 мМ PMSF (свежий из 1 M исходного раствора в изопропаноле), 1 мкг / мл каждого лейпептин, апротинин, пепстатин, 1-5 мМ EDTA, 0,5-1 мМ EGTA, 5 мМ аминокапроновая кислота ) или коммерческий коктейль ингибиторов протеазы (использовать согласно инструкции производителя)
  • По 1 мМ Na3VO4 и Na4п2О7 как ингибитор фосфатазы (если статус фосфорилирования важен)
  • 1 мМ NaF в качестве консерванта (очень токсичен!)
  • 5-10 мМ дитиотреитол (DTT) или β-меркаптоэтанол как антиоксидант. DTT дороже, чем βME, но его окислительно-восстановительный потенциал лучше подходит для связи Cys-Cys.

Рекомендации

  1. ^ Алькарас К., Де Диего М., пастор М.Дж., Эскрибано Д.М. (июль 1990 г.). «Сравнение анализа радиоиммунопреципитации с иммуноблоттингом и ELISA для обнаружения антител к вирусу африканской чумы свиней». J. Vet. Диаг. Вкладывать деньги. 2 (3): 191–6. Дои:10.1177/104063879000200307. PMID  2094444.
  2. ^ Ngoka LC (октябрь 2008 г.). «Подготовка образцов для протеомики рака груди: протеомика и генная онтология выявляют резкие различия в предпочтениях солюбилизации белка в анализе радиоиммунопреципитации и буферах для лизиса мочевины». Proteome Sci. 6 (1): 30. Дои:10.1186/1477-5956-6-30. ЧВК  2600628. PMID  18950484.