РасМол - RasMol

РасМол
Черный фон со сложной ленточной диаграммой белка, окрашенный в синий цвет сверху, зеленый снизу.
РасМол ленточная диаграмма рендеринг тримера TRAF2 PDB: 1DOA
Оригинальный автор (ы)Роджер А. Сэйл
Разработчики)Герберт Дж. Бернштейн
изначальный выпуск1992; 28 лет назад (1992)
Стабильный выпуск
2.7.5.1 / 17 июля 2009 г.; 11 лет назад (2009-07-17)
Репозиторий
Отредактируйте это в Викиданных
Написано вC
Операционная системаUnix, Windows
ПлатформаIA-32, x86-64
Доступно ванглийский
ТипМолекулярная графика
ЛицензияGPL
Интернет сайтwww.rasmol.org

РасМол это компьютерная программа, написанная для молекулярная графика визуализация предназначена и используется в основном для изображения и исследования биологические структуры макромолекул, например, найденные в Банк данных белков. Первоначально он был разработан Роджером Сейлом в начале 1990-х годов.[1]

Исторически это был важный инструмент для молекулярных биологов, поскольку чрезвычайно оптимизированная программа позволяла программе работать на (тогда) скромно мощных. персональные компьютеры. До RasMol программное обеспечение для визуализации работало на графических рабочих станциях, которые из-за своей стоимости были менее доступны для ученых. РасМол по-прежнему играет важную роль в исследованиях в области структурной биологии и играет важную роль в образовании.

РасМол имеет комплекс лицензирование история версий. Начиная с версии 2.7 серии,[2] РасМол исходный код является с двойной лицензией под Стандартная общественная лицензия GNU (GPL) или индивидуальная лицензия РАСЛИК.[3] Начиная с версии 2.7.5, GPL является единственной лицензией, действующей для двоичных дистрибутивов.

РасМол включает язык сценариев, для выполнения многих функций, таких как выбор определенных белок цепочки, изменение цвета и т. д. Jmol и Сириус программное обеспечение включило этот язык в свои команды.

Банк данных белков (PDB) файлы могут быть загружены для визуализации у членов Всемирный банк данных о белках (wwPDB). Они были загружены исследователями, охарактеризовавшими структуру молекулы обычно Рентгеновская кристаллография, белок ЯМР спектроскопия, или криоэлектронная микроскопия.

Межпроцессного взаимодействия

Расмол может общаться с другими программами через Tcl /Тк на Unix платформы и через Динамический обмен данными (DDE) на Майкрософт Виндоус.

С множественное выравнивание последовательностей программы, ответственный класс Java может свободно использоваться в других приложениях.[4]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ Роджер Сэйл и Э. Джеймс Милнер-Уайт. "RasMol: Биомолекулярная графика для всех", Trends in Biochemical Sciences (TIBS), сентябрь 1995 г., Vol. 20, № 9, с. 374
  2. ^ Герберт Дж. Бернштейн, «Недавние изменения в RasMol, объединяющие варианты, Trends in Biochemical Sciences (TIBS), сентябрь 2000 г., том 25, № 9, стр. 453-455.
  3. ^ Лицензия RASLIC
  4. ^ Программа множественной центровки

внешние ссылки