S100A4 - S100A4

S100A4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1М31, 2LNK, 2МРД, 2Q91, 3C1V, 3CGA, 3KO0, 3M0W, 3ZWH, 4CFQ, 4CFR, 4ETO, 4ХСЗ
Идентификаторы
Псевдонимы	S100A4, 18A2, 42A, CAPL, FSP1, MTS1, P9KA, PEL98, кальций-связывающий белок A4 S100
Внешние идентификаторы	OMIM: 114210 MGI: 1330282 ГомолоГен: 7924 Генные карты: S100A4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.3 Начинать 153,543,613 бп[1] Конец 153,550,136 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 F1 | 3 39,27 см Начинать 90,603,771 бп[2] Конец 90,606,045 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • связывание актина • GO: 0001948 связывание с белками • кальций-зависимое связывание с белками • связывание ионов металлов • Связывание рецептора RAGE • Связывание РНК • связывание ионов переходных металлов • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • перинуклеарная область цитоплазмы • проекция нейрона • внеклеточная экзосома • ядро клетки • внеклеточный • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • положительная регуляция передачи сигналов I-kappaB киназы / NF-kappaB • эпителиально-мезенхимальный переход Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6275	20198
Ансамбль	ENSG00000196154	ENSMUSG00000001020
UniProt	P26447	P07091
RefSeq (мРНК)	NM_019554 NM_002961	NM_011311
RefSeq (белок)	NP_002952 NP_062427	NP_035441
Расположение (UCSC)	Chr 1: 153,54 - 153,55 Мб	Chr 3: 90.6 - 90.61 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

S100 кальций-связывающий белок A4 (S100A4) это белок что у людей кодируется S100A4 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков S100, содержащих 2 EF-рука кальций-связывающие мотивы. Белки S100 локализованы в цитоплазме и / или ядре широкого круга клеток и участвуют в регуляции ряда клеточных процессов, таких как прогрессия и дифференцировка клеточного цикла. Гены S100 включают по крайней мере 13 членов, которые расположены в виде кластера на хромосоме 1q21. Этот белок может участвовать в подвижности, инвазии и полимеризации тубулина. Хромосомные перестройки и измененная экспрессия этого гена вовлечены в метастазирование опухоли. Идентифицировано несколько альтернативно сплайсированных вариантов, кодирующих один и тот же белок.^[6]

Взаимодействия

S100A4 был показан взаимодействовать с Кальций-связывающий белок A1 S100.^[7][8]

Терапевтическое нацеливание на рак

S100A4, член семейства кальций-связывающих белков S100, секретируемых опухолевыми и стромальными клетками, поддерживает онкогенез путем стимуляции ангиогенеза. Исследования показали, что S100A4 взаимодействует с фактором роста эндотелия сосудов (VEGF) через рецептор RAGE, способствуя миграции эндотелиальных клеток за счет увеличения экспрессии KDR и активности MMP-9. Сверхэкспрессия S100A4 in vivo приводила к значительному увеличению роста опухоли и васкуляризации в модели ксенотрансплантата M21 меланомы человека. И наоборот, при подавлении S100A4 с помощью технологии shRNA резкое снижение развития опухоли поджелудочной железы MIA PaCa-2 линия клеток наблюдалась. На основании этих результатов было разработано 5C3, нейтрализующее моноклональное антитело против S100A4. Это антитело устраняет миграцию эндотелиальных клеток, рост опухоли и ангиогенез в иммунодефицитных моделях ксенотрансплантатов мышей MiaPACA-2 и M21-S100A4. Сделан вывод, что внеклеточное ингибирование S100A4 является привлекательным подходом для лечения рака человека.^[9]

S100A4 тесно связан с компонентами цитоскелета, и когда этот ген активируется, он изменяет морфологию клетки, делая ее более восприимчивой к инвазии со стороны белков, таких как катепсин B и циклин B1, которые способствуют метастазированию.^[10] Вместе эти факторы образуют гигантские полиплоидные раковые клетки (PGCC), которые обладают высокой пролиферацией и инвазивностью. Экспериментальные данные нокаут-терапии показали, что S100A4 демонстрирует форму контроля над катепсином B и циклином B1, и что его подавление может снизить инвазивные возможности PGCC и их дочерних клеток. Исследования инвазивного рака груди показали, что S100A4 играет важную роль в отложении коллагена высокой плотности, что является одним из клинических симптомов метастазирования опухоли. Значительно более высокие уровни S100A4 были обнаружены в образцах, которые демонстрировали метастазы в лимфатические узлы, чем в тех, которые этого не сделали, что указывает на то, что аномальное отложение коллагена может быть вызвано S100A4.^[11] Сверхэкспрессия S100A4 не только способствует образованию различных видов рака, но также вносит свой вклад в патологические факторы, связанные с раком и его прогрессированием.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000196154 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001020 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Stoler A, Bouck N (март 1985 г.). «Идентификация одной хромосомы в нормальном геноме человека, необходимая для подавления трансформации клеток хомяка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 82 (2): 570–4. Дои:10.1073 / пнас.82.2.570. ЧВК  397082. PMID  3155863.
6. «Энтрез Ген: S100A4 S100 кальций-связывающий белок A4».
7. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
8. Ван Г., Рудланд П.С., Уайт М.Р., Барраклаф Р. (апрель 2000 г.). «Взаимодействие in vivo и in vitro индуцирующего метастазирование белка S100, S100A4 (p9Ka) с S100A1». J. Biol. Chem. 275 (15): 11141–6. Дои:10.1074 / jbc.275.15.11141. PMID  10753920.
9. Эрнандес Дж. Л., Падилья Л., Дахель С., Колл Т., Эрвас Р., Адан Дж., Маса М., Митянс Ф., Мартинес Дж. М., Кома С., Родригес Л., Ноэ В., Сьюдад С. Дж., Бласко Ф., Мессегер Р. (сентябрь 2013 г.). «Терапевтическое воздействие на рост опухоли и ангиогенез с помощью нового моноклонального антитела против S100A4». PLOS ONE. 8: e72480. Дои:10.1371 / journal.pone.0072480. ЧВК  3762817. PMID  24023743.
10. Фей Ф., Лю К., Ли С. и др. Молекулярные механизмы, с помощью которых S100A4 регулирует миграцию и инвазию PGCC с их дочерними клетками при колоректальном раке человека. Фасад Онкол. 2020; 10: 182.
11. Вэнь Х, Ю Х, Тиан И и др. Количественная эластография сдвиговой волной при первичном инвазивном раке молочной железы, основанная на патологии коллагена-S100A4, указывает на метастазы в подмышечные лимфатические узлы. Quant Imaging Med Surg. 2020; 10 (3): 624-633.

дальнейшее чтение

• Каллури Р., Нейлсон Э. Г. (2003). «Эпителиально-мезенхимальный переход и его значение для фиброза». J. Clin. Вкладывать деньги. 112 (12): 1776–84. Дои:10.1172 / JCI20530. ЧВК  297008. PMID  14679171.
• Гаррет СК, Варни К.М., Вебер Д.И., Бресник А.Р. (2006). «S100A4, медиатор метастазирования». J. Biol. Chem. 281 (2): 677–80. Дои:10.1074 / jbc.R500017200. PMID  16243835.
• Тарабыкина С., Гриффитс Т.Р., Тульчинский Э., Меллон Дж. К., Бронштейн И.Б., Кряевская М. (2007). «Связанный с метастазами белок S100A4: внимание к его роли в миграции клеток». Цели лекарств от рака Curr. 7 (3): 217–28. Дои:10.2174/156800907780618329. PMID  17504119.
• Тульчинский Э., Форд Х.Л., Крамеров Д, Решетняк Э., Григорян М, Заин С, Луканидин Э. (1992). «Транскрипционный анализ гена mts1 со специфической ссылкой на 5'-фланкирующие последовательности». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (19): 9146–50. Дои:10.1073 / пнас.89.19.9146. ЧВК  50082. PMID  1329089.
• Энгелькамп Д., Шефер Б.В., Эрне П., Хейцманн К.В. (1992). «S100 альфа, CAPL и CACY: молекулярное клонирование и анализ экспрессии трех кальций-связывающих белков из сердца человека». Биохимия. 31 (42): 10258–64. Дои:10.1021 / bi00157a012. PMID  1384693.
• Томида Ю., Терасава М., Кобаяси Р., Хидака Х. (1992). «Кальциклин и кальваскулин существуют в тромбоцитах человека». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 189 (3): 1310–6. Дои:10.1016 / 0006-291X (92) 90216-8. PMID  1482346.
• Амбарцумян Н, Тарабыкина С, Григорян М, Тульчинский Э, Хулгаард Э, Георгиев Г, Луканидин Э (1995). «Характеристика двух вариантов сплайсинга гена mts1 человека, ассоциированного с метастазами». Ген. 159 (1): 125–30. Дои:10.1016 / 0378-1119 (94) 00778-Q. PMID  7607566.
• Шефер Б.В., Вики Р., Энгелькамп Д., Маттей М.Г., Хейцманн С.В. (1995). «Выделение клона YAC, покрывающего кластер из девяти генов S100 на хромосоме 1q21 человека: обоснование новой номенклатуры семейства кальций-связывающих белков S100». Геномика. 25 (3): 638–43. Дои:10.1016/0888-7543(95)80005-7. PMID  7759097.
• Такенага К., Накамура Ю., Сакияма С., Хасегава Ю., Сато К., Эндо Х. (1994). «Связывание белка pEL98, кальций-связывающего белка, связанного с S100, с немышечным тропомиозином». J. Cell Biol. 124 (5): 757–68. Дои:10.1083 / jcb.124.5.757. ЧВК  2119958. PMID  8120097.
• Педрокки М., Шефер Б.В., Дюруссель И., Кокс Дж. А., Хейцманн К. В. (1994). «Очистка и характеристика рекомбинантных человеческих кальций-связывающих белков S100 CAPL и CACY». Биохимия. 33 (21): 6732–8. Дои:10.1021 / bi00187a045. PMID  8204608.
• Энгелькамп Д., Шефер Б.В., Маттей М.Г., Эрне П., Хейцманн К.В. (1993). «Шесть генов S100 сгруппированы на хромосоме 1q21 человека: идентификация двух генов, кодирующих два ранее неизвестных кальций-связывающих белка S100D и S100E». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 90 (14): 6547–51. Дои:10.1073 / пнас.90.14.6547. ЧВК  46969. PMID  8341667.
• Ford HL, Silver DL, Kachar B, Sellers JR, Zain SB (1997). «Влияние Mts1 на структуру и активность немышечного миозина II». Биохимия. 36 (51): 16321–7. Дои:10.1021 / bi971182l. PMID  9405067.
• Лю Дж. Х., Вэй С., Бернетт П. К., Гамеро А. М., Хаттон М., Джеу Дж. Й. (1999). «Функциональная ассоциация рецептора TGF-бета II с циклином B». Онкоген. 18 (1): 269–75. Дои:10.1038 / sj.onc.1202263. PMID  9926943.
• Ван Г., Рудланд П.С., Уайт М.Р., Барраклаф Р. (2000). «Взаимодействие in vivo и in vitro индуцирующего метастазирование белка S100, S100A4 (p9Ka) с S100A1». J. Biol. Chem. 275 (15): 11141–6. Дои:10.1074 / jbc.275.15.11141. PMID  10753920.
• Тарабыкина С., Кряевска М., Скотт Д. Д., Хилл Т. Дж., Лафит Д., Деррик П. Дж., Додсон Г. Г., Луканидин Е., Бронштейн И. (2000). «Образование гетерокомплекса между связанным с метастазами белком S100A4 (Mts1) и S100A1, как выявлено с помощью дрожжевой двухгибридной системы». FEBS Lett. 475 (3): 187–91. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01652-5. PMID  10869553.
• Тарабыкина С., Скотт Д. Дж., Герзик П., Хилл Т. Дж., Тейм Дж. Р., Криаевска М., Лафит Д., Деррик П. Дж., Додсон Г. Г., Мейтленд Н. Дж., Луканидин Е. М., Бронштейн И. Б. (2001). «Интерфейс димеризации ассоциированного с метастазами белка S100A4 (Mts1): исследования in vivo и in vitro». J. Biol. Chem. 276 (26): 24212–22. Дои:10.1074 / jbc.M009477200. PMID  11278510.
• Григорян М., Андресен С., Тульчинский Е., Кряевская М., Карлберг С., Крузе С., Кон М., Амбарцумян Н., Кристенсен А., Селиванова Г., Луканидин Е. (2001). «Опухолевый супрессор р53 - новая мишень для ассоциированного с метастазами белка Mts1 / S100A4: функциональные последствия их взаимодействия». J. Biol. Chem. 276 (25): 22699–708. Дои:10.1074 / jbc.M010231200. PMID  11278647.
• Чен Х., Ферниг Д.Г., Рудланд П.С., Спаркс А., Уилкинсон М.С., Барраклаф Р. (2001). «Связывание с внутриклеточными мишенями белка, вызывающего метастазирование, S100A4 (p9Ka)». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 286 (5): 1212–7. Дои:10.1006 / bbrc.2001.5517. PMID  11527429.
• Чжан Х, Ван З., Дин И, Ван Г, Ван Х, Бартлам М., Тан Х, Лю И, Цзян Ф, Барраклаф Р., Рудланд П. С., Рао З. (2002). «Кристаллизация и предварительный кристаллографический анализ белка, вызывающего метастазы, человеческого S100A4». Acta Crystallogr. D. 58 (Пт 1): 127–9. Дои:10.1107 / S090744490101650X. PMID  11752788.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P26447 (Белок S100-A4) на PDBe-KB.