SAE1 - SAE1

SAE1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1Y8Q, 1Y8R, 3KYC, 3KYD
Идентификаторы
Псевдонимы	SAE1, AOS1, HSPC140, SUA1, UBLE1A, SUMO1, активирующий фермент субъединица 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 613294 MGI: 1929264 ГомолоГен: 4019 Генные карты: SAE1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.32 Начните 47,113,274 бп[1] Конец 47,210,636 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 A2 | 7 8,88 см Начните 16,320,234 бп[2] Конец 16,387,806 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • убиквитин, активирующий активность ферментов • SUMO, активирующий активность ферментов • GO: 0010577 активность активатора фермента • активность лигазы • связывание с С-концом белка • убиквитин-подобный модификатор, активирующий ферментативную активность • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание с АТФ-зависимым белком • небольшой белок, активирующий связывание ферментов • активность гетеродимеризации белков Сотовый компонент • SUMO активирующий ферментный комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • цитоплазма Биологический процесс • процесс модификации клеточного белка • белковое сумоилирование • убиквитинирование белков • положительное регулирование доставки белка в митохондрии • GO: 0048554 положительное регулирование каталитической активности Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	10055	56459
Ансамбль	ENSG00000142230	ENSMUSG00000052833
UniProt	Q9UBE0	Q9R1T2
RefSeq (мРНК)	NM_001145713 NM_001145714 NM_005500	NM_001285891 NM_001285892 NM_019748
RefSeq (белок)	NP_001139185 NP_001139186 NP_005491	NP_001272820 NP_001272821 NP_062722
Расположение (UCSC)	Chr 19: 47.11 - 47.21 Мб	Chr 7: 16.32 - 16.39 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 1 SUMO-активирующего фермента это белок что у людей кодируется SAE1 ген.^[5][6][7][8]

Взаимодействия

SAE1 был показан взаимодействовать с участием SAE2.^{[5][7][9][10]}

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000142230 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052833 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Desterro JM, Rodriguez MS, Kemp GD, Hay RT (май 1999 г.). «Идентификация фермента, необходимого для активации небольшого убиквитиноподобного белка SUMO-1». J. Biol. Chem. 274 (15): 10618–24. Дои:10.1074 / jbc.274.15.10618. PMID  10187858.
6. Окума Т., Хонда Р., Итикава Г., Цумагари Н., Ясуда Н. (март 1999 г.). «Модификация SUMO-1 in vitro требует двух ферментативных стадий, E1 и E2». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 254 (3): 693–8. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9995. PMID  9920803.
7. Гонг Л., Ли Б., Миллас С., Йе Э. Т. (июнь 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческих AOS1 и UBA2, компонентов комплекса ферментов, активирующих сентрин». FEBS Lett. 448 (1): 185–9. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00367-1. PMID  10217437. S2CID  7756078.
8. «Ген Entrez: субъединица 1 активирующего фермента SAE1 SUMO1».
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
10. Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

дальнейшее чтение

• Чжан QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Ху GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми рамками считывания для 300 ранее не определенных генов, экспрессируемых в CD34 + гематопоэтических стволовых / предшественниках». Genome Res. 10 (10): 1546–60. Дои:10.1101 / гр.140200. ЧВК  310934. PMID  11042152.
• Татам М.Х., Джаффрей Э., Воган О.А., Дестерро Дж. М., Боттинг С.Х., Нейсмит Дж. Х., Хэй RT (2001). «Полимерные цепи SUMO-2 и SUMO-3 конъюгированы с белковыми субстратами с помощью SAE1 / SAE2 и Ubc9». J. Biol. Chem. 276 (38): 35368–74. Дои:10.1074 / jbc.M104214200. PMID  11451954.
• Адзума Й., Тан Ш., Кавенах М. М., Айнштейн А. М., Сайто Х., Дассо М. (2001). «Экспрессия и регуляция фермента SUMO-1 E1 млекопитающих». FASEB J. 15 (10): 1825–7. Дои:10.1096 / fj.00-0818fje. PMID  11481243. S2CID  40471133.
• Татхам М.Х., Ким С., Ю Би, Джафрей Э, Сонг Дж, Чжэн Дж, Родригес М.С., Хэй РТ, Чен Й (2003). «Роль N-концевого сайта Ubc9 в связывании и конъюгации SUMO-1, -2 и -3». Биохимия. 42 (33): 9959–69. Дои:10.1021 / bi0345283. PMID  12924945.
• Ота Т, Сузуки Й, Нисикава Т, Оцуки Т, Сугияма Т, Ириэ Р., Вакамацу А, Хаяши К., Сато Х, Нагаи К., Кимура К., Макита Х, Секин М, Обаяши М, Ниси Т, Сибахара Т, Танака Т , Ishii S, Yamamoto J, Saito K, Kawai Y, Isono Y, Nakamura Y, Nagahari K, Murakami K, Yasuda T., Iwayanagi T, Wagatsuma M, Shiratori A, Sudo H, Hosoiri T, Kaku Y, Kodaira H, Kondo H, Sugawara M, Takahashi M, Kanda K, Yokoi T, Furuya T., Kikkawa E, Omura Y, Abe K, Kamihara K, Katsuta N, Sato K, Tanikawa M, Yamazaki M, Ninomiya K, Ishibashi T, Yamashita H, Муракава К., Фудзимори К., Танай Х, Кимата М, Ватанабэ М, Хираока С., Чиба Й, Исида С., Оно Й, Такигути С., Ватанабэ С., Йосида М., Хотута Т., Кусано Дж., Канехори К., Такахаши-Фуджи А., Hara H, Tanase TO, Nomura Y, Togiya S, Komai F, Hara R, Takeuchi K, Arita M, Imose N, Musashino K, Yuuki H, Oshima A, Sasaki N, Aotsuka S, Yoshikawa Y, Matsunawa H, Ichihara T , Шиохата Н., Сано С., Мория С., Момияма Х, Сато Н., Таками С., Терашима Й, Судзуки О, Накагава С., Сено А, Мидзогути Х, Гото Y, Симидзу Ф, Вакебе Х, Хишигаки Х, Ватанабе Т, Сугияма А, Такемото М, Каваками Б, Ямазаки М, Ватанабэ К., Кумагаи А, Итакура С, Фукузуми Й, Фудзимори Й, Комияма М, Таширо Х, Танигами А , Fujiwara T, Ono T, Yamada K, Fujii Y, Ozaki K, Hirao M, Ohmori Y, Kawabata A, Hikiji T, Kobatake N, Inagaki H, Ikema Y, Okamoto S, Okitani R, Kawakami T, Noguchi S, Itoh Т, Сигета К., Сенба Т, Мацумура К., Накадзима Й, Мидзуно Т, Моринага М, Сасаки М, Тогаши Т, Ояма М, Хата Х, Ватанабэ М, Комацу Т, Мидзусима-Сугано Дж, Сато Т, Сираи Й, Такахаси Й, Накагава К., Окумура К., Нагасе Т., Номура Н., Кикучи Х., Масухо Ю., Ямасита Р., Накай К., Яда Т., Накамура И., Охара О, Исогай Т., Сугано С. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Комацу Т., Мизусаки Х., Мукаи Т, Огава Х., Баба Д., Сиракава М., Хатакеяма С., Накаяма К.И., Ямамото Х., Кикучи А., Морохаши К. (2004). «Небольшая убиквитин-подобная модификатор 1 (SUMO-1) модификация мотива контроля синергии Ad4-связывающего белка / стероидогенного фактора 1 (Ad4BP / SF-1) регулирует синергетическую транскрипцию между Ad4BP / SF-1 и Sox9». Мол. Эндокринол. 18 (10): 2451–62. Дои:10.1210 / me.2004-0173. PMID  15192080.
• Салинас С., Бриансон-Маржолле А., Босис Дж., Лопес М.А., Пехачик М., Яриэль-Энконтре I, Дебант А., Хипскинд Р.А. (2004). «SUMOylation регулирует ядерно-цитоплазматическое перемещение Elk-1». J. Cell Biol. 165 (6): 767–73. Дои:10.1083 / jcb.200310136. ЧВК  2172397. PMID  15210726.
• Лин Дж.Й., Охима Т., Шимотохно К. (2004). «Ассоциация Ubc9, лигазы E2 для конъюгации SUMO, с p53 регулируется фосфорилированием p53». FEBS Lett. 573 (1–3): 15–8. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.07.059. PMID  15327968. S2CID  34290197.
• Боггио Р., Коломбо Р., Хэй RT, Draetta GF, Chiocca S (2004). «Механизм ингибирования пути SUMO». Мол. Ячейка. 16 (4): 549–61. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.11.007. PMID  15546615.
• Лоис Л. М., Лима CD (2005). «Структуры SUMO E1 предоставляют механистическое понимание активации SUMO и рекрутирования E2 в E1». EMBO J. 24 (3): 439–51. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600552. ЧВК  548657. PMID  15660128.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Кленк С., Хамрих Дж., Квиттерер Ю., Лозе М.Дж. (2006). «SUMO-1 контролирует стабильность белка и биологическую функцию фосдуцина». J. Biol. Chem. 281 (13): 8357–64. Дои:10.1074 / jbc.M513703200. PMID  16421094.
• Ли Т., Сантокайт Р., Шен Р.Ф., Текле Э, Ван Г, Ян округ Колумбия, Чок ПБ (2006). «Общий подход к исследованию ферментативных путей и субстратов для убиквитиноподобных модификаторов». Arch. Biochem. Биофизы. 453 (1): 70–4. Дои:10.1016 / j.abb.2006.03.002. PMID  16620772.
• Пан X, Ли Х, Чжан П, Цзинь Би, Ман Дж, Тянь Л., Су Г, Чжао Дж, Ли В, Лю Х, Гонг В, Чжоу Т, Чжан Х (2006). «Ubc9 взаимодействует с SOX4 и подавляет его транскрипционную активность». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 344 (3): 727–34. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.03.194. PMID  16631117.

внешние ссылки

• SAE1 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• SAE1 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.