SART1 - SART1

SART1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4ПЮ
Идентификаторы
Псевдонимы	SART1, Ara1, HOMS1, SART1259, SNRNP110, Snu66, антиген плоскоклеточной карциномы, распознаваемый Т-клетками 1, HAF, три-snRNP-ассоциированный белок 1 U4 / U6.U5, связанный со сплайсосомой фактор 1, рекрутер U4 / U6.U5 tri -snRNP
Внешние идентификаторы	OMIM: 605941 MGI: 1309453 ГомолоГен: 133770 Генные карты: SART1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q13.1 Начните 65,961,728 бп[1] Конец 65,980,137 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 19 (мышь)[2] Группа 19 | 19 А Начните 5,377,523 бп[2] Конец 5,388,703 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • Тело Кахала • аппарат Гольджи • Три-snRNP комплекс U4 / U6 x U5 • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • сплайсосомальный комплекс • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное пятнышко • Предкаталитическая сплайсосома типа U2 Биологический процесс • цис-сплайсинг мРНК через сплайсосомы • положительное регулирование дифференцировки цитотоксических Т-клеток • внутренний апоптотический сигнальный путь • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • созревание 5S рРНК • остановка клеточного цикла • сплайсосомальная сборка snRNP • Сплайсинг РНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9092	20227
Ансамбль	ENSG00000175467	ENSMUSG00000039148
UniProt	O43290	Q9Z315
RefSeq (мРНК)	NM_005146	NM_016882
RefSeq (белок)	NP_005137	NP_058578
Расположение (UCSC)	Chr 11: 65.96 - 65.98 Мб	Chr 19: 5,38 - 5,39 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

U4 / U6.U5 tri-snRNP-ассоциированный белок 1 это белок что у людей кодируется SART1 ген.^[5][6]Этот ген кодирует два белки, белок SART1 (800) экспрессируется в ядре большинства пролиферирующие клетки, а белок SART1 (259) экспрессируется в цитозоле эпителиальный рак. Белок SART1 (259) транслируется по механизму сдвига рамки -1 во время посттранскрипционной регуляции. Считается, что два кодируемых белка участвуют в регуляции пролиферации. Оба белка отторгаются опухолью. антигены. Белок SART1 (259) обладает опухолью. эпитопы способный вызвать HLA-A24 02-ограниченный цитотоксический Т-лимфоциты у онкологических больных. Этот антиген SART1 (259) может быть полезен в специфических иммунотерапия для онкологических больных и может служить парадигматическим инструментом для диагностики и лечения пациентов с атопия. Обнаружено, что белок SART1 (259) необходим для рекрутирования три-snRNP к предварительномусплайсосома в пути сборки сплайсосом.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175467 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039148 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ситидзё С., Накао М., Имаи Й, Такасу Х., Кавамото М., Ниия Ф., Янг Д., Тох Й, Ямана Х., Ито К. (март 1998 г.). «Ген, кодирующий антигенные пептиды плоскоклеточной карциномы человека, распознаваемый цитотоксическими Т-лимфоцитами». J Exp Med. 187 (3): 277–88. Дои:10.1084 / jem.187.3.277. ЧВК  2212124. PMID  9449708.
6. «Ген Entrez: антиген плоскоклеточной карциномы SART1, распознаваемый Т-клетками».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Валента Р., Наттер С., Зайберлер С. и др. (1999). «Молекулярная характеристика аутоаллергена Hom s 1, идентифицированного с помощью сывороточного IgE пациентов с атопическим дерматитом». J. Invest. Дерматол. 111 (6): 1178–83. Дои:10.1046 / j.1523-1747.1998.00413.x. PMID  9856836.
• Кикучи М., Накао М., Иноуэ Ю. и др. (1999). «Идентификация пептида, производного от SART-1, способного индуцировать HLA-A24-рестриктированные и опухолеспецифические цитотоксические Т-лимфоциты». Int. J. Рак. 81 (3): 459–66. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0215 ​​(19990505) 81: 3 <459 :: AID-IJC21> 3.0.CO; 2-6. PMID  10209962.
• Мацунага К., Накао М., Масуока К. и др. (1999). «Цитокины, необходимые для индукции гистосовместимости лейкоцитарных антиген-ограниченных класса I и опухолеспецифических цитотоксических Т-лимфоцитов пептидом, производным от SART1». Jpn. J. Cancer Res. 90 (9): 1007–15. Дои:10.1111 / j.1349-7006.1999.tb00849.x. ЧВК  5926162. PMID  10551332.
• Исида Х., Комия С., Иноуэ Ю. и др. (2000). «Экспрессия антигена отторжения опухоли SART1 в остеосаркомах человека». Int. Дж. Онкол. 17 (1): 29–32. Дои:10.3892 / ijo.17.1.29. PMID  10853014.
• Синтаку И., Кавагое Н., Ютани С. и др. (2000). «Экспрессия антигена отторжения опухоли SART1 в почечно-клеточной карциноме». Урол. Res. 28 (3): 178–84. Дои:10.1007 / s002400000103. PMID  10929426. S2CID  12983860.
• Танака С., Цуда Н., Кавано К. и др. (2001). «Экспрессия антигенов отторжения опухоли при гинекологических раках». Jpn. J. Cancer Res. 91 (11): 1177–84. Дои:10.1111 / j.1349-7006.2000.tb00902.x. ЧВК  5926290. PMID  11092984.
• Sasatomi T, Yamana H, Shichijo S и др. (2001). «Экспрессия антигенов отторжения опухоли SART1 при колоректальном раке». Dis. Прямая кишка. 43 (12): 1754–8. Дои:10.1007 / BF02236863. PMID  11156463. S2CID  32717023.
• Макарова О.В., Макаров Е.М., Lührmann R (2001). «Связанные с SR белки 65 и 110 кДа три-мяРНП U4 / U6.U5 необходимы для сборки зрелых сплайсосом». EMBO J. 20 (10): 2553–63. Дои:10.1093 / emboj / 20.10.2553. ЧВК  125249. PMID  11350945.
• Болланд DJ, Хьюитт Дж. Э. (2001). «Потеря интронов в генах SART1 Fugu rubripes и Tetraodon nigroviridis». Ген. 271 (1): 43–9. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00504-2. PMID  11410364.
• Юрица М.С., Ликлидер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК  1370266. PMID  11991638.
• Белл М., Шрейнер С., Дамианов А. и др. (2002). «p110, новый белок snRNP U6 человека и фактор рециклинга snRNP U4 / U6». EMBO J. 21 (11): 2724–35. Дои:10.1093 / emboj / 21.11.2724. ЧВК  126028. PMID  12032085.
• Уитли А.П., Болланд Д.Д., Хьюитт Д.Е. и др. (2003). «Идентификация аутоантигена SART-1 в качестве гена-кандидата на развитие атопии». Гм. Мол. Genet. 11 (18): 2143–6. Дои:10.1093 / hmg / 11.18.2143. PMID  12189166.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Vertegaal AC, Ogg SC, Jaffray E, et al. (2004). «Протеомное исследование белков-мишеней SUMO-2». J. Biol. Chem. 279 (32): 33791–8. Дои:10.1074 / jbc.M404201200. PMID  15175327.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.