SBF1 - SBF1

SBF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1V5U
Идентификаторы
Псевдонимы	SBF1, CMT4B3, DENND7A, MTMR5, SET фактор связывания 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603560 MGI: 1925230 ГомолоГен: 84710 Генные карты: SBF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 22 (человек)[1] Группа 22q13.33 Начинать 50,445,000 бп[1] Конец 50,475,035 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 E3 Начинать 89,288,236 бп[2] Конец 89,315,311 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность регулятора фосфатазы • активность протеинтирозина / серина / треонинфосфатазы • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • Раб гуанил-нуклеотидный фактор обмена активность • фосфатазная активность Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • ядро клетки • цитозоль • мембрана эндоплазматического ретикулума • цитоплазма • ядерное тело • перинуклеарная область цитоплазмы Биологический процесс • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • дефосфорилирование белков • сперматогенез • процесс биосинтеза фосфатидилинозита Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6305	77980
Ансамбль	ENSG00000100241	ENSMUSG00000036529
UniProt	O95248	Q6ZPE2
RefSeq (мРНК)	NM_002972 NM_001365819	NM_001081030 NM_001170561 NM_030019
RefSeq (белок)	NP_002963 NP_001352748	NP_001074499 NP_001164032
Расположение (UCSC)	Chr 22: 50.45 - 50.48 Мб	Chr 15: 89.29 - 89.32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связанный с миотубулярином 5 это белок что у людей кодируется SBF1 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

SBF1 был показан взаимодействовать с MTMR2^[8] и SUV39H1.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000100241 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036529 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Cui X, De Vivo I, Slany R, Miyamoto A, Firestein R, Cleary ML (апрель 1998 г.). «Ассоциация домена SET и белков, связанных с миотубулярином, модулирует контроль роста». Nat. Genet. 18 (4): 331–7. Дои:10.1038 / ng0498-331. PMID  9537414.
6. Ляпорт Дж., Блондо Ф., Буй-Белло А., Тентлер Д., Крец С., Даль Н., Мандель Дж. Л. (декабрь 1998 г.). "Характеристика семейства генов фосфатазы двойной специфичности миотубулярина от дрожжей до человека". Гм. Мол. Genet. 7 (11): 1703–12. Дои:10.1093 / hmg / 7.11.1703. PMID  9736772.
7. «Ген Entrez: SBF1 SET связывающий фактор 1».
8. Ким С.А., Вакратсис П.О., Файрштейн Р., Клири М.Л., Диксон Дж. Э. (апрель 2003 г.). «Регулирование миотубулярин-связанной (MTMR) 2-фосфатидилинозитол-фосфатазы с помощью MTMR5, каталитически неактивной фосфатазы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (8): 4492–7. Дои:10.1073 / pnas.0431052100. ЧВК  153583. PMID  12668758.
9. Файрстейн Р., Цуй Х, Хуйе П., Клири М.Л. (июль 2000 г.). «Установить зависимую от домена регуляцию подавления транскрипции и контроля роста с помощью SUV39H1, ортолога млекопитающих Drosophila Su (var) 3-9». Мол. Клетка. Биол. 20 (13): 4900–9. Дои:10.1128 / MCB.20.13.4900-4909.2000. ЧВК  85941. PMID  10848615.

дальнейшее чтение

• Данхэм И., Шимидзу Н., Роу Б.А., Чиссо С., Хант А.Р., Коллинз Дж. Э., Брускевич Р., Биэр Д.М., Зажим М., Сминк Л.Дж., Эйнскау Р., Алмейда Дж. П., Бэббидж А., Баггулей С., Бейли Дж., Барлоу К., Бейтс К.Н. , Бисли О., Берд С. П., Блейки С., Бриджман А. М., Бак Д., Берджесс Дж., Беррилл В. Д., О'Брайен КП (1999). «Последовательность ДНК хромосомы 22 человека». Природа. 402 (6761): 489–95. Дои:10.1038/990031. PMID  10591208.
• Файрстейн Р., Цуй Х, Хьюи П., Клири М.Л. (2000). «Установить зависимую от домена регуляцию подавления транскрипции и контроля роста с помощью SUV39H1, ортолога млекопитающих Drosophila Su (var) 3-9». Мол. Клетка. Биол. 20 (13): 4900–9. Дои:10.1128 / MCB.20.13.4900-4909.2000. ЧВК  85941. PMID  10848615.
• Файрестейн Р., Клири М.Л. (2001). «Псевдофосфатаза Sbf1 содержит N-концевой домен гомологии GEF, который модулирует его регуляторные свойства роста». J. Cell Sci. 114 (Пт 16): 2921–7. PMID  11686296.
• Файрстейн Р., Надь П.Л., Дали М., Хьюи П., Конти М., Клири М.Л. (2002). «Мужское бесплодие, нарушение сперматогенеза и азооспермия у мышей с дефицитом псевдофосфатазы Sbf1». J. Clin. Вкладывать деньги. 109 (9): 1165–72. Дои:10.1172 / JCI12589. ЧВК  150957. PMID  11994405.
• Ким С.А., Вакратсис П.О., Файрстейн Р., Клири М.Л., Диксон Дж. Э. (2003). «Регулирование миотубулярин-связанной (MTMR) 2-фосфатидилинозитол-фосфатазы с помощью MTMR5, каталитически неактивной фосфатазы». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (8): 4492–7. Дои:10.1073 / pnas.0431052100. ЧВК  153583. PMID  12668758.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q6ZPE2 (Мышиный белок 5, связанный с миотубулярином) на PDBe-KB.