SCYE1 - SCYE1

AIMP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1E7Z, 1EUJ, 1FL0, 4R3Z
Идентификаторы
Псевдонимы	AIMP1, EMAP2, EMAPII, HLD3, SCYE1, p43, комплекс аминоацил тРНК синтетазы, взаимодействующий с многофункциональным белком 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603605 MGI: 102774 ГомолоГен: 31260 Генные карты: AIMP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q24 Начните 106,315,544 бп[1] Конец 106,349,456 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 G3 Начните 132,660,481 бп[2] Конец 132,684,370 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гомодимеризации белков • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • Связывание GTPase • связывание тРНК • цитокиновая активность Сотовый компонент • аппарат Гольджи • мембрана • мультиферментный комплекс аминоацил-тРНК синтетазы • транспортная везикула • внеклеточная область • поверхность клетки • эндоплазматический ретикулум • цитоплазматический пузырек • ядро клетки • комплекс метионил глутамил тРНК синтетазы • внеклеточный • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • морфогенез кровеносных сосудов • биосинтез белка • передача сигналов от клетки к клетке • отрицательная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток • хемотаксис • клеточная адгезия • защитный ответ на вирус • ответ на ранение • ангиогенез • метаболический процесс глюкозы • миграция лейкоцитов • преобразование сигнала • апоптотический процесс • аминоацилирование тРНК для трансляции белков • воспалительная реакция • углеводный обмен • регуляция рецепторной активности • положительная регуляция секреции глюкагона Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9255	13722
Ансамбль	ENSG00000164022	ENSMUSG00000028029
UniProt	Q12904	P31230
RefSeq (мРНК)	NM_004757 NM_001142415 NM_001142416	NM_007926 NM_001368626
RefSeq (белок)	NP_001135887 NP_001135888 NP_004748	NP_001355555 NP_031952
Расположение (UCSC)	Chr 4: 106,32 - 106,35 Мб	Chr 3: 132,66 - 132,68 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Многофункциональный белок 1, взаимодействующий с комплексом аминоацил тРНК синтетазы белок, который у человека кодируется AIMP1 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой цитокин, который может быть индуцирован апоптозом, а также высвобождается из профессиональных антигенпрезентирующих клеток, таких как дендритные клетки. Высвобождение этого цитокина делает сосудистую сеть, ассоциированную с опухолью, чувствительной к фактору некроза опухоли. Предшественник SCYE1 (pro-SCYE1) идентичен субъединице p43, которая связана с комплексом мультиаминоацил-тРНК синтетазы (mARS). Pro-SCYE1 может действовать в связывании РНК как часть комплекса тРНК-синтетазы в нормальных клетках и в стимулировании воспалительных реакций после протеолитического расщепления в опухолевых клетках.^[7] Как воспалительный цитокин, AIMp1 / p43 продемонстрировал способность искажать поляризацию Т-хелперов в направлении Th-1, а его гомозиготная делеция приводит к гипер-поляризованному фенотипу Th-2.

Взаимодействия

SCYE1 был показан взаимодействовать с участием SMURF2.^[8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164022 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028029 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Као Дж., Хоук К., Фан Й., Хенель И., Либутти С.К., Кайтон М.Л., Грикшайт Т., Шабо Дж., Новигрод Р., Гринберг С. и др. (Ноя 1994). «Характеристика нового цитокина, полученного из опухоли. Полипептид II, активирующий эндотелиальные моноциты». J Biol Chem. 269 (40): 25106–19. PMID  7929199.
6. Као Дж., Фан Ю.Г., Хенель И., Бретт Дж., Гринберг С., Клаусс М., Кейтон М., Хоук К., Кизиэль В., Селджелид Р. и др. (Май 1994). «Пептид, происходящий от аминоконца полипептида II, активирующего эндотелиальные моноциты, модулирует функции мононуклеарных и полиморфно-ядерных лейкоцитов, определяет, по-видимому, новый сайт клеточного взаимодействия и вызывает острый воспалительный ответ». J Biol Chem. 269 (13): 9774–82. PMID  7545917.
7. «Ген Entrez: малый индуцибельный цитокин SCYE1 подсемейства E, член 1 (активирующий эндотелиальные моноциты)».
8. Ли, Ён Сук; Хан Чжон Мин; Сон Сон Хва; Чхве Джин Ву; Чон Ын Джу; Пэ Сук-Чул; Парк Янг Ин; Ким Сонхун (июль 2008 г.). «AIMP1 / p43 подавляет передачу сигналов TGF-бета посредством стабилизации smurf2». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. Соединенные Штаты. 371 (3): 395–400. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.04.099. PMID  18448069.

дальнейшее чтение

• Као Дж., Райан Дж., Бретт Дж. И др. (1992). «Эндотелиальный полипептид, активирующий моноциты II. Новый полипептид, полученный из опухоли, который активирует механизмы ответа хозяина». J. Biol. Chem. 267 (28): 20239–47. PMID  1400342.
• Quevillon S; Агу Ф; Робинсон JC; Миранда М (1998). «Компонент p43 мультисинтетазного комплекса млекопитающих, вероятно, является предшественником цитокина полипептида II, активирующего эндотелиальные моноциты». J. Biol. Chem. 272 (51): 32573–9. Дои:10.1074 / jbc.272.51.32573. PMID  9405472. S2CID  34057814.
• Quevillon S, Robinson JC, Berthonneau E, et al. (1999). «Сборка макромолекул аминоацил-тРНК синтетаз: идентификация белок-белковых взаимодействий и характеристика основного белка». J. Mol. Биол. 285 (1): 183–95. Дои:10.1006 / jmbi.1998.2316. PMID  9878398.
• Пак С.Г., Юнг К.Х., Ли Дж.С. и др. (1999). «Предшественник проапоптотического цитокина модулирует активность аминоацилирования тРНК синтетазы». J. Biol. Chem. 274 (24): 16673–6. Дои:10.1074 / jbc.274.24.16673. PMID  10358004. S2CID  25940947.
• Ким И, Шин Дж, Ли Р. и др. (2000). «Новый противоопухолевый цитокин содержит РНК-связывающий мотив, присутствующий в аминоацил-тРНК синтетазах». J. Biol. Chem. 275 (35): 27062–8. Дои:10.1074 / jbc.C000216200. PMID  10852899.
• Рено Л., Керьян П., Паскуалато С. и др. (2001). «Структура домена EMAPII человеческого комплекса аминоацил-тРНК синтетазы выявляет эволюционную мимикрию димеров». EMBO J. 20 (3): 570–8. Дои:10.1093 / emboj / 20.3.570. ЧВК  133484. PMID  11157763.
• Шалак В., Каминска М., Митнахт-Краус Р. и др. (2001). «Цитокин EMAPII высвобождается из мультисинтетазного комплекса млекопитающих после расщепления его компонента p43 / proEMAPII». J. Biol. Chem. 276 (26): 23769–76. Дои:10.1074 / jbc.M100489200. PMID  11306575. S2CID  20768076.
• Чанг SY; Парк SG; Kim S; Кан CY (2002). «Взаимодействие С-концевого домена p43 и альфа-субъединицы АТФ-синтазы. Его функциональное значение в пролиферации эндотелиальных клеток». J. Biol. Chem. 277 (10): 8388–94. Дои:10.1074 / jbc.M108792200. PMID  11741979.
• Battersby S; Boddy SC; Critchley HO; Джаббур Х.Н. (2002). «Экспрессия и локализация полипептида II, активирующего эндотелиальные моноциты, в эндометрии человека в течение менструального цикла: регуляция экспрессии простагландином E (2)». J. Clin. Эндокринол. Метаб. 87 (8): 3928–35. Дои:10.1210 / jc.87.8.3928. PMID  12161535.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Парк Х, Парк С.Г., Ким Дж. И др. (2003). «Пути передачи сигналов для продукции TNF, индуцированной человеческим фактором, связывающим аминоацил-тРНК-синтетазу, p43». Цитокин. 20 (4): 148–53. Дои:10.1006 / cyto.2002.1992. PMID  12543078.
• Ahn HC; Kim S; Ли Би Джей (2003). «Структура раствора и связывание p43 мотива лейциновой молнии p38: взаимодействия спиральной спирали опосредуют ассоциацию между p38 и p43». FEBS Lett. 542 (1–3): 119–24. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 00362-4. PMID  12729910. S2CID  39222196.
• Ким MJ, Пак Би Джей, Кан Ю.С. и др. (2003). «Подавление FUSE-связывающего белка и c-myc кофактором тРНК-синтетазы p38 требуется для дифференцировки клеток легких». Nat. Genet. 34 (3): 330–6. Дои:10.1038 / ng1182. PMID  12819782. S2CID  41006480.
• Вулф К.Л., Уоррингтон Дж. А., Дэвис С. и др. (2004). «Выделение и характеристика ядерных и цитозольных мультисинтетазных комплексов человека и внутриклеточное распределение p43 / EMAPII». Белковая наука. 12 (10): 2282–90. Дои:10.1110 / пс. 03147903. ЧВК  2366922. PMID  14500886.
• Мюллер К.А., Шлюзенер Х.Дж., Конрад С. и др. (2004). «Повреждение спинного мозга вызывает поврежденную экспрессию провоспалительного и антиангиогенного цитокина EMAP II». J. Нейротравма. 20 (10): 1007–15. Дои:10.1089/089771503770195858. PMID  14588117.
• Мюррей Дж. К., Симондс П., Уорд В. и др. (2004). «Клетки колоректального рака индуцируют апоптоз лимфоцитов по механизму, активирующему эндотелиальные моноциты, полипептид-II». J. Immunol. 172 (1): 274–81. Дои:10.4049 / jimmunol.172.1.274. PMID  14688335. S2CID  7939914.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039. S2CID  21903526.
• Мюррей Дж. К., Хенг Ю. М., Симондс П. и др. (2004). «Эндотелиальный полипептид-II, активирующий моноциты (EMAP-II): новый индуктор апоптоза лимфоцитов». J. Leukoc. Биол. 75 (5): 772–6. Дои:10.1189 / jlb.1003487. PMID  14982944. S2CID  31089927.