SMURF2 - SMURF2 - Wikipedia

SMURF2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ЗВД, 2DJY, 2JQZ, 2KXQ, 2LTZ
Идентификаторы
Псевдонимы	SMURF2, SMAD-специфическая E3-убиквитин-протеинлигаза 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 605532 MGI: 1913563 ГомолоГен: 41490 Генные карты: SMURF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q23.3-q24.1 Начинать 64,542,282 бп[1] Конец 64,662,307 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 E1 Начинать 106,820,066 бп[2] Конец 106,920,715 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • активность убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • преобразование связывания бета-рецептора фактора роста • Привязка SMAD Сотовый компонент • цитозоль • мембрана • убиквитинлигазный комплекс • клеточная мембрана • нуклеоплазма • мембранный плот • ядерное пятнышко • ядро клетки • цитоплазма Биологический процесс • положительная регуляция канонического сигнального пути Wnt • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста • BMP сигнальный путь • положительная регуляция миграции клеток трофобласта • убиквитин-зависимый катаболический процесс белка SMAD • регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста • убиквитинирование белков • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • полиубиквитинирование белков • Путь передачи сигналов Wnt, путь планарной полярности клеток • деубиквитинирование белков • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • отрицательная регуляция сигнального пути BMP • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • положительная регуляция белкового катаболического процесса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64750	66313
Ансамбль	ENSG00000108854	ENSMUSG00000018363
UniProt	Q9HAU4	A2A5Z6
RefSeq (мРНК)	NM_022739	NM_025481 NM_001362894
RefSeq (белок)	NP_073576	NP_079757 NP_001349823
Расположение (UCSC)	Chr 17: 64,54 - 64,66 Мб	Chr 11: 106,82 - 106,92 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

E3 убиквитин-протеинлигаза SMURF2 является фермент что у людей кодируется SMURF2 ген.^[5][6]

Взаимодействия

SMURF2 был показан взаимодействовать с:

• Матери против декапентаплегического гомолога 1,^[5]
• Матери против декапентаплегического гомолога 2,^[5][7][8]
• Матери против декапентаплегического гомолога 3,^[5][7][8]
• Матери против декапентаплегического гомолога 7,^[9][10][11]
• SCYE1,^[11]
• SMURF1,^[12] и
• Убиквитин С.^[11][13]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108854 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018363 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Линь X, Лян М., Фэн XH (ноябрь 2000 г.). «Smurf2 представляет собой убиквитин-E3-лигазу, опосредующую протеасомно-зависимую деградацию Smad2 при трансформации передачи сигналов фактора роста-бета». Журнал биологической химии. 275 (47): 36818–22. Дои:10.1074 / jbc.C000580200. PMID  11016919.
6. «Ген Entrez: SMURF2 SMAD-специфическая E3-убиквитин-протеин-лигаза 2».
7. Bonni S, Wang HR, Causing CG, Kavsak P, Stroschein SL, Luo K, Wrana JL (июнь 2001 г.). «TGF-бета индуцирует сборку комплекса убиквитинлигазы Smad2-Smurf2, который нацелен на деградацию SnoN». Природа клеточной биологии. 3 (6): 587–95. Дои:10.1038/35078562. PMID  11389444. S2CID  23270947.
8. Накано А., Коинума Д., Миядзава К., Учида Т., Сайто М., Кавабата М., Ханаи Дж., Акияма Х., Абэ М., Миязоно К., Мацумото Т., Имамура Т. (март 2009 г.). «Pin1 подавляет передачу сигналов трансформирующего фактора роста-бета (TGF-бета), вызывая деградацию белков Smad». Журнал биологической химии. 284 (10): 6109–15. Дои:10.1074 / jbc.M804659200. PMID  19122240.
9. Асано Й., Ин Х., Ямане К., Кубо М., Тамаки К. (январь 2004 г.). «Нарушение опосредованной Smad7-Smurf негативной регуляции передачи сигналов TGF-бета в фибробластах склеродермии». Журнал клинических исследований. 113 (2): 253–64. Дои:10.1172 / JCI16269. ЧВК  310747. PMID  14722617.
10. Кавсак П., Расмуссен Р.К., Causing CG, Бонни С., Чжу Х., Томсен Г.Х., Врана Д.Л. (декабрь 2000 г.). «Smad7 связывается с Smurf2 с образованием убиквитинлигазы E3, которая нацелена на бета-рецептор TGF для деградации». Молекулярная клетка. 6 (6): 1365–75. Дои:10.1016 / с1097-2765 (00) 00134-9. PMID  11163210.
11. Lee YS, Han JM, Son SH, Choi JW, Jeon EJ, Bae SC, Park YI, Kim S (июль 2008 г.). «AIMP1 / p43 подавляет передачу сигналов TGF-бета посредством стабилизации smurf2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 371 (3): 395–400. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.04.099. PMID  18448069.
12. Фукунага Е., Иноуэ Й, Комия С., Хоригучи К., Гото К., Сайто М., Миядзава К., Коинума Д., Ханю А., Имамура Т. (декабрь 2008 г.). «Smurf2 индуцирует убиквитин-зависимую деградацию Smurf1 для предотвращения миграции клеток рака груди». Журнал биологической химии. 283 (51): 35660–7. Дои:10.1074 / jbc.M710496200. PMID  18927080.
13. Карпентье I, Coornaert B, Beyaert R (октябрь 2008 г.). «Smurf2 представляет собой связывающий TRAF2 белок, который запускает убиквитинирование TNF-R2 и активацию JNK, индуцированную TNF-R2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 374 (4): 752–7. Дои:10.1016 / j.bbrc.2008.07.103. PMID  18671942.

дальнейшее чтение

• Чжан И, Чанг С., Гелинг DJ, Хеммати-Бриванлу А., Деринк Р. (январь 2001 г.). «Регулирование деградации и активности Smad с помощью Smurf2, убиквитинлигазы E3». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (3): 974–9. Дои:10.1073 / пнас.98.3.974. ЧВК  14694. PMID  11158580.
• Кавсак П., Расмуссен Р.К., Causing CG, Bonni S, Zhu H, Thomsen GH, Wrana JL (декабрь 2000 г.). «Smad7 связывается с Smurf2 с образованием убиквитинлигазы E3, которая нацелена на бета-рецептор TGF для деградации». Молекулярная клетка. 6 (6): 1365–75. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 00134-9. PMID  11163210.
• Bonni S, Wang HR, Causing CG, Kavsak P, Stroschein SL, Luo K, Wrana JL (июнь 2001 г.). «TGF-бета индуцирует сборку комплекса убиквитинлигазы Smad2-Smurf2, который нацелен на деградацию SnoN». Природа клеточной биологии. 3 (6): 587–95. Дои:10.1038/35078562. PMID  11389444. S2CID  23270947.
• Субраманиам В., Ли Х., Вонг М., Китчинг Р., Аттисано Л., Врана Дж., Зубовиц Дж., Бургер А.М., Сет А. (октябрь 2003 г.). «Белок RING-H2 RNF11 сверхэкспрессируется при раке груди и является мишенью для лигазы Smurf2 E3». Британский журнал рака. 89 (8): 1538–44. Дои:10.1038 / sj.bjc.6601301. ЧВК  2394340. PMID  14562029.
• Асано Й., Ин Х., Ямане К., Кубо М., Тамаки К. (январь 2004 г.). «Нарушение опосредованной Smad7-Smurf негативной регуляции передачи сигналов TGF-бета в фибробластах склеродермии». Журнал клинических исследований. 113 (2): 253–64. Дои:10.1172 / JCI16269. ЧВК  310747. PMID  14722617.
• Ли Х., Сет А. (март 2004 г.). «Комплекс RNF11: Smurf2 опосредует убиквитинирование белка AMSH». Онкоген. 23 (10): 1801–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1207319. PMID  14755250.
• Jin YH, Jeon EJ, Li QL, Lee YH, Choi JK, Kim WJ, Lee KY, Bae SC (июль 2004 г.). «Трансформирующий фактор роста-бета стимулирует p300-зависимое ацетилирование RUNX3, что ингибирует опосредованное убиквитинирование деградацию». Журнал биологической химии. 279 (28): 29409–17. Дои:10.1074 / jbc.M313120200. PMID  15138260.
• Бранденбергер Р., Вэй Х, Чжан С., Лей С., Мурадж Дж., Фиск Дж. Дж., Ли И, Сюй С., Фанг Р., Гуглер К., Рао М. С., Мандалам Р., Лебковски Дж., Стэнтон Л. В. (июнь 2004 г.) «Характеристика транскриптома проясняет сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку человеческих ES-клеток». Природа Биотехнологии. 22 (6): 707–16. Дои:10.1038 / nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Судзуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Чиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накай К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Геномные исследования. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Чжан Х., Коэн С.Н. (декабрь 2004 г.). «Активация Smurf2 активирует теломер-зависимое старение». Гены и развитие. 18 (24): 3028–40. Дои:10.1101 / гад.1253004. ЧВК  535914. PMID  15574587.
• Барриос-Родилес М., Браун К. Р., Оздамар Б., Бозе Р., Лю З., Донован Р. С., Синджо Ф., Лю Ю., Дембовы Дж., Тейлор И. В., Луга В., Прзулдж Н., Робинсон М., Сузуки Н., Хаяшизаки Ю., Юрисика И., Wrana JL (март 2005 г.). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153. S2CID  39457788.
• Охаши Н., Ямамото Т., Учида С., Тогава А., Фукасава Х., Фудзигаки Ю., Сузуки С., Китагава К., Хаттори Т., Ода Т., Хаяси Н., Хисида А., Китагава М. (май 2005 г.). «Транскрипционная индукция убиквитинлигазы Smurf2 с помощью TGF-бета». Письма FEBS. 579 (12): 2557–63. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.03.069. HDL:10271/283. PMID  15862290. S2CID  38498506.
• Огунджими А.А., Бриант Д.Д., Пес-Барбара Н., Ле Рой С., Ди Гульельмо Г.М., Кавсак П., Расмуссен Р.К., Сит Б.Т., Сичери Ф., Врана Д.Л. (август 2005 г.). «Регулирование активности убиквитинлигазы Smurf2 путем прикрепления E2 к домену HECT». Молекулярная клетка. 19 (3): 297–308. Дои:10.1016 / j.molcel.2005.06.028. PMID  16061177.
• Chong PA, Lin H, Wrana JL, Forman-Kay JD (июнь 2006 г.). «Расширенный мотив узнавания WW-домена, выявленный взаимодействием между Smad7 и убиквитинлигазой E3 Smurf2». Журнал биологической химии. 281 (25): 17069–75. Дои:10.1074 / jbc.M601493200. PMID  16641086.
• Wiesner S, Ogunjimi AA, Wang HR, Rotin D, Sicheri F, Wrana JL, Forman-Kay JD (август 2007 г.). «Автоингибирование убиквитинлигазы HECT-типа Smurf2 через ее домен C2». Клетка. 130 (4): 651–62. Дои:10.1016 / j.cell.2007.06.050. PMID  17719543. S2CID  16684837.