SEC24D - SEC24D

SEC24D
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3EFO, 3EG9
Идентификаторы
Псевдонимы	SEC24D, CLCRP2, гомолог D SEC24, компонент комплекса оболочки COPII
Внешние идентификаторы	OMIM: 607186 MGI: 1916858 ГомолоГен: 40986 Генные карты: SEC24D
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q26 Начинать 118,722,823 бп[1] Конец 118,838,683 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 G1 Начинать 123,267,455 бп[2] Конец 123,365,641 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Привязка SNARE • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • Мембрана Гольджи • эндоплазматический ретикулум • Покрытие везикул COPII • цитозоль • ER к мембране транспортных пузырьков Гольджи • цитоплазматический пузырек Биологический процесс • процессинг антигена и презентация экзогенного пептидного антигена через MHC класса II • процессинг антигена и презентация пептидного антигена через MHC класса I • внутриутробное эмбриональное развитие • Покрытие везикул COPII • транспорт белка • внутриклеточный транспорт белка • везикулярный транспорт • ER в пузырьки Гольджи-опосредованный транспорт • загрузка груза в везикулу, покрытую COPII Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9871	69608
Ансамбль	ENSG00000150961	ENSMUSG00000039234
UniProt	O94855	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_014822 NM_001318066	NM_027135
RefSeq (белок)	NP_001304995 NP_055637	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 4: 118,72 - 118,84 Мб	Chr 3: 123.27 - 123.37 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белковый транспортный белок Sec24D это белок что у людей кодируется SEC24D ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, является членом подсемейства SEC24 семейства SEC23 / SEC24, которое участвует в торговля пузырьками. Кодируемый белок имеет сходство с дрожжи Sec24p компонент COPII. COPII - это белковый комплекс оболочки, ответственный за отрастание пузырьков из ER. Роль этого генного продукта участвует в формировании пузырька, а также в отборе и концентрации груза.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000150961 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039234 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О. (апрель 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID  9872452.
6. Pagano A, Letourneur F, Garcia-Estefania D, Carpentier JL, Orci L, Paccaud JP (апрель 1999 г.). «Белки Sec24 и сортировка в эндоплазматическом ретикулуме». J Biol Chem. 274 (12): 7833–40. Дои:10.1074 / jbc.274.12.7833. PMID  10075675.
7. «Ген Entrez: SEC24D родственное семейство генов SEC24, член D (S. cerevisiae)».

дальнейшее чтение

• Тан Б.Л., Каусалья Дж., Лоу Д.Й. и др. (1999). «Семейство белков млекопитающих, гомологичных дрожжевому Sec24p». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 258 (3): 679–84. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0574. PMID  10329445.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Колланд Ф., Жак Х, Труплин В. и др. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Уотсон П., Форстер Р., Палмер К. Дж. И др. (2005). «Присоединение выхода ER к микротрубочкам посредством прямого взаимодействия COPII с динактином». Nat. Cell Biol. 7 (1): 48–55. Дои:10.1038 / ncb1206. ЧВК  1592520. PMID  15580264.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Фархан Х., Рейтерер В., Корхов В.М. и др. (2007). «Концентрационный экспорт из эндоплазматического ретикулума транспортера гамма-аминомасляной кислоты 1 требует связывания с SEC24D». J. Biol. Chem. 282 (10): 7679–89. Дои:10.1074 / jbc.M609720200. PMID  17210573.