SELS (ген) - SELS (gene)

СЕЛЕНОС
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2Q2F
Идентификаторы
Псевдонимы	СЕЛЕНОС, ADO15, SBBI8, SELS, SEPS1, AD-015, VIMP, VCP взаимодействующий мембранный селенопротеин, селенопротеин S
Внешние идентификаторы	OMIM: 607918 MGI: 95994 ГомолоГен: 10200 Генные карты: СЕЛЕНОС
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q26.3 Начните 101,270,817 бп[1] Конец 101,277,500 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 C | 7 35,49 см Начните 66,079,649 бп[2] Конец 66,089,405 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание АТФазы • антиоксидантная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ферментов • связывание убиквитин-специфической протеазы • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • цитоплазма • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана • Комплекс Дерлин-1-ВИМП • клеточная мембрана • липопротеиновые частицы очень низкой плотности • неотъемлемый компонент мембраны эндоплазматического ретикулума • эндоплазматический ретикулум • частица липопротеинов низкой плотности • Ретротранслокационный комплекс Дерлин-1 • цитоплазматическая микротрубочка • мембрана эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • отрицательная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути, вызванного стрессом эндоплазматического ретикулума • регуляция глюконеогенеза • установление локализации белка • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-6 • ответ на глюкозу • отрицательная регуляция процесса биосинтеза гликогена • окислительно-восстановительный гомеостаз клеток • Реакция на перегрузку ER • реакция на окислительно-восстановительное состояние • эндоплазматический ретикулум развернутый белковый ответ • отрицательное регулирование импорта глюкозы • ретроградный транспорт белка, ER в цитозоль • отрицательная регуляция процесса апоптоза макрофагов • убиквитин-зависимый путь ERAD • клеточный ответ на стимул инсулина • регулирование процесса обмена оксида азота • клеточный ответ на окислительный стресс • отрицательная регуляция выработки фактора некроза опухоли • отрицательная регуляция острого воспалительного ответа на антигенный раздражитель • клеточный ответ на липополисахарид • внутриклеточный транспорт белка • отрицательная регуляция воспалительного ответа • отрицательная регуляция процесса биосинтеза синтазы оксида азота • клеточная детоксикация окислителей • убиквитинирование белков Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	55829	109815
Ансамбль	ENSG00000131871	ENSMUSG00000075701
UniProt	Q9BQE4	Q9BCZ4
RefSeq (мРНК)	NM_203472 NM_018445	NM_024439 NM_001348246
RefSeq (белок)	NP_060915 NP_982298	NP_001335175 NP_077759
Расположение (UCSC)	Chr 15: 101.27 - 101.28 Мб	Chr 7: 66.08 - 66.09 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Селенопротеин S, также известен как SELS, это человек ген.^[5]

Этот ген кодирует селенопротеин, который содержит остаток селеноцистеина (Sec) на своем активном сайте. Селеноцистеин кодируется кодоном UGA, который обычно сигнализирует о завершении трансляции. 3 'UTR генов селенопротеинов имеют общую структуру стебель-петля, последовательность вставки sec (SECIS), которая необходима для распознавания UGA как кодона Sec, а не как стоп-сигнал. Исследования показывают, что этот белок может регулировать выработку цитокинов и, таким образом, играть ключевую роль в контроле воспалительной реакции. Для этого гена были обнаружены два альтернативно сплайсированных варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.^[5]

Взаимодействия

SELS (ген) показал взаимодействовать с участием Валозин-содержащий белок.^[6][7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131871 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000075701 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Entrez Gene: SELS селенопротеин S".
6. Е, Ихонг; Шибата Ёко; Юнь Чи; Рон Дэвид; Rapoport Tom A (июнь 2004 г.). «Комплекс мембранных белков опосредует ретранслокацию из просвета ЭПР в цитозоль». Природа. 429 (6994): 841–847. Дои:10.1038 / природа02656. PMID  15215856.
7. Ван, Цюянь; Ли Ляньюнь; Е Ихонг (март 2008 г.). «Ингибирование p97-зависимой деградации белка под действием Иарестатина I». J. Biol. Chem. 283 (12): 7445–7454. Дои:10.1074 / jbc.M708347200. ISSN  0021-9258. ЧВК  2276333. PMID  18199748.

дальнейшее чтение

• Робертсон Н.Г., Хетарпал У., Гутьеррес-Эспелета Г.А. и др. (1995). «Выделение новых и известных генов из библиотеки кДНК улитки человеческого плода с использованием субтрактивной гибридизации и дифференциального скрининга». Геномика. 23 (1): 42–50. Дои:10.1006 / geno.1994.1457. PMID  7829101.
• Маруяма К; Сугано С (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–174. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Bonaldo MF; Lennon G; Соареш МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–156. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ху RM, Хан ZG, Song HD и др. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–9548. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• Уолдер К., Кантам Л., Макмиллан Дж. С. и др. (2002). «Танис: связь между диабетом 2 типа и воспалением?». Сахарный диабет. 51 (6): 1859–1866. Дои:10.2337 / диабет.51.6.1859. PMID  12031974.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Гао Ю., Уолдер К., Сандерленд Т. и др. (2003). «Повышение экспрессии Таниса изменяет метаболизм глюкозы и чувствительность к инсулину в клетках H4IIE». Сахарный диабет. 52 (4): 929–934. Дои:10.2337 / диабет.52.4.929. PMID  12663463.
• Крюков Г.В., Кастеллано С., Новоселов С.В. и др. (2003). «Характеристика селенопротеомов млекопитающих». Наука. 300 (5624): 1439–1443. Дои:10.1126 / science.1083516. PMID  12775843.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–45. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Гао Й, Фенг Х.С., Уолдер К. и др. (2004). «Регулирование селенопротеина SelS путем депривации глюкозы и стресса эндоплазматического ретикулума - SelS - новый регулируемый глюкозой белок». FEBS Lett. 563 (1–3): 185–190. Дои:10.1016 / S0014-5793 (04) 00296-0. HDL:10536 / DRO / DU: 30002457. PMID  15063746.
• Карлссон Х.К., Цучида Х., Лейк С. и др. (2004). «Взаимосвязь между уровнем сывороточного амилоида А и экспрессией мРНК Tanis / SelS в скелетных мышцах и жировой ткани у здоровых субъектов и пациентов с диабетом 2 типа». Сахарный диабет. 53 (6): 1424–1428. Дои:10.2337 / диабет.53.6.1424. PMID  15161744.
• Йе Й, Шибата Й, Юн С. и др. (2004). «Комплекс мембранных белков опосредует ретранслокацию из просвета ЭПР в цитозоль». Природа. 429 (6994): 841–847. Дои:10.1038 / природа02656. PMID  15215856.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Лилли Б.Н.; Ploegh HL (2006). «Мультибелковые комплексы, которые связывают дислокацию, убиквитинирование и извлечение неправильно свернутых белков из мембраны эндоплазматического ретикулума». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (40): 14296–14301. Дои:10.1073 / pnas.0505014102. ЧВК  1242303. PMID  16186509.
• Йе Й, Шибата Й, Киккерт М. и др. (2006). «Привлечение p97 АТФазы и убиквитинлигаз к месту ретротранслокации на мембране эндоплазматического ретикулума». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (40): 14132–14138. Дои:10.1073 / pnas.0505006102. ЧВК  1242302. PMID  16186510.
• Curran JE, Jowett JB, Elliott KS, et al. (2006). «Генетическая изменчивость селенопротеина S влияет на воспалительную реакцию». Nat. Genet. 37 (11): 1234–1241. Дои:10,1038 / ng1655. HDL:10536 / DRO / DU: 30006596. PMID  16227999.
• Гао И., Ханнан Н.Р., Ванони С. и др. (2006). «Активация экспрессии гена селенопротеина SEPS1 провоспалительными цитокинами в клетках HepG2». Цитокин. 33 (5): 246–251. Дои:10.1016 / j.cyto.2006.02.005. PMID  16574427.
• Гао Й, Паньон Дж, Фэн ХК и др. (2007). «Секреция регулируемого глюкозой селенопротеина SEPS1 из клеток гепатомы». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 356 (3): 636–641. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.03.018. PMID  17374524.
• Зайдерер Дж., Дамбахер Дж., Кюнляйн Б. и др. (2007). «Роль -105G> полиморфизм промотора гена селенопротеина S (SELS) в воспалительном заболевании кишечника и регуляция экспрессии гена SELS при воспалении кишечника». Тканевые антигены. 70 (3): 238–246. Дои:10.1111 / j.1399-0039.2007.00888.x. PMID  17661913.