SH3BP4 - SH3BP4

SH3BP4
Идентификаторы
Псевдонимы	SH3BP4, BOG25, TTP, связывающий белок SH3 домен 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 605611 MGI: 2138297 ГомолоГен: 8726 Генные карты: SH3BP4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q37.2 Начинать 234,952,017 бп[1] Конец 235,055,714 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 Д Начинать 89,070,415 бп[2] Конец 89,155,068 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • Активность ингибитора GDP-диссоциации • Связывание Ras GTPase Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • яма, покрытая клатрином • цитоплазматический пузырек • внеклеточная экзосома • ядро клетки • везикула, покрытая клатрином Биологический процесс • клеточный ответ на аминокислотный стимул • локализация белка в лизосоме • GO: 0034259 отрицательная регуляция активности GTPase • GO: 0048552 регуляция каталитической активности • эндоцитоз • отрицательная регуляция роста клеток • положительное регулирование аутофагии • импорт аминокислот • отрицательное регулирование пролиферации клеток • отрицательная регуляция передачи сигналов TOR Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23677	98402
Ансамбль	ENSG00000130147	ENSMUSG00000036206
UniProt	Q9P0V3	Q921I6
RefSeq (мРНК)	NM_014521	NM_133816
RefSeq (белок)	NP_055336 NP_001358231 NP_001358232 NP_001358233 NP_001358234 NP_001358235	NP_598577
Расположение (UCSC)	Chr 2: 234.95 - 235.06 Мб	Chr 1: 89.07 - 89.16 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SH3-домен-связывающий белок 4 это белок что у людей кодируется SH3BP4 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует белок с 3 мотивами Asn-Pro-Phe (NPF), SH3 домен, мотив PXXP, двудольный сигнал ядерного наведения, а фосфорилирование тирозина сайт. Этот белок участвует в специфическом для груза контроле клатрин-опосредованный эндоцитоз, в частности, контролируя интернализацию определенного рецептор белка.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130147 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036206 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Данлеви Дж. Р., Беррихилл Б. Л., Вергнес Дж. П., Сундар Раж Н., Хасселл Дж. Р. (март 2000 г.). «Клонирование, хромосомная локализация и характеристика кДНК нового гена SH3BP4, экспрессируемого фибробластами роговицы человека». Геномика. 62 (3): 519–24. Дои:10.1006 / geno.1999.5994. PMID  10644451.
6. «Ген Entrez: SH3BP4 SH3-домен связывающий белок 4».

дальнейшее чтение

• Вонг В. Т., Шумахер С., Сальчини А. Э. и др. (1995). «Белок-связывающий домен, EH, идентифицированный в субстрате рецепторной тирозинкиназы Eps15 и сохраненный в процессе эволюции». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (21): 9530–4. Дои:10.1073 / пнас.92.21.9530. ЧВК  40835. PMID  7568168.
• Сальчини А.Е., Конфалониери С., Дориа М. и др. (1997). «Специфичность связывания и мишени in vivo для домена EH, новый модуль межбелкового взаимодействия». Genes Dev. 11 (17): 2239–49. Дои:10.1101 / gad.11.17.2239. ЧВК  275390. PMID  9303539.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660. S2CID  2371325.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ханобди К., Кольберг Дж. Б., Дунлеви Дж. Р. (2005). «Ядерная и плазматическая мембрана локализации SH3BP4 в клетках пигментного эпителия сетчатки». Мол. Vis. 10: 933–42. PMID  15616480.
• Бензингер А., Мустер Н., Кох HB и др. (2005). «Целевой протеомный анализ 14-3-3 сигма, эффектора р53, обычно подавляемого при раке». Мол. Клетка. Протеомика. 4 (6): 785–95. Дои:10.1074 / mcp.M500021-MCP200. PMID  15778465.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Тосони Д., Пури С., Конфалониери С. и др. (2006). «ТТП специфически регулирует интернализацию рецептора трансферрина». Клетка. 123 (5): 875–88. Дои:10.1016 / j.cell.2005.10.021. PMID  16325581. S2CID  5809800.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.