SNX3 - SNX3

SNX3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2YPS, 2MXC
Идентификаторы
Псевдонимы	SNX3, Grd19, MCOPS8, SDP3, сортировочный нексин 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 605930 MGI: 1860188 ГомолоГен: 36144 Генные карты: SNX3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q21 Начинать 108,211,222 бп[1] Конец 108,261,246 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 B2 | 10 22,89 см Начинать 42,502,030 бп[2] Конец 42,535,381 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фосфатидилинозитол-3-фосфата • связывание фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфата • фосфатидилинозитол-4-фосфатное связывание • связывание фосфатидилинозитол-5-фосфата • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфатидилинозита • связывание протеинфосфатазы • связывание липидов • связывание фосфатидилинозитола с фосфатом Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • эндосома • мембрана ранней эндосомы • ранняя фагосома • Retromer • ранняя эндосома • фагоцитарный пузырек • внеклеточная экзосома • цитоплазматический пузырек • везикула, покрытая клатрином • внешний компонент мембраны • эндосомная мембрана Биологический процесс • белок к мембране стыковка • отрицательная регуляция проникновения вируса в клетку-хозяин • отрицательная регуляция фагоцитоза • реакция на бактерии • отрицательная регуляция катаболического процесса белков • отрицательная регуляция транспорта от ранней эндосомы к поздней • мембранная инвагинация • регуляция сигнального пути Wnt • образование внутрипросветных пузырьков • отрицательное регулирование транспорта белка • положительная регуляция развития проекции нейронов • транспорт белка • Сигнальный путь Wnt • деубиквитинирование белков • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8724	54198
Ансамбль	ENSG00000112335	ENSMUSG00000019804
UniProt	O60493	O70492
RefSeq (мРНК)	NM_152828 NM_001300928 NM_001300929 NM_003795 NM_152827	NM_017472
RefSeq (белок)	NP_001287857 NP_001287858 NP_003786 NP_690040	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 6: 108,21 - 108,26 Мб	Chr 10: 42,5 - 42,54 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Сортировка нексина-3 это белок что у людей кодируется SNX3 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует член сортировка нексина семья. Члены этого семейства содержат домен phox (PX), который является доменом связывания фосфоинозитидов, и участвуют во внутриклеточном движении. Этот белок не содержит области спиральной спирали, как большинство членов семьи. Этот белок взаимодействует с фосфатидилинозитол-3-фосфатом и участвует в транспортировке белков.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112335 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019804 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Haft CR, de la Luz Sierra M, Barr VA, Haft DH, Taylor SI (декабрь 1998 г.). «Идентификация семейства сортирующих молекул нексина и характеристика их ассоциации с рецепторами». Mol Cell Biol. 18 (12): 7278–87. Дои:10.1128 / mcb.18.12.7278. ЧВК  109309. PMID  9819414.
6. "Entrez Gene: SNX3, сортирующий нексин 3".

дальнейшее чтение

• Паркс В. Т., Фрэнк Д. Б., Хафф С. и др. (2001). «Сортировочный нексин 6, новый SNX, взаимодействует с семейством трансформирующего фактора роста бета рецепторных серин-треониновых киназ». J. Biol. Chem. 276 (22): 19332–9. Дои:10.1074 / jbc.M100606200. PMID  11279102.
• Xu Y, Hortsman H, Seet L, et al. (2001). «SNX3 регулирует эндосомную функцию через свое опосредованное PX-доменом взаимодействие с PtdIns (3) P». Nat. Cell Biol. 3 (7): 658–66. Дои:10.1038/35083051. PMID  11433298. S2CID  32893219.
• Вервурт В.С., Вилджоен Д., Смарт Р. и др. (2003). «Сортировка нексина 3 (SNX3) нарушена у пациента с транслокацией t (6; 13) (q21; q12) и фенотипом микроцефалии, микрофтальмии, эктродактилии, прогнатизма (MMEP)». J. Med. Genet. 39 (12): 893–9. Дои:10.1136 / jmg.39.12.893. ЧВК  1757218. PMID  12471201.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л. и др. (2004). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Кумар Р.А., Эверман Д.Б., Морган С.Т. и др. (2007). «Отсутствие мутаций в NR2E1 и SNX3 у пяти пациентов с MMEP (микроцефалия, микрофтальмия, эктродактилия и прогнатизм) и родственными фенотипами». BMC Med. Genet. 8: 48. Дои:10.1186/1471-2350-8-48. ЧВК  1950490. PMID  17655765.