SPARCL1 - SPARCL1

SPARCL1
Идентификаторы
Псевдонимы	SPARCL1, MAST 9, MAST9, PIG33, SC1, SPARC как 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 606041 MGI: 108110 ГомолоГен: 3438 Генные карты: SPARCL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q22.1 Начинать 87,473,335 бп[1] Конец 87,531,061 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • связывание ионов кальция • связывание коллагена • связывание внеклеточного матрикса • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • внеклеточный • просвет эндоплазматического ретикулума • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс • глутаматергический синапс Биологический процесс • преобразование сигнала • развитие анатомической структуры • посттрансляционная модификация • метаболический процесс клеточного белка • адгезия синаптической мембраны Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8404	13602
Ансамбль	ENSG00000152583	ENSMUSG00000029309
UniProt	Q14515	P70663
RefSeq (мРНК)	NM_004684 NM_001128310 NM_001291976 NM_001291977	NM_010097 NM_001359014 NM_001359016
RefSeq (белок)	NP_001121782 NP_001278905 NP_001278906 NP_004675	NP_034227 NP_001345943 NP_001345945
Расположение (UCSC)	Chr 4: 87,47 - 87,53 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

SPARC-подобный белок 1 (SPARCL1 или же SC1), также известный как Hevin (Короче для высокий эндотелиальный белок венулы), представляет собой секретируемый белок с высоким структурным сходством с SPARC.^[4][5] Он взаимодействует с внеклеточный матрикс создать промежуточные состояния клеточная адгезия.^[6] Благодаря своей динамической внеклеточной роли, он участвует в развитии рака метастаз и воспаление, считается матрицеклеточный белок.^[7][8] У людей хевин кодируется SPARCL1 ген.^[9][10]

Смотрите также

• Тромбоспондин
• Tenascin

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000152583 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Girard JP, Springer TA (январь 1995 г.). «Клонирование из очищенных клеток венулы высокого эндотелия гевина, близкого родственника антиадгезивного белка внеклеточного матрикса SPARC». Иммунитет. 2 (1): 113–23. Дои:10.1016/1074-7613(95)90083-7. PMID  7600298.
5. Hambrock HO, Nitsche DP, Hansen U, Bruckner P, Paulsson M, Maurer P, Hartmann U (март 2003 г.). «SC1 / hevin. Внеклеточный белок, модулированный кальцием, который связывает коллаген I». Журнал биологической химии. 278 (13): 11351–8. Дои:10.1074 / jbc.M212291200. PMID  12538579.
6. Салливан М.М., Баркер Т.Х., Фанк С.Е., Карчин А., Сео Н.С., Хёок М., Сандерс Дж., Старчер Б., Уайт Т.Н., Пуолаккайнен П., Сейдж Э.Х. (сентябрь 2006 г.). «Матрикулярный хевин регулирует выработку декорина и сборку коллагена». Журнал биологической химии. 281 (37): 27621–32. Дои:10.1074 / jbc.M510507200. PMID  16844696.
7. Моррис А.Х., Кириакидес Т.Р. (июль 2014 г.). «Матрицеллюлярные белки и биоматериалы». Матричная биология. 37: 183–91. Дои:10.1016 / j.matbio.2014.03.002. ЧВК  4167162. PMID  24657843.
8. Салливан М.М., Сейдж Э.Х. (июнь 2004 г.). «Hevin / SC1, матричный гликопротеин и потенциальный опухолевый супрессор семейства SPARC / BM-40 / остеонектин». Международный журнал биохимии и клеточной биологии. 36 (6): 991–6. Дои:10.1016 / j.biocel.2004.01.017. PMID  15094114.
9. Шрамл П., Шипман Р., Штульц П., Людвиг К.Ю. (март 1993 г.). «Создание библиотеки вычитания кДНК с использованием метода вычитания с помощью магнита (MAST)». Тенденции в генетике. 9 (3): 70–1. Дои:10.1016/0168-9525(93)90216-5. PMID  8488563.
10. "Entrez Gene: SPARCL1 SPARC-подобный 1 (mast9, hevin)".

дальнейшее чтение

• Girard JP, Springer TA (февраль 1996 г.). «Модуляция адгезии эндотелиальных клеток хевином, кислым белком, связанным с венулами высокого эндотелия». Журнал биологической химии. 271 (8): 4511–7. Дои:10.1074 / jbc.271.8.4511. PMID  8626806.
• Клаескенс А., Онгенаэ Н., Нифс Дж. М., Чейнс П., Кайджен П., Коулс М., Куто Е. (март 2000 г.). «Хевин подавляется при многих раковых заболеваниях и является негативным регулятором роста и пролиферации клеток». Британский журнал рака. 82 (6): 1123–30. Дои:10.1054 / bjoc.1999.1051. ЧВК  2363342. PMID  10735494.
• Шмитт-Ульмс Г., Хансен К., Лю Дж., Каудри С., Ян Дж., ДеАрмонд С.Дж., Коэн Ф.Э., Прусинер С.Б., Болдуин М.А. (июнь 2004 г.). «Регулируемая по времени транскардиальная перфузия кросслинкинга для изучения белковых взаимодействий в сложных тканях». Природа Биотехнологии. 22 (6): 724–31. Дои:10.1038 / nbt969. PMID  15146195. S2CID  36630738.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А., Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Геномные исследования. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Ли Й., Арока-Агилар Дж. Д., Гош С., Санчес-Санчес Ф., Эскрибано Дж., Кока-Прадос М. (январь 2006 г.). «Взаимодействие миоцилина с С-концевой областью хевина». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 339 (3): 797–804. Дои:10.1016 / j.bbrc.2005.11.082. PMID  16316624.
• Лю Т., Цянь В.Дж., Гриценко М.А., Camp DG, Монро М.Э., Мур Р.Дж., Смит Р.Д. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии». Журнал протеомных исследований. 4 (6): 2070–80. Дои:10.1021 / pr0502065. ЧВК  1850943. PMID  16335952.
• Scalabrini D, Fenoglio C, Scarpini E, De Riz M, Comi C, Venturelli E, Cortini F, Piola M, Villa C, Naldi P, Monaco F, Bresolin N, Galimberti D (октябрь 2007 г.). «Кандидатный генный анализ гена SPARCL1 у пациентов с рассеянным склерозом». Письма о неврологии. 425 (3): 173–6. Дои:10.1016 / j.neulet.2007.08.020. PMID  17825989. S2CID  9381979.