Остеонектин - Osteonectin

SPARC
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1БМО, 1 НУБ, 1SRA, 2V53
Идентификаторы
Псевдонимы	SPARC, BM-40, ON, OI17, секретируемый кислый белок и богатый цистеином, ONT
Внешние идентификаторы	OMIM: 182120 MGI: 98373 ГомолоГен: 31132 Генные карты: SPARC
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q33.1 Начинать 151,661,096 бп[1] Конец 151,686,975 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B1.3 | 11 33,04 см Начинать 55,394,500 бп[2] Конец 55,423,183 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов кальция • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание внеклеточного матрикса • связывание коллагена • структурная составляющая внеклеточного матрикса Сотовый компонент • цитоплазма • альфа-гранула тромбоцитов • просвет эндоцитарных пузырьков • ядерная матрица • клеточная мембрана • внутриклеточный • базальная мембрана • поверхность клетки • мембрана альфа-гранул тромбоцитов • митохондрия • просвет альфа-гранул тромбоцитов • ядро клетки • внеклеточный • везикул • внеклеточная область • внеклеточный матрикс • синапс • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс • глутаматергический синапс Биологический процесс • ответ на цитокин • реакция на ион кадмия • окостенение • развитие легких • клеточный ответ на стимул фактора роста • ответ на пептидный гормон • дегрануляция тромбоцитов • организация внеклеточного матрикса • ответ на L-аскорбиновую кислоту • ответ на глюкокортикоиды • лечение раны • рецептор-опосредованного эндоцитоза • отрицательная регуляция пролиферации эндотелиальных клеток • положительная регуляция миграции эндотелиальных клеток • ответ на ион кальция • реакция на гравитацию • развитие сердца • ответ на липополисахарид • реакция на ион свинца • регулирование пролиферации клеток • отрицательная регуляция ангиогенеза • развитие внутреннего уха • регуляция морфогенеза клеток • ответ на цАМФ • реакция на этанол • развитие костей • преобразование сигнала • пигментация • регулирование организации синапсов Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6678	20692
Ансамбль	ENSG00000113140	ENSMUSG00000018593
UniProt	P09486	P07214
RefSeq (мРНК)	NM_003118 NM_001309443 NM_001309444	NM_009242 NM_001290817
RefSeq (белок)	NP_001296372 NP_001296373 NP_003109	NP_001277746 NP_033268
Расположение (UCSC)	Chr 5: 151.66 - 151.69 Мб	Chr 11: 55.39 - 55.42 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Не путать с Остеокальцин или же Остеопонтин.

Остеонектин (ON) также известен как секретируемый белок кислый и богат цистеином (SPARC) или белок базальной мембраны 40 (БМ-40) - это белок что у людей кодируется SPARC ген.

Остеонектин - это гликопротеин в кость связывающий кальций. Он секретируется остеобласты во время формирования костей, инициируя минерализацию и способствуя образованию минеральных кристаллов. Остеонектин также проявляет сродство к коллаген помимо костного минерального кальция. Корреляция между избыточной экспрессией остеонектина и ампульный рак и хронические панкреатит был найден.

Ген

Ген SPARC человека имеет длину 26,5 т.п.н., содержит 10 экзонов и 9 интронов и расположен на хромосоме 5q31-q33.

Структура

Остеонектин представляет собой кислый и богатый цистеином гликопротеин 40 кДа, состоящий из одной полипептидной цепи, которая может быть разбита на 4 домена: 1) Са⁺⁺ связывающий домен рядом с богатой глутаминовой кислотой областью на аминоконце (домен I), 2) богатым цистеином доменом (II), 3) гидрофильной областью (домен III) и 4) EF рука мотив в области карбокси-конца (домен IV).^[5]

Функция

Остеонектин - кислый внеклеточный матрикс гликопротеин, который играет жизненно важную роль в минерализации костей, клеточная матрица взаимодействия и связывание коллагена. Остеонектин также увеличивает производство и активность матричные металлопротеиназы, функция, важная для проникновения раковых клеток в кости. Дополнительные функции остеонектина, полезные для опухолевых клеток, включают: ангиогенез, распространение и миграция. Избыточная экспрессия остеонектина наблюдается при многих раковых заболеваниях человека, таких как рак груди, простаты и толстой кишки.^[6]

Эта молекула участвует в нескольких биологических функциях, включая минерализацию костей и хрящей, ингибирование минерализации, модуляцию пролиферации клеток, облегчение приобретения дифференцированного фенотипа и содействие прикреплению и распространению клеток.

В костях содержится ряд фосфопротеинов и гликопротеинов. Фосфат связывается с основной цепью белка через фосфорилированные аминокислотные остатки серина или треонина. Из этих костных белков лучше всего охарактеризован остеонектин. Он связывает коллаген и гидроксиапатит отдельными доменами, в относительно больших количествах обнаруживается в незрелой кости и способствует минерализации коллагена.

Распределение тканей

Фибробласты, в том числе фибробласты пародонта, синтезируют остеонектин.^[7] Этот белок синтезируется макрофагами в местах заживления ран и дегрануляции тромбоцитов, поэтому он может играть важную роль в заживлении ран. SPARC не поддерживает прикрепление клеток и, подобно тенасцину, является антиадгезивом и ингибитором распространения клеток. Нарушает очаговые спайки в фибробластах. Он также регулирует пролиферацию некоторых клеток, особенно эндотелиальных клеток, благодаря его способности связываться с цитокинами и факторами роста.^[8] Также было обнаружено, что остеонектин снижает синтез ДНК в культивируемой кости.^[9]

Высокие уровни иммунодетектируемого остеонектина обнаружены в активных остеобластах и ​​клетках-предшественниках костного мозга, одонтобластах, клетках периодонтальной связки и десны, а также в некоторых хондроцитах и ​​гипертрофических хондроцитах. Остеонектин также обнаруживается в остеоиде, собственно костном матриксе и дентине. Остеонектин локализован в различных тканях, но в наибольшем количестве он обнаруживается в костной ткани, тканях, характеризующихся высокой активностью (например, эпителий кишечника), базальных мембранах и некоторых новообразованиях. Остеонектин экспрессируется множеством клеток, включая хондроциты, фибробласты, тромбоциты, эндотелиальные клетки, эпителиальные клетки, клетки Лейдига, клетки Сертоли, лютеиновые клетки, клетки коры надпочечников и многочисленные линии неопластических клеток (например, клетки SaOS-2 человека. остеосаркома).

Модельные организмы

Sparc нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Нормальный
Гомозиготная фертильность	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Беспокойство	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Аномальный[10]
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Аномальный[11]
Рентгенография	Аномальный[12]
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Аномальный[13]
Клиническая химия	Нормальный
Плазма иммуноглобулины	Нормальный
Гематология	Нормальный
Лимфоциты периферической крови	Нормальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Гистопатология головного мозга	Нормальный
Гистопатология глаз	Аномальный
МикроКТ и количественный факситрон	Аномальный
Сальмонелла инфекционное заболевание	Нормальный[14]
Citrobacter инфекционное заболевание	Нормальный[15]
Все тесты и анализы от[16][17]

Модельные организмы были использованы при изучении функции SPARC. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Sparc^{tm1a (EUCOMM) Wtsi[18][19]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[20][21][22]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[16][23] Было проведено 26 испытаний мутант мышей и шесть значительных отклонений.^[16] Гомозиготные животные-мутанты имели необычно белый цвет. резцы, уменьшилось костный минерал плотность, аномальная линза морфология, катаракта и уменьшенная длина длинных костей.^[16]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113140 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000018593 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Villarreal XC, Mann KG, Long GL (июль 1989 г.). «Структура остеонектина человека на основе анализа кДНК и геномных последовательностей». Биохимия. 28 (15): 6483–91. Дои:10.1021 / bi00441a049. PMID  2790009.
6. Guweidhi A, Kleeff J, Adwan H, Giese NA, Wente MN, Giese T., Büchler MW, Berger MR, Friess H (август 2005 г.). «Остеонектин влияет на рост и инвазию раковых клеток поджелудочной железы». Анналы хирургии. 242 (2): 224–34. Дои:10.1097 / 01.sla.0000171866.45848.68. ЧВК  1357728. PMID  16041213.
7. Васи С., Оцука К., Яо К.Л., Тунг П.С., Обин Дж. Э., Содек Дж., Термин Дж. Д. (июнь 1984 г.). «Остеонектиноподобный белок в периодонтальной связке свиней и его синтез фибробластами периодонтальной связки». Канадский журнал биохимии и клеточной биологии. 62 (6): 470–8. Дои:10.1139 / o84-064. PMID  6380686.
8. Янг М.Ф., Керр Дж. М., Ибараки К., Хигаард А. М., Роби П. Г. (август 1992 г.). «Структура, экспрессия и регуляция основных неколлагеновых матричных белков кости». Клиническая ортопедия и смежные исследования (281): 275–94. Дои:10.1097/00003086-199208000-00042. PMID  1499220.
9. Lane TF, Sage EH (февраль 1994 г.). «Биология SPARC, белка, который модулирует взаимодействия клеточного матрикса». Журнал FASEB. 8 (2): 163–73. Дои:10.1096 / fasebj.8.2.8119487. PMID  8119487. S2CID  32958146.
10. «Данные дисморфологии для Sparc». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
11. «Данные DEXA для Sparc». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
12. «Данные рентгенографии для Sparc». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
13. «Данные морфологии глаз для Sparc». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
14. "Сальмонелла данные о заражении Sparc ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
15. "Citrobacter данные о заражении Sparc ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
16. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
17. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
18. «Международный консорциум нокаут-мышей».
19. "Информатика генома мыши".
20. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
21. Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
22. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
23. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение

• Ян Кью, Сейдж Э.Х. (декабрь 1999 г.). «SPARC, матрицеклеточный гликопротеин с важными биологическими функциями». Журнал гистохимии и цитохимии. 47 (12): 1495–506. Дои:10.1177/002215549904701201. PMID  10567433.
• Altura BM (июнь 1975 г.). «Фармакологические эффекты альфа-метилдопы, альфа-метилнорепинефрина и октопамина на артериолярные, артериальные и терминальные сосуды крыс гладкие». Циркуляционные исследования. 36 (6 Дополнение 1): 233–40. Дои:10.1161 / 01.res.36.6.233. PMID  1093755. S2CID  35426082.
• Рейнс Е.В., Лейн Т.Ф., Ируэла-Ариспе М.Л., Росс Р., Сейдж Е.Н. (февраль 1992 г.). «Внеклеточный гликопротеин SPARC взаимодействует с фактором роста тромбоцитов (PDGF) -AB и -BB и ингибирует связывание PDGF с его рецепторами». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 89 (4): 1281–5. Bibcode:1992PNAS ... 89.1281R. Дои:10.1073 / pnas.89.4.1281. ЧВК  48433. PMID  1311092.
• Mundlos S, Schwahn B, Reichert T, Zabel B (февраль 1992 г.). «Распределение мРНК и белка остеонектина во время эмбрионального и внутриутробного развития человека». Журнал гистохимии и цитохимии. 40 (2): 283–91. Дои:10.1177/40.2.1552170. PMID  1552170.
• Кельм Р.Дж., Манн К.Г. (март 1990 г.). «Человеческий остеонектин тромбоцитов: высвобождение, поверхностная экспрессия и частичная характеристика». Кровь. 75 (5): 1105–13. Дои:10.1182 / blood.V75.5.1105.1105. PMID  2306517.
• Молодой М.Ф., Дэй А.А., Доминкес П., Маккуиллан К.И., Фишер Л.В., Термин Д.Д. (1990). «Структура и экспрессия мРНК остеонектина в тканях человека». Соединительная ткань исследования. 24 (1): 17–28. Дои:10.3109/03008209009152419. PMID  2338025.
• Метсяранта М., Молодой М.Ф., Сандберг М., Термин Дж., Вуорио Э. (сентябрь 1989 г.). «Локализация экспрессии остеонектина в скелетных тканях человеческого плода путем гибридизации in situ». Calcified Tissue International. 45 (3): 146–52. Дои:10.1007 / BF02556057. PMID  2505905. S2CID  32528538.
• Сейдж Х, Вернон РБ, Фанк С.Е., Эверитт Э.А., Ангелло Дж. (Июль 1989 г.). «SPARC, секретируемый белок, связанный с клеточной пролиферацией, ингибирует распространение клеток in vitro и проявляет Ca + 2-зависимое связывание с внеклеточным матриксом». Журнал клеточной биологии. 109 (1): 341–56. Дои:10.1083 / jcb.109.1.341. ЧВК  2115491. PMID  2745554.
• Swaroop A, Hogan BL, Francke U (январь 1988 г.). «Молекулярный анализ кДНК для человеческого SPARC / остеонектина / BM-40: последовательность, экспрессия и локализация гена на хромосоме 5q31-q33». Геномика. 2 (1): 37–47. Дои:10.1016/0888-7543(88)90107-3. PMID  2838412.
• Вевер У. М., Альбрехтсен Р., Фишер Л. В., Янг М. Ф., Термин Д. Д. (август 1988 г.). «Остеонектин / SPARC / BM-40 в децидуальной оболочке человека и карциноме, тканях, характеризующихся образованием de novo базальной мембраны». Американский журнал патологии. 132 (2): 345–55. ЧВК  1880722. PMID  3400777.
• Clezardin P, Malaval L, Ehrensperger AS, Delmas PD, Dechavanne M, McGregor JL (август 1988 г.). «Комплексное образование тромбоспондина человека с остеонектином». Европейский журнал биохимии / FEBS. 175 (2): 275–84. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1988.tb14194.x. PMID  3402455.
• Ланкат-Буттгерайт Б., Манн К., Дойцманн Р., Тимпл Р., Криг Т. (август 1988 г.). «Клонирование и полные аминокислотные последовательности белка базальной мембраны человека и мыши BM-40 (SPARC, остеонектин)». Письма FEBS. 236 (2): 352–6. Дои:10.1016/0014-5793(88)80054-1. PMID  3410046. S2CID  22117205.
• Стеннер Д.Д., Трейси Р.П., Риггс Б.Л., Манн К.Г. (сентябрь 1986 г.). «Человеческие тромбоциты содержат и секретируют остеонектин, основной белок минерализованной кости». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 83 (18): 6892–6. Bibcode:1986PNAS ... 83.6892S. Дои:10.1073 / пнас.83.18.6892. ЧВК  386616. PMID  3489235.
• Jundt G, Berghäuser KH, Termine JD, Schulz A (май 1987 г.). «Остеонектин - маркер дифференцировки костных клеток». Исследования клеток и тканей. 248 (2): 409–15. Дои:10.1007 / bf00218209. PMID  3581152. S2CID  38472373.
• Фишер Л. В., Хокинс Г. Р., Туросс Н., Термин Дж. Д. (июль 1987 г.). «Очистка и частичная характеристика малых протеогликанов I и II, костных сиалопротеинов I и II и остеонектина из минерального компартмента развивающейся кости человека». Журнал биологической химии. 262 (20): 9702–8. PMID  3597437.
• Сейдж Х., Джонсон С., Борнштейн П. (март 1984 г.). «Характеристика нового сывороточного альбумин-связывающего гликопротеина, секретируемого эндотелиальными клетками в культуре». Журнал биологической химии. 259 (6): 3993–4007. PMID  6368555.
• Термин Дж. Д., Клейнман Х. К., Уитсон С. В., Конн К. М., МакГарви М. Л., Мартин Г. Р. (октябрь 1981 г.). «Остеонектин, костно-специфический белок, связывающий минерал с коллагеном». Клетка. 26 (1 Пет 1): 99–105. Дои:10.1016/0092-8674(81)90037-4. PMID  7034958. S2CID  1625045.
• Се Р.Л., Лонг Г.Л. (сентябрь 1995 г.). «Роль N-связанного гликозилирования в остеонектине человека. Влияние удаления углеводов с помощью N-гликаназы и сайт-направленного мутагенеза на структуру и связывание коллагена V типа». Журнал биологической химии. 270 (39): 23212–7. Дои:10.1074 / jbc.270.39.23212. PMID  7559469.
• Маурер П., Хоэнадл С., Хоэнестер Э, Геринг В., Тимпл Р., Энгель Дж. (Октябрь 1995 г.). «С-концевая часть BM-40 (SPARC / остеонектин) представляет собой автономно сворачивающийся и кристаллизующийся домен, который связывает кальций и коллаген IV». Журнал молекулярной биологии. 253 (2): 347–57. Дои:10.1006 / jmbi.1995.0557. PMID  7563094.

внешняя ссылка

• Остеонектин в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)