CAMK2D - CAMK2D

CAMK2D
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2ВН9, 2W2C, 2WEL, 3GP2
Идентификаторы
Псевдонимы	CAMK2D, CAMKD, кальций / кальмодулин-зависимая протеинкиназа II дельта
Внешние идентификаторы	OMIM: 607708 MGI: 1341265 ГомолоГен: 55561 Генные карты: CAMK2D
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q26 Начните 113,451,032 бп[1] Конец 113,761,927 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 G1 Начните 126,596,302 бп[2] Конец 126,846,326 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • киназная активность • Связывание АТФ • активность протеинкиназы • связывание тайтина • трансферазная активность • активность гомодимеризации белков • GO: 0001948 связывание с белками • связывание нуклеотидов • активность ингибитора натриевых каналов • активность кальмодулин-зависимой протеинкиназы • Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов • активность протеин-серин / треонинкиназы • связывание ионного канала • связывание кальмодулина • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • мембрана эндоцитарных везикул • мембрана • мембрана саркоплазматического ретикулума • клеточная мембрана • нуклеоплазма • саркоплазматический ретикулум • сарколемма • проекция нейрона • ядро клетки • цитоплазма • цитозоль • комплекс кальциевых каналов Биологический процесс • регулирование сердечных сокращений • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция деполяризации мембраны • положительная регуляция гипертрофии сердечной мышцы • фосфорилирование белков • клеточный ответ на ион кальция • регуляция потенциала действия клеток сердечной мышцы, участвующего в регуляции сокращения • регуляция активности гистондеацетилазы • регуляция клеточной локализации • отрицательная регуляция трансмембранного транспорта ионов натрия • фосфорилирование • регулирование силы сердечных сокращений • регулирование сокращения сердечной мышцы путем регулирования высвобождения секвестрированного иона кальция • регуляция активности рианодин-чувствительных каналов высвобождения кальция • отрицательная регуляция активности трансмембранного переносчика ионов натрия • Каскад MAPK • олигомеризация белков • регулирование роста клеток • регуляция клеточного ответа на тепло • регулирование клеточной коммуникации посредством электрического взаимодействия, участвующего в сердечной проводимости • регулирование частоты сердечных сокращений сердечной проводимостью • развитие нервной системы • дифференциация клеток • регулирование межклеточной связи посредством электрической связи • положительная регуляция процесса апоптоза клеток сердечной мышцы • регулирование высвобождения секвестрированного иона кальция в цитозоль саркоплазматическим ретикулумом • фосфорилирование пептидил-серина • фосфорилирование пептидил-треонина • эндоплазматический ретикулум гомеостаз ионов кальция • аутофосфорилирование • расслабление сердечной мышцы • сокращение клеток сердечной мышцы • регуляция потенциала действия клеток сердечной мышцы • регуляция расслабления сердечной мышцы • регулирование трансмембранного транспорта ионов кальция через высоковольтный кальциевый канал Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	817	108058
Ансамбль	ENSG00000145349	ENSMUSG00000053819
UniProt	Q13557	Q6PHZ2
RefSeq (мРНК)	NM_001221 NM_172114 NM_172115 NM_172127 NM_172128 NM_172129 NM_001321566 NM_001321567 NM_001321568 NM_001321569 NM_001321570 NM_001321571 NM_001321572 NM_001321573 NM_001321574 NM_001321575 NM_001321576 NM_001321577 NM_001321578 NM_001321579 NM_001321580 NM_001321581 NM_001321582 NM_001321583 NM_001321584 NM_001321585 NM_001321586 NM_001321587 NM_001321588 NM_001321589 NM_001321590 NM_001321591 NM_001321592	NM_001025438 NM_001025439 NM_001293663 NM_001293664 NM_001293665 NM_001293666 NM_023813 NM_001346635 NM_001346636
RefSeq (белок)	NP_001212 NP_001308495 NP_001308496 NP_001308497 NP_001308498 NP_001308499 NP_001308500 NP_001308501 NP_001308502 NP_001308503 NP_001308504 NP_001308505 NP_001308506 NP_001308507 NP_001308508 NP_001308509 NP_001308510 NP_001308511 NP_001308512 NP_001308513 NP_001308514 NP_001308515 NP_001308516 NP_001308517 NP_001308518 NP_001308519 NP_001308520 NP_001308521 NP_742112 NP_742113 NP_742125 NP_742126 NP_742127	NP_001020609 NP_001020610 NP_001280592 NP_001280593 NP_001280594 NP_001280595 NP_001333564 NP_001333565 NP_076302
Расположение (UCSC)	Chr 4: 113.45 - 113.76 Мб	Chr 3: 126,6 - 126,85 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Кальций / кальмодулин-зависимая протеинкиназа дельта-цепи типа II является фермент что у людей кодируется CAMK2D ген.^[5]

Продукт этого гена принадлежит к серин / треониновая протеинкиназа семье и Ca²⁺/ кальмодулин-зависимая протеинкиназа подсемейство. Сигнализация кальция имеет решающее значение для нескольких аспектов пластичность в глутаматергические синапсы. В клетках млекопитающих фермент состоит из четырех различных цепей: альфа, бета, гамма и дельта. Продукт этого гена представляет собой дельта-цепь. Четыре альтернативно сращенный варианты расшифровки, которые кодируют три разных изоформы были охарактеризованы на сегодняшний день. Разные изоформы этой цепи имеют разные паттерны экспрессии.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145349 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053819 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: кальций / кальмодулин-зависимая протеинкиназа (СаМ киназа) II дельта CAMK2D».

дальнейшее чтение

• Крюк SS, Средство AR (2001). "Ca²⁺/ СаМ-зависимые киназы: от активации к функции ». Анну. Rev. Pharmacol. Токсикол. 41 (1): 471–505. Дои:10.1146 / annurev.pharmtox.41.1.471. PMID  11264466.
• Ямамото Х (2002). «[Молекулярные механизмы внутриклеточной локализации Са²⁺/ Изоформы кальмодулинзависимой протеинкиназы II и их физиологические функции] ». Танпакушицу Какусан Косо. 47 (3): 241–7. PMID  11889801.
• де Гроот Р.П., ден Хертог Дж., Ванденхид Дж. Р. и др. (1993). «Множественные и кооперативные события фосфорилирования регулируют функцию активатора CREM». EMBO J. 12 (10): 3903–11. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb06068.x. ЧВК  413673. PMID  8404858.
• Могилы Р.М., Кристал Г.В. (1997). «Идентификация новых вариантов CaMK-II, специфичных для опухолевых клеток человека». Биохим. Биофиз. Acta. 1355 (3): 281–92. Дои:10.1016 / S0167-4889 (96) 00141-3. PMID  9060999.
• Мойерс Дж. С., Билан П. Дж., Чжу Дж., Кан Ч. Р. (1997). «Rad и Rad-связанные GTPases взаимодействуют с кальмодулином и кальмодулин-зависимой протеинкиназой II». J. Biol. Chem. 272 (18): 11832–9. Дои:10.1074 / jbc.272.18.11832. PMID  9115241.
• Мёлиг М., Вольтер С., Майер П. и др. (1997). "Клетки инсулиномы содержат изоформу Са²⁺/ кальмодулин-зависимая протеинкиназа II дельта, связанная с везикулами секреции инсулина ». Эндокринология. 138 (6): 2577–84. Дои:10.1210 / en.138.6.2577. PMID  9165051.
• Баух А., Кэмпбелл К.С., Рет М. (1998). «Взаимодействие цитоплазматического домена CD5 с Ca²⁺/ кальмодулин-зависимая киназа IIdelta ». Евро. J. Immunol. 28 (7): 2167–77. Дои:10.1002 / (SICI) 1521-4141 (199807) 28:07 <2167 :: AID-IMMU2167> 3.0.CO; 2-L. PMID  9692886.
• Центр Сангера, The; Центр секвенирования генома Вашингтонского университета, The (1999). «К полной последовательности человеческого генома». Genome Res. 8 (11): 1097–108. Дои:10.1101 / гр. 8.11.1097. PMID  9847074.
• Хох Б., Мейер Р., Хетцер Р. и др. (1999). «Идентификация и экспрессия дельта-изоформ многофункционального Ca²⁺/ кальмодулин-зависимая протеинкиназа в поврежденном и исправном миокарде человека ». Circ. Res. 84 (6): 713–21. Дои:10.1161 / 01.res.84.6.713. PMID  10189359.
• Томбес Р.М., Миккельсен Р.Б., Джарвис В.Д., Грант С. (1999). «Подавление дельта-киназы CaM II в опухолевых клетках человека». Биохим. Биофиз. Acta. 1452 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0167-4889 (99) 00113-5. PMID  10525155.
• Rochlitz H, Voigt A, Lankat-Buttgereit B и др. (2000). "Клонирование и количественное определение человеческого Ca²⁺/ изоформы кальмодулинзависимой протеинкиназы II (CaMK II) в бета-клетках человека ». Диабетология. 43 (4): 465–73. Дои:10.1007 / s001250051330. PMID  10819240.
• Инагаки Н., Нисидзава М., Аримура Н. и др. (2000). "Активация Са²⁺/ кальмодулин-зависимая протеинкиназа II в постсинаптических дендритных шипах культивируемых нейронов гиппокампа ». J. Biol. Chem. 275 (35): 27165–71. Дои:10.1074 / jbc.M003751200. PMID  10852918.
• Наир Дж. С., ДаФонсека С. Дж., Тьернберг А. и др. (2002). "Требование Ca²⁺ и CaMKII для фосфорилирования Stat1 Ser-727 в ответ на IFN-гамма ». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (9): 5971–6. Дои:10.1073 / pnas.052159099. ЧВК  122886. PMID  11972023.
• Мишра-Горур К, Певица HA, Кастеллот Дж.Дж. (2002). «Рибосомный белок S18 является предполагаемым субстратом для Ca²⁺/ кальмодулин-активированная протеинкиназа II ». J. Biol. Chem. 277 (37): 33537–40. Дои:10.1074 / jbc.C200342200. PMID  12145273.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Gaertner TR, Kolodziej SJ, Wang D, et al. (2004). «Сравнительный анализ трехмерных структур и ферментативных свойств альфа, бета, гамма и дельта изоформ Са²⁺-кальмодулин-зависимая протеинкиназа II ». J. Biol. Chem. 279 (13): 12484–94. Дои:10.1074 / jbc.M313597200. PMID  14722083.
• Баллиф Б.А., Виллен Дж., Босолей С.А. и др. (2005). «Фосфопротеомный анализ развивающегося мозга мыши». Мол. Cell. Протеомика. 3 (11): 1093–101. Дои:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID  15345747.

внешние ссылки

• Человек CAMK2D расположение генома и CAMK2D страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.