CAMK2B - CAMK2B - Wikipedia

CAMK2B
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3BHH
Идентификаторы
Псевдонимы	CAMK2B, CAM2, CAMK2, CAMKB, кальций / кальмодулин-зависимая протеинкиназа II бета, MRD54, CaMKIIbeta
Внешние идентификаторы	OMIM: 607707 MGI: 88257 ГомолоГен: 111050 Генные карты: CAMK2B
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p13 Начинать 44,217,150 бп[1] Конец 44,334,577 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 A1 | 11 3,89 см Начинать 5,969,644 бп[2] Конец 6,066,362 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы • активность гомодимеризации белков • киназная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание актина • Связывание АТФ • активность протеин-серин / треонинкиназы • Активность фактора обмена Ras-гуанил-нуклеотидов • активность кальмодулин-зависимой протеинкиназы • связывание кальмодулина • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • мембрана эндоцитарных везикул • цитозоль • мембрана • клеточная мембрана • нуклеоплазма • центр организации микротрубочек • мембрана саркоплазматического ретикулума • саркоплазматический ретикулум • цитоскелет • цитоплазма • проекция нейрона • соединение клеток • синапс Биологический процесс • дифференциация клеток • регуляция структурной пластичности синапсов • регулирование транспорта ионов кальция • регуляция долговременной синаптической пластичности нейронов • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • фосфорилирование • развитие нервной системы • Каскад MAPK • развитие многоклеточного организма • положительная регуляция созревания синапсов • фосфорилирование белков • положительная регуляция развития проекции нейронов • аутофосфорилирование • регуляция адаптации скелетных мышц • положительная регуляция морфогенеза дендритного шипа • регуляция развития дендритных позвонков • преобразование сигнала • фосфорилирование пептидил-серина • фосфорилирование пептидил-треонина • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регуляция миграции нейронов • регуляция клеточного ответа на тепло Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	816	12323
Ансамбль	ENSG00000058404	ENSMUSG00000057897
UniProt	Q13554	P28652
RefSeq (мРНК)	NM_001220 NM_001293170 NM_172078 NM_172079 NM_172080 NM_172081 NM_172082 NM_172083 NM_172084	NM_001174053 NM_001174054 NM_007595
RefSeq (белок)	NP_001211 NP_001280099 NP_742075 NP_742076 NP_742077 NP_742078 NP_742079 NP_742080 NP_742081	NP_001167524 NP_001167525 NP_031621
Расположение (UCSC)	Chr 7: 44.22 - 44.33 Мб	Chr 11: 5.97 - 6.07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Бета-цепь кальций / кальмодулин-зависимой протеинкиназы типа II является фермент что у людей кодируется CAMK2B ген.

Функция

Продукт этого гена принадлежит к семейству серин / треониновых протеинкиназ и к Ca²⁺/ подсемейство кальмодулин-зависимых протеинкиназ. Передача сигналов кальция имеет решающее значение для нескольких аспектов пластичности глутаматергических синапсов. В клетках млекопитающих фермент состоит из четырех различных цепей: альфа, бета, гамма и дельта. Продукт этого гена - бета-цепь. Возможно, что разные изоформы этой цепи имеют разную клеточную локализацию и по-разному взаимодействуют с кальмодулином. Для этого гена идентифицировано восемь вариантов транскрипта, кодирующих восемь различных изоформ.^[5]

Взаимодействия

CAMK2B был показан взаимодействовать с Актинин альфа 4.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000058404 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057897 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: кальций / кальмодулин-зависимая протеинкиназа CAMK2B (CaM киназа) II бета».
6. Валиконис Р.С., Огуни А., Хорошева Е.М., Дженг С.Дж., Асунсьон Ф.Дж., Кеннеди МБ (Январь 2001 г.). «Денсин-180 образует тройной комплекс с (альфа) -субъединицей Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и (альфа) -актинином». J. Neurosci. 21 (2): 423–33. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.21-02-00423.2001. ЧВК  6763799. PMID  11160423.

дальнейшее чтение

• Ямамото Х (2002). «[Молекулярные механизмы внутриклеточной локализации изоформ Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и их физиологические функции]». Танпакушицу Какусан Косо. 47 (3): 241–7. PMID  11889801.
• Тиль Г., Черник А.Дж., Горелик Ф., Нэрн А.С., Грингард П. (1988). «Ca2 + / кальмодулин-зависимая протеинкиназа II: идентификация треонина-286 как сайта аутофосфорилирования в альфа-субъединице, связанного с генерацией Ca2 + -независимой активности». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 85 (17): 6337–41. Дои:10.1073 / пнас.85.17.6337. ЧВК  281965. PMID  2842767.
• Schworer CM, Colbran RJ, Keefer JR, Soderling TR (1988). «Са2 + / кальмодулин-зависимая протеинкиназа II. Идентификация регуляторного сайта аутофосфорилирования, соседнего с ингибирующим и кальмодулин-связывающим доменами». J. Biol. Chem. 263 (27): 13486–9. PMID  3417668.
• Penadés JR, Bernal D, Revert F, Johansson C, Fresquet VJ, Cervera J, Wieslander J, Quinones S, Saus J (1995). «Характеристика и экспрессия множества альтернативно сплайсированных транскриптов области гена антигена Goodpasture. Антитела Goodpasture распознают рекомбинантные белки, представляющие аутоантиген и одну из его альтернативных форм». Евро. J. Biochem. 229 (3): 754–60. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20524.x. PMID  7758473.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Омкумар Р.В., Кили М.Дж., Розенштейн А.Дж., Мин К.Т., Кеннеди МБ (1997). «Идентификация сайта фосфорилирования кальций / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II в субъединице NR2B рецептора N-метил-D-аспартата». J. Biol. Chem. 271 (49): 31670–8. Дои:10.1074 / jbc.271.49.31670. PMID  8940188.
• Могилы Р.М., Кристал Г.В. (1997). «Идентификация новых вариантов CaMK-II, специфичных для опухолевых клеток человека». Биохим. Биофиз. Acta. 1355 (3): 281–92. Дои:10.1016 / S0167-4889 (96) 00141-3. PMID  9060999.
• Мойерс Дж. С., Билан П. Дж., Чжу Дж., Кан Ч. Р. (1997). «Rad и Rad-связанные GTPases взаимодействуют с кальмодулином и кальмодулин-зависимой протеинкиназой II». J. Biol. Chem. 272 (18): 11832–9. Дои:10.1074 / jbc.272.18.11832. PMID  9115241.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Чанг Б.Х., Мукхерджи С., Содерлинг Т.Р. (1998). «Характеристика белка ингибитора кальмодулин киназы II в головном мозге». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (18): 10890–5. Дои:10.1073 / пнас.95.18.10890. ЧВК  27991. PMID  9724800.
• Рохлитц Х., Фойгт А, Ланкат-Буттгерайт Б, Гёке Б., Хаймберг Х., Наук М.А., Шиманн У., Шац Х., Пфайффер А.Ф. (2000). «Клонирование и количественное определение изоформ Ca2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II (CaMK II) человека в бета-клетках человека». Диабетология. 43 (4): 465–73. Дои:10.1007 / s001250051330. PMID  10819240.
• Ван П., Ву ИЛ, Чжоу Т.Х., Сунь И, Пей Г (2000). «Идентификация альтернативных вариантов сплайсинга бета-субъединицы Са (2 +) / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II человека с различной активностью». FEBS Lett. 475 (2): 107–10. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 01634-3. PMID  10858498. S2CID  39732332.
• Новак Г., Симан П., Таллерико Т. (2001). «Шизофрения: повышенная мРНК кальций-кальмодулин-зависимой протеинкиназы IIbeta во фронтальной коре головного мозга». Brain Res. Мол. Мозг Res. 82 (1–2): 95–100. Дои:10.1016 / S0169-328X (00) 00188-1. PMID  11042361.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Валиконис Р.С., Огуни А., Хорошева Е.М., Дженг С.Дж., Асунсьон Ф.Дж., Кеннеди МБ (2001). «Денсин-180 образует тройной комплекс с (альфа) -субъединицей Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и (альфа) -актинином». J. Neurosci. 21 (2): 423–33. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.21-02-00423.2001. ЧВК  6763799. PMID  11160423.
• Ляо GY, Вагнер DA, Hsu MH, Леонард JP (2001). «Доказательства прямой модуляции опосредованной протеинкиназой-C тока рецептора N-метил-D-аспартата». Мол. Pharmacol. 59 (5): 960–4. Дои:10.1124 / моль 59.5.960. PMID  11306676.
• Юэ Ц., Санборн Б.М. (2001). «KN-93 ингибирование передачи сигналов G-белка не зависит от способности Ca2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II фосфорилировать фосфолипазу Cbeta3 на 537-Ser». Мол. Клетка. Эндокринол. 175 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0303-7207 (01) 00383-5. PMID  11325525. S2CID  338776.
• Шелл М.Дж., Эрнё К., Ирвин РФ (2001). «Инозитол-1,4,5-трифосфат-3-киназа А связывается с F-актином и дендритными шипами через свой N-конец». J. Biol. Chem. 276 (40): 37537–46. Дои:10.1074 / jbc.M104101200. PMID  11468283.
• Ли Джи, Лаабич А., Лю ЛО, Сюэ Дж., Купер Н.Г. (2002). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности кальций / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II из головного мозга плода и взрослого человека. Анализ последовательности кальций / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II человеческого мозга». Мол. Биол. Представитель. 28 (1): 35–41. Дои:10.1023 / А: 1011951814898. PMID  11710563. S2CID  22670733.
• Поджи А., Карозио Р., Спаггиари Дж. М., Фортис С., Тамбусси Дж., Делль'Антонио Дж., Даль Син Е., Рубартелли А., Зоччи М. Р. (2002). «Активация NK-клеток дендритными клетками зависит от LFA-1-опосредованной индукции кальций-кальмодулинкиназы II: ингибирование С-концевым доменом Tat ВИЧ-1». J. Immunol. 168 (1): 95–101. Дои:10.4049 / jimmunol.168.1.95. PMID  11751951.

внешняя ссылка

• Человек CAMK2B расположение генома и CAMK2B страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.