DAPK2 - DAPK2

DAPK2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1WMK, 1WRZ, 1Z9X, 1ZUZ, 1ZWS, 2A27, 2A2A, 2CKE
Идентификаторы
Псевдонимы	DAPK2, DRP-1, DRP1, протеинкиназа 2, ассоциированная со смертью, протеинкиназа 2, ассоциированная со смертью
Внешние идентификаторы	OMIM: 616567 MGI: 1341297 ГомолоГен: 74940 Генные карты: DAPK2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 15 (человек)[1] Группа 15q22.31 Начинать 63,907,036 бп[1] Конец 64,072,033 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 C | 9 35,75 см Начинать 66,158,223 бп[2] Конец 66,272,242 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы • связывание кальмодулина • киназная активность • активность протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • Связывание АТФ Сотовый компонент • цитоплазма • просвет аутофагосомы • цитоплазматический пузырек • аппарат Гольджи • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • ядро клетки Биологический процесс • регуляция апоптотического процесса • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути • фосфорилирование • фосфорилирование белков • положительная регуляция хемотаксиса эозинофилов • регулирование аутофагии • Anoikis • положительная регуляция хемотаксиса нейтрофилов • аутофосфорилирование • миграция нейтрофилов • апоптотический процесс • фосфорилирование пептидил-серина • фосфорилирование пептидил-треонина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23604	13143
Ансамбль	ENSG00000035664	ENSMUSG00000032380
UniProt	Q9UIK4	Q8VDF3
RefSeq (мРНК)	NM_014326 NM_001363730	NM_010019
RefSeq (белок)	NP_055141 NP_001350659	NP_034149
Расположение (UCSC)	Chr 15: 63.91 - 64.07 Мб	Chr 9: 66.16 - 66.27 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связанная со смертью протеинкиназа 2 является фермент что у людей кодируется DAPK2 ген.^[5][6]

Этот ген кодирует белок, принадлежащий к серин / треониновая протеинкиназа семья. Этот белок содержит N-концевой домен протеинкиназы, за которым следует консервативный кальмодулин-связывающий домен со значительным сходством с ассоциированная со смертью протеинкиназа 1 (ДАПК1), положительный регулятор запрограммированная гибель клеток. Было показано, что сверхэкспрессия этого гена индуцирует клеточную апоптоз. Он использует несколько сайтов полиаденилирования.^[6] МРНК DAPK2 может подвергаться альтернативному сплайсингу для получения DAPK3 -подобная расшифровка кодировки.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000035664 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032380 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Каваи Т., Номура Ф., Хосино К., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Акира С. (июнь 1999 г.). «Связанная со смертью протеинкиназа 2 - это новая кальций / кальмодулин-зависимая протеинкиназа, которая сигнализирует об апоптозе благодаря своей каталитической активности». Онкоген. 18 (23): 3471–80. Дои:10.1038 / sj.onc.1202701. PMID  10376525.
6. «Ген Entrez: протеинкиназа 2, ассоциированная со смертью DAPK2».
7. Шовал, Ишай; Берисси, Ханна; Кимчи, Ади; Пьетроковский, Шмуэль (2011). «Новая модульность DAP-киназ: альтернативный сплайсинг гена DRP-1 производит изоформу, подобную ZIPk». PLOS ONE. 6 (2): e17344. Дои:10.1371 / journal.pone.0017344. ЧВК  3050894. PMID  21408167.

дальнейшее чтение

• Инбал Б., Шани Дж., Коэн О. и др. (2000). «Связанный со смертью протеин-киназа-родственный белок 1, новая серин / треонинкиназа, участвующая в апоптозе». Мол. Клетка. Биол. 20 (3): 1044–54. Дои:10.1128 / MCB.20.3.1044-1054.2000. ЧВК  85221. PMID  10629061.
• Шани Дж., Хенис-Коренблит С., Йона Дж. И др. (2001). «Аутофосфорилирование ограничивает апоптотическую активность киназы DRP-1, контролируя димеризацию и связывание кальмодулина». EMBO J. 20 (5): 1099–113. Дои:10.1093 / emboj / 20.5.1099. ЧВК  145456. PMID  11230133.
• Вонг Т.С., Чанг Х.В., Тан К.С. и др. (2002). «Высокая частота гиперметилирования промотора гена ассоциированной со смертью протеинкиназы при карциноме носоглотки и его обнаружение в периферической крови пациентов». Clin. Рак Res. 8 (2): 433–7. PMID  11839660.
• Чан М.В., Чан Л.В., Тан Н.Л. и др. (2002). «Гиперметилирование нескольких генов в опухолевых тканях и мочеиспускании у больных раком мочевого пузыря». Clin. Рак Res. 8 (2): 464–70. PMID  11839665.
• Инбал Б., Бялик С., Сабанай И. и др. (2002). «Киназа DAP и DRP-1 опосредуют образование пузырьков на мембране и образование аутофагических пузырьков во время запрограммированной гибели клеток». J. Cell Biol. 157 (3): 455–68. Дои:10.1083 / jcb.200109094. ЧВК  2173279. PMID  11980920.
• Сато А., Тойота М, Ито Ф. и др. (2002). «Метилирование ДНК и деацетилирование гистонов, связанные с подавлением экспрессии гена киназы DAP при колоректальном раке и раке желудка». Br. J. Рак. 86 (11): 1817–23. Дои:10.1038 / sj.bjc.6600319. ЧВК  2375414. PMID  12087472.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Барриос-Родилес М., Браун К.Р., Оздамар Б. и др. (2005). «Высокопроизводительное отображение динамической сигнальной сети в клетках млекопитающих». Наука. 307 (5715): 1621–5. Дои:10.1126 / science.1105776. PMID  15761153.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983.
• Рицци М., Чан М.П., ​​Бричги С. и др. (2007). «Связанная со смертью протеинкиназа 2 активируется во время нормальной миелоидной дифференцировки и увеличивает созревание нейтрофилов в миелоидных лейкозных клетках». J. Leukoc. Биол. 81 (6): 1599–608. Дои:10.1189 / jlb.0606400. PMID  17347302.