Циклинзависимая киназа 4 - Cyclin-dependent kinase 4 - Wikipedia

CDK4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2W96, 2W99, 2W9F, 2W9Z, 3G33, 5FWL, 5FWM, 5FWK
Идентификаторы
Псевдонимы	CDK4, CMM3, PSK-J3, циклин-зависимая киназа 4, циклин-зависимая киназа 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 123829 MGI: 88357 ГомолоГен: 55429 Генные карты: CDK4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q14.1 Начинать 57,747,727 бп[1] Конец 57,756,013 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 D3 Начинать 127,063,534 бп[2] Конец 127,067,920 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы • киназная активность • активность протеин-серин / треонинкиназы • активность регулятора циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • связывание циклина • активность циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • холоферментный комплекс циклинзависимой протеинкиназы • не мембрана • мембрана • комплекс регуляторов транскрипции • двухклеточное плотное соединение • нуклеоплазма • ядрышко • перинуклеарная область цитоплазмы • хроматин • ядро клетки • комплекс циклин D2-CDK4 • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • фосфорилирование • ответ на тестостерон • положительное регулирование пролиферации фибробластов • ответ на гипероксию • положительное регулирование перевода • регулирование клеточного цикла • деление клеток • отрицательная регуляция остановки клеточного цикла • фосфорилирование белков • проявление линз в глазу камерного типа • регулирование пролиферации клеток • реакция на ион свинца • циркадный ритм • регенерация органов животных • положительное регулирование пролиферации клеток • положительное регулирование размера клеток • положительная регуляция апоптотического процесса • регуляция экспрессии генов • клеточный цикл • положительная регуляция перехода G2 / M митотического клеточного цикла • реакция на токсичное вещество • положительная регуляция клеточного цикла • преобразование сигнала • развитие многоклеточного организма • реакция на органическое вещество • клеточный ответ на стимул инсулина • регуляция роста многоклеточного организма • регуляция сигнального пути рецептора инсулина • регуляция процесса биосинтеза липидов • регуляция липидного катаболического процесса • развитие жировой ткани • клеточный ответ на липополисахарид • клеточный ответ на интерлейкин-4 • клеточный ответ на форбол 13-ацетат 12-миристат • клеточный ответ на иономицин • ответ на наркотик • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • G1 / S переход митотического клеточного цикла • регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • отрицательная регуляция перехода G1 / S митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1019	12567
Ансамбль	ENSG00000135446	ENSMUSG00000006728
UniProt	P11802	P30285
RefSeq (мРНК)	NM_052984 NM_000075	NM_009870 NM_001355005
RefSeq (белок)	NP_000066	NP_034000 NP_001341934
Расположение (UCSC)	Chr 12: 57.75 - 57.76 Мб	Chr 10: 127.06 - 127.07 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Циклинзависимая киназа 4 также известный как протеинкиназа 4 деления клеток является фермент что у людей кодируется CDK4 ген. CDK4 является членом циклин-зависимая киназа семья.

Функция

Белок, кодируемый этим геном, является членом Семейство протеинкиназ Ser / Thr. Этот белок очень похож на генные продукты С. cerevisiae cdc28 и С. Помбе cdc2. Это каталитическая субъединица комплекса протеинкиназ, важная для клеточный цикл Прогресс фазы G1. Активность этой киназы ограничена фазой G1-S, которая контролируется регуляторными субъединицами циклинов D-типа и ингибитором CDK. p16^INK4a. Было показано, что эта киназа ответственна за фосфорилирование ген ретинобластомы товар (Руб. ).^[5] Ser / Thr-киназный компонент комплексов циклин D-CDK4 (DC), который фосфорилирует и ингибирует члены семейство белков ретинобластомы (RB), включая RB1 и регулируют клеточный цикл во время перехода G1 / S. Фосфорилирование RB1 позволяет диссоциацию фактора транскрипции. E2F от комплексов RB / E2F и последующей транскрипции генов-мишеней E2F, которые ответственны за прохождение фазы G1. Гипофосфорилирует RB1 в ранней фазе G1. Комплексы циклин D-CDK4 являются основными интеграторами различных митогенных и антимитогенных сигналов. Также фосфорилирует SMAD3 зависимым от клеточного цикла образом и подавляет его транскрипционную активность. Компонент тройного комплекса, циклин D / CDK4 / CDKN1B, необходим для ядерной транслокации и активности комплекса циклин D-CDK4.^[6]

Клиническое значение

Было обнаружено, что мутации в этом гене, а также в связанных с ним белках, включая циклины D-типа, p16 (INK4a), CDKN2A и Rb, связаны с онкогенезом различных видов рака. Одна специфическая точечная мутация CDK4 (R24C) была впервые идентифицирована у пациентов с меланомой. Эта мутация была также представлена ​​на животных моделях, и ее роль как онкогена, вызывающего рак, была тщательно изучена. В настоящее время дерегулированный CDK4 считается потенциальной терапевтической мишенью при некоторых типах рака, и различные ингибиторы CDK4 проходят клинические испытания для лечения рака.^[7][8]

Сообщалось о множественных сайтах полиаденилирования этого гена.^[5]

Это регулируется Циклин D.

Ингибиторы

Рибоциклиб находятся США FDA одобренные ингибиторы CDK4 и CDK6 для лечения рецептор эстрогена положительный / HER2 отрицательный прогрессирующий рак груди.^[9]

Смотрите также Ингибитор CDK для ингибиторов различных CDK.

Взаимодействия

Было показано, что циклин-зависимая киназа 4 взаимодействовать с:

• CDC37,^{[10][11][12][13]}
• CDKN1B,^[14][15]
• CDKN2B,^[16][17]
• CDKN2C,^[10][18]
• CEBPA,^[19]
• CCND1,^{[14][15][20][21][22][23]}
• CCND3,^{[14][16][24][25]}
• DBNL,^[10]
• MyoD,^[26][27]
• P16,^{[10][20][21][23][28][29]}
• PCNA,^[21][30] и
• SERTAD1.^[20][29]

Обзор путей передачи сигналов, участвующих в апоптоз. (CDK4 в (розовом) ядре)

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135446 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000006728 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: циклинзависимая киназа 4 CDK4».
6. «CDK4 - циклинзависимая киназа 4 - Homo sapiens (человек) - ген и белок CDK4».
7. Шеппард, К. Э .; МакАртур, Г. А. (01.10.2013). «Регулятор клеточного цикла CDK4: новая терапевтическая мишень при меланоме». Клинические исследования рака. 19 (19): 5320–5328. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-13-0259. ISSN  1078-0432. PMID  24089445.
8. Собхани; Д'Анджело; Питтаколо; Ровьелло; Микколи; Корона; Бернокки; Generali; Отто (2019-04-06). «Обновленная информация о стратегии ингибирования CDK4 / 6 и комбинациях при раке груди». Клетки. 8 (4): 321. Дои:10.3390 / Cell8040321. ISSN  2073-4409. ЧВК  6523967. PMID  30959874.
9. «Утвержденные лекарственные препараты> Рибоциклиб (Кискали)». Получено 12 сентября 2017.
10. Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
11. Дай К., Кобаяши Р., Пляж D (1996). «Физическое взаимодействие CDC37 млекопитающих с CDK4». J. Biol. Chem. 271 (36): 22030–4. Дои:10.1074 / jbc.271.36.22030. PMID  8703009.
12. Лэмпфер Л., Фиоре Ф., Сюй Х, Бризуэла Л., Кизер С., Сардет С., Драетта Г. Ф., Гьюрис Дж. (1997). «Взаимодействие между Cdc37 и Cdk4 в клетках человека». Онкоген. 14 (16): 1999–2004. Дои:10.1038 / sj.onc.1201036. PMID  9150368.
13. Степанова Л., Ленг X, Паркер С.Б., Харпер Дж. В. (1996). «P50Cdc37 млекопитающих представляет собой нацеленную на протеинкиназу субъединицу Hsp90, которая связывает и стабилизирует Cdk4». Genes Dev. 10 (12): 1491–502. Дои:10.1101 / gad.10.12.1491. PMID  8666233.
14. Лин Дж, Джинно С., Окаяма Х (2001). «Комплекс Cdk6-циклин D3 ускользает от ингибирования белками-ингибиторами и однозначно контролирует способность клетки к пролиферации». Онкоген. 20 (16): 2000–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1204375. PMID  11360184.
15. Кариу С., Донован Дж. К., Фланаган В. М., Милич А., Бхаттачарья Н., Слингерленд Дж. М. (2000). «Понижающая регуляция p21WAF1 / CIP1 или p27Kip1 отменяет опосредованную антиэстрогенами остановку клеточного цикла в клетках рака груди человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (16): 9042–6. Bibcode:2000PNAS ... 97.9042C. Дои:10.1073 / pnas.160016897. ЧВК  16818. PMID  10908655.
16. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
17. Гавидел А., Кагни Г., Эмили А. (2005). «Скелет белкового интерактома человека». Клетка. 122 (6): 830–2. Дои:10.1016 / j.cell.2005.09.006. PMID  16179252. S2CID  7410135.
18. Гуан К.Л., Дженкинс К.В., Ли И, Николс М.А., Ву Х, О'Киф, С.Л., Матера А.Г., Сюн Й. (1994). «Подавление роста с помощью p18, ингибитора CDK6, связанного с p16INK4 / MTS1 и p14INK4B / MTS2, коррелирует с функцией pRb дикого типа». Genes Dev. 8 (24): 2939–52. Дои:10.1101 / gad.8.24.2939. PMID  8001816.
19. Ван Х, Якова П., Уайлд М., Велм А., Гуд Т., Роеслер В.Дж., Тимченко Н.А. (2001). «C / EBPalpha останавливает пролиферацию клеток за счет прямого ингибирования Cdk2 и Cdk4». Мол. Клетка. 8 (4): 817–28. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00366-5. PMID  11684017.
20. Сугимото М., Накамура Т., Отани Н., Хэмпсон Л., Хэмпсон И. Н., Шимамото А., Фуруичи Ю., Окумура К., Нива С., Тая Ю., Хара Е. (1999). «Регулирование активности CDK4 с помощью нового CDK4-связывающего белка, p34 (SEI-1)». Genes Dev. 13 (22): 3027–33. Дои:10.1101 / gad.13.22.3027. ЧВК  317153. PMID  10580009.
21. Нэсмит К., Хант Т. (1993). «Клеточный цикл. Плотины и шлюзы». Природа. 366 (6456): 634–5. Дои:10.1038 / 366634a0. PMID  8259207. S2CID  4270052.
22. Тауле М., Риус Э., Талая Д., Лопес-Жирона А., Бахс О., Агель Н. (1998). «Кальмодулин необходим для активности циклин-зависимой киназы 4 (Cdk4) и накопления в ядре циклина D1-Cdk4 во время G1». J. Biol. Chem. 273 (50): 33279–86. Дои:10.1074 / jbc.273.50.33279. PMID  9837900.
23. Коулман К.Г., Уотлет Б.С., Моррисси Д., Малхерон Дж., Седман С.А., Бринкли П., Прайс С., Вебстер К.Р. (1997). «Идентификация последовательностей CDK4, участвующих в связывании циклина D1 и p16». J. Biol. Chem. 272 (30): 18869–74. Дои:10.1074 / jbc.272.30.18869. PMID  9228064.
24. Арсеньевич Т., Дегреф С., Дюмон Дж. Э., Роджер П. П., Пирсон И. (2004). «Новый партнер циклинов D-типа: протеинкиназа A-якорь протеин AKAP95». Biochem. J. 378 (Pt 2): 673–9. Дои:10.1042 / BJ20031765. ЧВК  1223988. PMID  14641107.
25. Чжан Кью, Ван Х, Вольгемут DJ (1999). «Регулируемая в процессе развития экспрессия циклина D3 и его потенциальных in vivo взаимодействующих белков во время гаметогенеза у мышей». Эндокринология. 140 (6): 2790–800. Дои:10.1210 / эндо.140.6.6756. PMID  10342870.
26. Чжан Дж.М., Чжао X, Вэй К., Патерсон Б.М. (1999). «Прямое ингибирование активности киназы G (1) cdk с помощью MyoD способствует прерыванию клеточного цикла миобластов и терминальной дифференцировке». EMBO J. 18 (24): 6983–93. Дои:10.1093 / emboj / 18.24.6983. ЧВК  1171761. PMID  10601020.
27. Чжан JM, Вэй Q, Чжао X, Патерсон BM (1999). «Сцепление клеточного цикла и миогенеза через циклин D1-зависимое взаимодействие MyoD с cdk4». EMBO J. 18 (4): 926–33. Дои:10.1093 / emboj / 18.4.926. ЧВК  1171185. PMID  10022835.
28. Fåhraeus R, Paramio JM, Ball KL, Laín S, Lane DP (1996). «Ингибирование фосфорилирования pRb и прогрессии клеточного цикла пептидом из 20 остатков, полученным из p16CDKN2 / INK4A» (PDF). Curr. Биол. 6 (1): 84–91. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 00425-6. PMID  8805225. S2CID  23024663.
29. Ли Дж., Мелвин WS, Цай, доктор медицины, Muscarella P (2004). «Ядерный белок p34SEI-1 регулирует киназную активность циклин-зависимой киназы 4 в зависимости от концентрации». Биохимия. 43 (14): 4394–9. CiteSeerX  10.1.1.386.140. Дои:10.1021 / bi035601s. PMID  15065884.
30. Xiong Y, Zhang H, Beach D (1993). «Субъединичная перестройка циклин-зависимых киназ связана с клеточной трансформацией». Genes Dev. 7 (8): 1572–83. Дои:10.1101 / gad.7.8.1572. PMID  8101826.

дальнейшее чтение

• Хэнкс СК (1987). «Исследование гомологии: идентификация клонов кДНК, кодирующих членов семейства протеин-серинкиназ». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (2): 388–92. Bibcode:1987ПНАС ... 84..388Н. Дои:10.1073 / pnas.84.2.388. ЧВК  304212. PMID  2948189.
• Зал М; Бейтс С; Петерс Г (1995). «Доказательства различных способов действия ингибиторов циклин-зависимых киназ: p15 и p16 связываются с киназами, p21 и p27 связываются с циклинами». Онкоген. 11 (8): 1581–8. PMID  7478582.
• Тассан Дж. П., Жакен М., Леопольд П. и др. (1995). «Идентификация человеческой циклин-зависимой киназы 8, предполагаемого партнера протеинкиназы для циклина C». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (19): 8871–5. Bibcode:1995PNAS ... 92.8871T. Дои:10.1073 / пнас.92.19.8871. ЧВК  41069. PMID  7568034.
• Митчелл Э.Л., Уайт Г.Р., Сантибанез-Кореф М.Ф. и др. (1995). «Картирование локусов генов в области Q13-Q15 хромосомы 12». Хромосома Res. 3 (4): 261–2. Дои:10.1007 / BF00713052. PMID  7606365. S2CID  6029915.
• Вельфель Т., Хауэр М., Шнайдер Дж. И др. (1995). «Мутант CDK4, нечувствительный к p16INK4a, нацеленный на цитолитические Т-лимфоциты в меланоме человека». Наука. 269 (5228): 1281–4. Bibcode:1995Научный ... 269.1281W. Дои:10.1126 / science.7652577. PMID  7652577. S2CID  37848897.
• Хираи Х., Руссель М.Ф., Като Дж.Й. и др. (1995). «Новые белки INK4, p19 и p18, являются специфическими ингибиторами циклин D-зависимых киназ CDK4 и CDK6». Мол. Клетка. Биол. 15 (5): 2672–81. Дои:10.1128 / MCB.15.5.2672. ЧВК  230497. PMID  7739547.
• Чан Ф.К., Чжан Дж., Ченг Л. и др. (1995). «Идентификация человеческого и мышиного p19, нового ингибитора CDK4 и CDK6, гомологичного p16ink4». Мол. Клетка. Биол. 15 (5): 2682–8. Дои:10.1128 / MCB.15.5.2682. ЧВК  230498. PMID  7739548.
• Гуан К.Л., Дженкинс К.В., Ли Й. и др. (1995). «Подавление роста с помощью p18, ингибитора CDK6, связанного с p16INK4 / MTS1 и p14INK4B / MTS2, коррелирует с функцией pRb дикого типа». Genes Dev. 8 (24): 2939–52. Дои:10.1101 / gad.8.24.2939. PMID  8001816.
• Kato JY; Мацуока М; Strom DK; Шерр CJ (1994). «Регулирование циклин D-зависимой киназы 4 (cdk4) с помощью cdk4-активирующей киназы». Мол. Клетка. Биол. 14 (4): 2713–21. Дои:10.1128 / MCB.14.4.2713. ЧВК  358637. PMID  8139570.
• Хатиб З.А., Мацусиме Х., Валентин М. и др. (1993). «Коамплификация гена CDK4 с MDM2 и GLI в саркомах человека». Рак Res. 53 (22): 5535–41. PMID  8221695.
• Серрано М; Hannon GJ; Пляж D (1994). «Новый регуляторный мотив в контроле клеточного цикла, вызывающий специфическое ингибирование циклина D / CDK4». Природа. 366 (6456): 704–7. Bibcode:1993Натура.366..704С. Дои:10.1038 / 366704a0. PMID  8259215. S2CID  4368128.
• Деметрик DJ; Zhang H; Пляж DH (1994). «Хромосомное картирование генов киназ клеточного цикла человека CDK2, CDK4 и CDK5». Cytogenet. Cell Genet. 66 (1): 72–4. Дои:10.1159/000133669. PMID  8275715.
• Като Дж., Мацусимэ Х., Хиберт С.В. и др. (1993). «Прямое связывание циклина D с продуктом гена ретинобластомы (pRb) и фосфорилирование pRb циклин D-зависимой киназой CDK4». Genes Dev. 7 (3): 331–42. Дои:10.1101 / gad.7.3.331. PMID  8449399.
• Zuo L, Weger J, Yang Q, et al. (1996). «Мутации зародышевой линии в связывающем домене p16INK4a CDK4 при семейной меланоме». Nat. Genet. 12 (1): 97–9. Дои:10.1038 / ng0196-97. PMID  8528263. S2CID  29727436.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Knudsen ES; Ван Джи (1996). «Дифференциальная регуляция функции белков ретинобластомы с помощью специфических сайтов фосфорилирования Cdk». J. Biol. Chem. 271 (14): 8313–20. Дои:10.1074 / jbc.271.14.8313. PMID  8626527.
• Poon RY; Цзян В; Toyoshima H; Хантер Т. (1996). «Циклинзависимые киназы инактивируются комбинацией фосфорилирования p21 и Thr-14 / Tyr-15 после УФ-индуцированного повреждения ДНК». J. Biol. Chem. 271 (22): 13283–91. Дои:10.1074 / jbc.271.22.13283. PMID  8662825.
• Степанова Л; Ленг Х; Parker SB; Харпер Дж. В. (1996). «P50Cdc37 млекопитающих представляет собой нацеленную на протеинкиназу субъединицу Hsp90, которая связывает и стабилизирует Cdk4». Genes Dev. 10 (12): 1491–502. Дои:10.1101 / gad.10.12.1491. PMID  8666233.
• Дай К; Кобаяши Р; Пляж D (1996). «Физическое взаимодействие CDC37 млекопитающих с CDK4». J. Biol. Chem. 271 (36): 22030–4. Дои:10.1074 / jbc.271.36.22030. PMID  8703009.
• Fåhraeus R, Paramio JM, Ball KL и др. (1996). «Ингибирование фосфорилирования pRb и прогрессии клеточного цикла пептидом из 20 остатков, полученным из p16CDKN2 / INK4A» (PDF). Curr. Биол. 6 (1): 84–91. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 00425-6. PMID  8805225. S2CID  23024663.

внешняя ссылка

• Циклинзависимые + киназа + 4 в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• CDK4 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• CDK4 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.