CEBPA - CEBPA - Wikipedia

CEBPA
Идентификаторы
Псевдонимы	CEBPA, C / EBP-альфа, CEBP, CCAAT / связывающий белок-энхансер альфа, CCAAT-энхансер-связывающий белок альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 116897 MGI: 99480 ГомолоГен: 3211 Генные карты: CEBPA
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19q13.11 Начинать 33,299,934 бп[1] Конец 33,302,534 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 B2 | 7 21,02 см Начинать 35,119,293 бп[2] Конец 35,121,928 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • активность гомодимеризации белков • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции • связывание фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • связывание киназы • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • комплекс регуляторов транскрипции • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II • ядрышко • ядро клетки • нуклеоплазма • внутриклеточная мембраносвязанная органелла Биологический процесс • Notch сигнальный путь • транскрипция с промотора РНК-полимеразы I • миелоидная дифференцировка клеток • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на ион лития • гомеостаз глюкозы • отрицательная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • развитие легких • цитокин-опосредованный сигнальный путь • цикл мочевины • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на органическое циклическое соединение • митохондриальная организация • эмбриональное развитие плаценты • метаболический процесс холестерина • отрицательная регуляция клеточного цикла • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • созревание клеток • производство метаболитов-предшественников и энергии • транскрипция, ДНК-шаблон • дифференцировка макрофагов • развитие многоклеточного организма • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительная регуляция дифференцировки остеобластов • дифференцировка гранулоцитов • регулирование пролиферации клеток • дифференцировка коричневых жировых клеток • липидный гомеостаз • дифференцировка белых жировых клеток • развитие внутреннего уха • развитие печени • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • положительное регулирование дифференцировки жировых клеток • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы III • дифференцировка жировых клеток • положительная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательное регулирование пролиферации клеток • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • положительная регуляция ДНК-темплатной транскрипции, инициация • положительная регуляция активации макрофагов • положительная регуляция воспалительного ответа • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-6 Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1050	12606
Ансамбль	ENSG00000245848	ENSMUSG00000034957
UniProt	P49715	P53566
RefSeq (мРНК)	NM_004364 NM_001285829 NM_001287424 NM_001287435	NM_001287514 NM_001287515 NM_001287521 NM_001287523 NM_007678
RefSeq (белок)	NP_001272758 NP_001274353 NP_001274364 NP_004355	NP_001274443 NP_001274444 NP_001274450 NP_001274452 NP_031704
Расположение (UCSC)	Chr 19: 33,3 - 33,3 Мб	Chr 7: 35.12 - 35.12 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

CCAAT / энхансер-связывающий белок альфа это белок закодировано CEBPA ген в людях.^[5][6] CCAAT / связывающий энхансер белок альфа представляет собой фактор транскрипции участвует в дифференциации определенных кровяные клетки.^[7] Подробнее о CCAAT структурный мотив в генные энхансеры а о CCAAT / связывающих белках-энхансерах см. страница.

Функция

Белок, кодируемый этим без интрон ген это bZIP фактор транскрипции который может связываться как гомодимер с некоторыми промоутеры и генные энхансеры. Он также может образовывать гетеродимеры с родственными белками CEBP-beta и CEBP-gamma, а также с отдельными факторами транскрипции, такими как с-июн. Кодируемый белок является ключевым регулятором адипогенез (процесс образования новых жировых клеток) и накопление липидов в этих клетках, а также метаболизм глюкозы и липидов в печени.^[8] Было показано, что белок связывается с промотором и модулирует экспрессию гена, кодирующего лептин, белок, который играет важную роль в гомеостазе массы тела. Также кодируемый белок может взаимодействовать с CDK2 и CDK4, тем самым подавляя эти киназы и прекращение деления культивируемых клеток.^[9] Кроме того, CEBPA необходим для миелоидный обязательство по линии и поэтому требуется как для нормального зрелого гранулоцит формирование и развитие аномальных острый миелоидный лейкоз.^[10]

Общие мутации

Есть две основные категории, на которые можно разделить мутации CEBPA. Одна категория мутаций предотвращает связывание CCAAT / альфа-связывающего белка энхансера с ДНК путем изменения его COOH-концевого основного домена лейциновой молнии. Другая категория мутаций нарушает трансляцию CCAAT / энхансер-связывающего белка альфа NH.₂ конечная остановка. Мутации CEBPA, которые приводят к снижению альфа-активности CCAAT / энхансер-связывающего белка, вносят вклад в трансформацию миелоидных предшественников.^[11]

Взаимодействия

CEBPA было показано взаимодействовать с Циклинзависимая киназа 2^[12] и Циклинзависимая киназа 4.^[12]

Клиническое значение

Было показано, что мутация CEBPA связана с хорошими результатами как у взрослых, так и у детей. острый миелоидный лейкоз пациенты.^[13]

Значение при остром миелоидном лейкозе

Острый миелоидный лейкоз характеризуется генетическими аномалиями в кроветворных предшественниках. Это включает чрезмерное распространение взрывов и блокирование кроветворение из гранулоциты. Было показано, что подавление экспрессии CEBPA и блокирование CCAAT / связывающего энхансер белка альфа останавливает дифференцировку миелоидных предшественников. По этой причине роль CCAAT / связывающего энхансер белка альфа во время дифференцировки гранулоцитов и роль CEBPA как подавитель опухолей ген критически важен в прогнозе острого миелоидного лейкоза.^[14]

Прогностическое значение мутации CEBPA

CCAAT / энхансер-связывающий белок альфа, фактор транскрипции который кодируется CEBPA, очень важен для дифференциации незрелых гранулоцитов. Было показано, что мутация гена CEBPA играет решающую роль в лейкемогенезе и прогнозе у пациентов с острым миелоидным лейкозом. В недавних исследованиях мутации CEBPA были обнаружены у 7–15% пациентов с острым миелоидным лейкозом. Три различных типа мутаций, наблюдаемых у этих пациентов с ОМЛ, включают мутации N-конца зародышевой линии, N-концевые мутации. мутация сдвига рамки, и С-концевую мутацию. Эти мутации наиболее часто встречаются при остром миелоидном лейкозе M1 или остром миелоидном лейкозе M2. Многие сообщения связывают мутации CEBPA с благоприятным исходом при остром миелоидном лейкозе. Это связано с тем, что эти мутации могут вызывать дифференциация арест у этих пациентов. Пациенты с мутациями CEBPA имеют более длительную ремиссию и время выживания, чем пациенты без мутаций.^[11] Следовательно, наличие мутации CEBPA напрямую связано с более благоприятным течением для прогрессирования заболевания.^[15]

Значение в солидных опухолях

Недавно было показано, что эпигенетическая модификация дистальной промоторной области CEBPA приводит к подавление экспрессии CEBPA в клетках рака поджелудочной железы, рака легких, головы и шеи плоскоклеточная карцинома.^[16][17]

Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с ОМЛ

Недавнее исследование показало, что более высокие уровни CEBPA метилирование прямо пропорциональны реакции на лечение. Частота полного ответа увеличивалась пропорционально уровню метилирования CEBPA. По этой причине было высказано предположение, что метилирование CEBPA может быть очень полезным биомаркер при остром миелоидном лейкозе прогноз.^[18]

Смотрите также

• Ccaat-энхансер-связывающие белки

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000245848 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034957 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шпирер К., Ривьер М., Кортезе Р., Накамура Т., Ислам MQ, Леван Г., Шпирер Дж. (Июль 1992 г.). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C / EBP, DBP и HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1, соответственно) и фактор роста гепатоцитов / ген фактора рассеяния (HGF) ». Геномика. 13 (2): 293–300. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-Н. PMID  1535333.
6. Цао З., Умек Р.М., Макнайт С.Л. (октябрь 1991 г.). «Регулируемая экспрессия трех изоформ C / EBP во время преобразования жировой ткани клеток 3T3-L1». Genes Dev. 5 (9): 1538–52. Дои:10.1101 / gad.5.9.1538. PMID  1840554.
7. «CEBPA». Домашний справочник по генетике. 20 апреля 2016 г.. Получено 25 апреля, 2016.
8. Олофссон Л. Е., Орхо-Меландер М., Уильям-Олссон Л., Сьохольм К., Сьёстрём Л., Груп Л., Карлссон Б., Карлссон Л. М., Олссон Б. (1 декабря 2009 г.). «CCAAT / связывающий энхансер белок альфа (C / EBPalpha) в жировой ткани регулирует гены метаболизма липидов и глюкозы, а генетическая вариация C / EBPalpha связана с уровнями триглицеридов в сыворотке». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма. 93 (12): 4880–4886. Дои:10.1210 / jc.2008-0574. PMID  18765514.
9. «Ген Entrez: CEBPA CCAAT / энхансер связывающий белок (C / EBP), альфа».
10. Олссон Э., Шустер МБ, Хасеманн М., Порсе Б.Т. (апрель 2016 г.). «Многогранные функции C / EBPalpha при нормальном и злокачественном кроветворении». Лейкемия. 30 (4): 767–75. Дои:10.1038 / leu.2015.324. PMID  26601784. S2CID  24767947.
11. Lin LI, Chen CY, Lin DT, Tsay W., Tang JL, Yeh YC и др. (2005). ""Характеристика мутаций CEBPA при остром миелоидном лейкозе «большинство пациентов с мутациями CEBPA имеют двуаллельные мутации и демонстрируют отчетливый иммунофенотип лейкозных клеток». Clin Cancer Res. 11 (4): 1372–9. Дои:10.1158 / 1078-0432.ccr-04-1816. PMID  15746035.
12. Ван Х., Якова П., Уайлд М., Велм А., Гуд Т., Роеслер В.Дж., Тимченко Н.А. (октябрь 2001 г.). «C / EBPalpha останавливает пролиферацию клеток за счет прямого ингибирования Cdk2 и Cdk4». Мол. Клетка. 8 (4): 817–28. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00366-5. PMID  11684017.
13. Хо ПА, Алонсо Т.А., Гербинг Р.Б., Поллард Дж., Стируолт Д.Л., Гурвиц С., Херема Н.А., Хирш Б., Раймонди С.К., Ланге Б., Франклин Дж. Л., Радич Дж. П., Мешинчи С. (июнь 2009 г.). «Распространенность и прогностические последствия мутации CEBPA при остром миелоидном лейкозе у детей: отчет Детской онкологической группы». Кровь. 113 (26): 6558–66. Дои:10.1182 / blood-2008-10-184747. ЧВК  2943755. PMID  19304957.
14. Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с de novo острый миелоидный лейкоз". Лейкемия. 25 (1): 32–40. Дои:10.1038 / leu.2010.222. PMID  20927134.
15. Эль-Шарнуби Дж. А., Ахмед Л. М., Таха А. М., Камаль О. Прогностическое значение мутаций CEBPA и экспрессии BAALC у египетских пациентов с острым миелоидным лейкозом с нормальным кариотипом. Egypt J Immunol. 2010. 15: 131–143.
16. Тада Y, Брена Р.М., Хакансон Б., Моррисон С., Оттерсон Г.А., Пласс С. (2006). «Эпигенетическая модуляция альфа-активности опухолевого супрессора CCAAT / энхансера связывающего белка при раке легких». J Natl Cancer Inst. 98 (6): 396–406. Дои:10.1093 / jnci / djj093. PMID  16537832.
17. Беннетт К.Л., Хакансон Б., Смит Л.Т., Моррисон С.Д., Ланг Дж.С., Шуллер Д.Э. и др. (2007). «Опухолевая супрессорная активность CCAAT / связывающего белка энхансера альфа эпигенетически подавляется при плоскоклеточной карциноме головы и шеи». Рак Res. 67 (10): 4657–4664. Дои:10.1158 / 0008-5472.can-06-4793. PMID  17510391.
18. Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с острым миелоидным лейкозом de novo». Лейкемия. 25: 32–40. Дои:10.1038 / leu.2010.222. PMID  20927134.

дальнейшее чтение

• Sladek FM, Дарнелл Дж. Э. (1992). «Механизмы экспрессии генов, специфичных для печени». Curr. Мнение. Genet. Dev. 2 (2): 256–9. Дои:10.1016 / S0959-437X (05) 80282-5. PMID  1638120.
• Маркучи Дж., Мрозек К., Bloomfield CD (2005). «Молекулярная гетерогенность и прогностические биомаркеры у взрослых с острым миелоидным лейкозом и нормальной цитогенетикой». Curr. Мнение. Гематол. 12 (1): 68–75. Дои:10.1097 / 01.moh.0000149608.29685.d1. PMID  15604894. S2CID  6183391.
• Леруа Х., Румье С., Хюйге П., Биггио В., Фено П., Преудомма С. (март 2005 г.). «Точечные мутации CEBPA при гематологических злокачественных новообразованиях». Лейкемия. 19 (3): 329–34. Дои:10.1038 / sj.leu.2403614. PMID  15674366.

внешняя ссылка

• Человек CEBPA расположение генома и CEBPA страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
• GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о семейном остром миелоидном лейкозе (AML) с мутированным CEBPA
• CEBPA + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.