CEBPA - CEBPA - Wikipedia

CEBPA
1nwq.png
Идентификаторы
ПсевдонимыCEBPA, C / EBP-альфа, CEBP, CCAAT / связывающий белок-энхансер альфа, CCAAT-энхансер-связывающий белок альфа
Внешние идентификаторыOMIM: 116897 MGI: 99480 ГомолоГен: 3211 Генные карты: CEBPA
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение CEBPA
Геномное расположение CEBPA
Группа19q13.11Начинать33,299,934 бп[1]
Конец33,302,534 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004364
NM_001285829
NM_001287424
NM_001287435

NM_001287514
NM_001287515
NM_001287521
NM_001287523
NM_007678

RefSeq (белок)

NP_001272758
NP_001274353
NP_001274364
NP_004355

NP_001274443
NP_001274444
NP_001274450
NP_001274452
NP_031704

Расположение (UCSC)Chr 19: 33,3 - 33,3 МбChr 7: 35.12 - 35.12 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

CCAAT / энхансер-связывающий белок альфа это белок закодировано CEBPA ген в людях.[5][6] CCAAT / связывающий энхансер белок альфа представляет собой фактор транскрипции участвует в дифференциации определенных кровяные клетки.[7] Подробнее о CCAAT структурный мотив в генные энхансеры а о CCAAT / связывающих белках-энхансерах см. страница.

Функция

Белок, кодируемый этим без интрон ген это bZIP фактор транскрипции который может связываться как гомодимер с некоторыми промоутеры и генные энхансеры. Он также может образовывать гетеродимеры с родственными белками CEBP-beta и CEBP-gamma, а также с отдельными факторами транскрипции, такими как с-июн. Кодируемый белок является ключевым регулятором адипогенез (процесс образования новых жировых клеток) и накопление липидов в этих клетках, а также метаболизм глюкозы и липидов в печени.[8] Было показано, что белок связывается с промотором и модулирует экспрессию гена, кодирующего лептин, белок, который играет важную роль в гомеостазе массы тела. Также кодируемый белок может взаимодействовать с CDK2 и CDK4, тем самым подавляя эти киназы и прекращение деления культивируемых клеток.[9] Кроме того, CEBPA необходим для миелоидный обязательство по линии и поэтому требуется как для нормального зрелого гранулоцит формирование и развитие аномальных острый миелоидный лейкоз.[10]

Общие мутации

Есть две основные категории, на которые можно разделить мутации CEBPA. Одна категория мутаций предотвращает связывание CCAAT / альфа-связывающего белка энхансера с ДНК путем изменения его COOH-концевого основного домена лейциновой молнии. Другая категория мутаций нарушает трансляцию CCAAT / энхансер-связывающего белка альфа NH.2 конечная остановка. Мутации CEBPA, которые приводят к снижению альфа-активности CCAAT / энхансер-связывающего белка, вносят вклад в трансформацию миелоидных предшественников.[11]

Взаимодействия

CEBPA было показано взаимодействовать с Циклинзависимая киназа 2[12] и Циклинзависимая киназа 4.[12]

Клиническое значение

Было показано, что мутация CEBPA связана с хорошими результатами как у взрослых, так и у детей. острый миелоидный лейкоз пациенты.[13]

Значение при остром миелоидном лейкозе

Острый миелоидный лейкоз характеризуется генетическими аномалиями в кроветворных предшественниках. Это включает чрезмерное распространение взрывов и блокирование кроветворение из гранулоциты. Было показано, что подавление экспрессии CEBPA и блокирование CCAAT / связывающего энхансер белка альфа останавливает дифференцировку миелоидных предшественников. По этой причине роль CCAAT / связывающего энхансер белка альфа во время дифференцировки гранулоцитов и роль CEBPA как подавитель опухолей ген критически важен в прогнозе острого миелоидного лейкоза.[14]

Прогностическое значение мутации CEBPA

CCAAT / энхансер-связывающий белок альфа, фактор транскрипции который кодируется CEBPA, очень важен для дифференциации незрелых гранулоцитов. Было показано, что мутация гена CEBPA играет решающую роль в лейкемогенезе и прогнозе у пациентов с острым миелоидным лейкозом. В недавних исследованиях мутации CEBPA были обнаружены у 7–15% пациентов с острым миелоидным лейкозом. Три различных типа мутаций, наблюдаемых у этих пациентов с ОМЛ, включают мутации N-конца зародышевой линии, N-концевые мутации. мутация сдвига рамки, и С-концевую мутацию. Эти мутации наиболее часто встречаются при остром миелоидном лейкозе M1 или остром миелоидном лейкозе M2. Многие сообщения связывают мутации CEBPA с благоприятным исходом при остром миелоидном лейкозе. Это связано с тем, что эти мутации могут вызывать дифференциация арест у этих пациентов. Пациенты с мутациями CEBPA имеют более длительную ремиссию и время выживания, чем пациенты без мутаций.[11] Следовательно, наличие мутации CEBPA напрямую связано с более благоприятным течением для прогрессирования заболевания.[15]

Значение в солидных опухолях

Недавно было показано, что эпигенетическая модификация дистальной промоторной области CEBPA приводит к подавление экспрессии CEBPA в клетках рака поджелудочной железы, рака легких, головы и шеи плоскоклеточная карцинома.[16][17]

Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с ОМЛ

Недавнее исследование показало, что более высокие уровни CEBPA метилирование прямо пропорциональны реакции на лечение. Частота полного ответа увеличивалась пропорционально уровню метилирования CEBPA. По этой причине было высказано предположение, что метилирование CEBPA может быть очень полезным биомаркер при остром миелоидном лейкозе прогноз.[18]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000245848 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034957 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Шпирер К., Ривьер М., Кортезе Р., Накамура Т., Ислам MQ, Леван Г., Шпирер Дж. (Июль 1992 г.). «Хромосомная локализация у человека и крысы генов, кодирующих обогащенные печенью факторы транскрипции C / EBP, DBP и HNF1 / LFB-1 (CEBP, DBP и фактор транскрипции 1, TCF1, соответственно) и фактор роста гепатоцитов / ген фактора рассеяния (HGF) ». Геномика. 13 (2): 293–300. Дои:10.1016 / 0888-7543 (92) 90245-Н. PMID  1535333.
  6. ^ Цао З., Умек Р.М., Макнайт С.Л. (октябрь 1991 г.). «Регулируемая экспрессия трех изоформ C / EBP во время преобразования жировой ткани клеток 3T3-L1». Genes Dev. 5 (9): 1538–52. Дои:10.1101 / gad.5.9.1538. PMID  1840554.
  7. ^ «CEBPA». Домашний справочник по генетике. 20 апреля 2016 г.. Получено 25 апреля, 2016.
  8. ^ Олофссон Л. Е., Орхо-Меландер М., Уильям-Олссон Л., Сьохольм К., Сьёстрём Л., Груп Л., Карлссон Б., Карлссон Л. М., Олссон Б. (1 декабря 2009 г.). «CCAAT / связывающий энхансер белок альфа (C / EBPalpha) в жировой ткани регулирует гены метаболизма липидов и глюкозы, а генетическая вариация C / EBPalpha связана с уровнями триглицеридов в сыворотке». Журнал клинической эндокринологии и метаболизма. 93 (12): 4880–4886. Дои:10.1210 / jc.2008-0574. PMID  18765514.
  9. ^ «Ген Entrez: CEBPA CCAAT / энхансер связывающий белок (C / EBP), альфа».
  10. ^ Олссон Э., Шустер МБ, Хасеманн М., Порсе Б.Т. (апрель 2016 г.). «Многогранные функции C / EBPalpha при нормальном и злокачественном кроветворении». Лейкемия. 30 (4): 767–75. Дои:10.1038 / leu.2015.324. PMID  26601784. S2CID  24767947.
  11. ^ а б Lin LI, Chen CY, Lin DT, Tsay W., Tang JL, Yeh YC и др. (2005). ""Характеристика мутаций CEBPA при остром миелоидном лейкозе «большинство пациентов с мутациями CEBPA имеют двуаллельные мутации и демонстрируют отчетливый иммунофенотип лейкозных клеток». Clin Cancer Res. 11 (4): 1372–9. Дои:10.1158 / 1078-0432.ccr-04-1816. PMID  15746035.
  12. ^ а б Ван Х., Якова П., Уайлд М., Велм А., Гуд Т., Роеслер В.Дж., Тимченко Н.А. (октябрь 2001 г.). «C / EBPalpha останавливает пролиферацию клеток за счет прямого ингибирования Cdk2 и Cdk4». Мол. Клетка. 8 (4): 817–28. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00366-5. PMID  11684017.
  13. ^ Хо ПА, Алонсо Т.А., Гербинг Р.Б., Поллард Дж., Стируолт Д.Л., Гурвиц С., Херема Н.А., Хирш Б., Раймонди С.К., Ланге Б., Франклин Дж. Л., Радич Дж. П., Мешинчи С. (июнь 2009 г.). «Распространенность и прогностические последствия мутации CEBPA при остром миелоидном лейкозе у детей: отчет Детской онкологической группы». Кровь. 113 (26): 6558–66. Дои:10.1182 / blood-2008-10-184747. ЧВК  2943755. PMID  19304957.
  14. ^ Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с de novo острый миелоидный лейкоз". Лейкемия. 25 (1): 32–40. Дои:10.1038 / leu.2010.222. PMID  20927134.
  15. ^ Эль-Шарнуби Дж. А., Ахмед Л. М., Таха А. М., Камаль О. Прогностическое значение мутаций CEBPA и экспрессии BAALC у египетских пациентов с острым миелоидным лейкозом с нормальным кариотипом. Egypt J Immunol. 2010. 15: 131–143.
  16. ^ Тада Y, Брена Р.М., Хакансон Б., Моррисон С., Оттерсон Г.А., Пласс С. (2006). «Эпигенетическая модуляция альфа-активности опухолевого супрессора CCAAT / энхансера связывающего белка при раке легких». J Natl Cancer Inst. 98 (6): 396–406. Дои:10.1093 / jnci / djj093. PMID  16537832.
  17. ^ Беннетт К.Л., Хакансон Б., Смит Л.Т., Моррисон С.Д., Ланг Дж.С., Шуллер Д.Э. и др. (2007). «Опухолевая супрессорная активность CCAAT / связывающего белка энхансера альфа эпигенетически подавляется при плоскоклеточной карциноме головы и шеи». Рак Res. 67 (10): 4657–4664. Дои:10.1158 / 0008-5472.can-06-4793. PMID  17510391.
  18. ^ Lin TC, Hou HA, Chou WC, Ou DL, Yu SL, Tien HF и др. (2011). «Метилирование CEBPA как прогностический биомаркер у пациентов с острым миелоидным лейкозом de novo». Лейкемия. 25: 32–40. Дои:10.1038 / leu.2010.222. PMID  20927134.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.