GTF2E2 - GTF2E2

GTF2E2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1D8J, 1D8K, 5IY9, 5IYA, 5IYC, 5IYB, 5IY7, 5IY8, 5IYD, 5IY6
Идентификаторы
Псевдонимы	GTF2E2, FE, TF2E2, TFIIE-B, TTD6, субъединица 2 общего фактора транскрипции IIE
Внешние идентификаторы	OMIM: 189964 MGI: 1915403 ГомолоГен: 37573 Генные карты: GTF2E2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8p12 Начинать 30,578,318 бп[1] Конец 30,658,236 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 A3-A4 Начинать 33,731,833 бп[2] Конец 33,777,173 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • Связывание фактора транскрипции класса TFIIH • GO: 0000983 Активность общего фактора инициации транскрипции РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • комплекс фактора транскрипции TFIIE • нуклеоплазма • комплекс фактора транскрипции TFIID • цитозоль • ядерное пятнышко Биологический процесс • элонгация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • транскрипция мяРНК с промотора РНК-полимеразы II Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	2961	68153
Ансамбль	ENSG00000197265	ENSMUSG00000031585
UniProt	P29084	Q9D902
RefSeq (мРНК)	NM_002095 NM_001348353	NM_001167921 NM_001167922 NM_026584
RefSeq (белок)	NP_002086 NP_001335282	NP_001161393 NP_001161394 NP_080860
Расположение (UCSC)	Chr 8: 30,58 - 30,66 Мб	Chr 8: 33,73 - 33,78 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица 2 общего транскрипционного фактора IIE (GTF2E2), также известный как субъединица бета IIE фактора инициации транскрипции (TFIIE-beta), является белок что у людей кодируется GTF2E2 ген.^[5]

Смотрите также

• Фактор транскрипции II E

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000197265 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031585 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Энтреза: общий фактор транскрипции IIE».

дальнейшее чтение

• Jeronimo C, Forget D, Bouchard A, Li Q, Chua G, Poitras C, Thérien C, Bergeron D, Bourassa S, Greenblatt J, Chabot B, Poirier GG, Hughes TR, Blanchette M, Price DH, Coulombe B (июль 2007 г. ). «Систематический анализ сети взаимодействия белков для человеческого аппарата транскрипции раскрывает идентичность кэпирующего фермента 7SK». Молекулярная клетка. 27 (2): 262–74. Дои:10.1016 / j.molcel.2007.06.027. ЧВК  4498903. PMID  17643375.
• Танака А., Ватанабэ Т., Иида Ю., Ханаока Ф., Окума Ю. (март 2009 г.). «Центральный вилкообразный домен человеческого TFIIE бета играет главную роль в связывании двухцепочечной ДНК при инициации транскрипции». Гены в клетки. 14 (3): 395–405. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2008.01278.x. PMID  19210545. S2CID  36600862.
• Кан С.В., Кузухара Т., Хорикоши М. (апрель 2000 г.). «Функциональное взаимодействие общего фактора инициации транскрипции TFIIE с общим фактором хроматина SPT16 / CDC68». Гены в клетки. 5 (4): 251–63. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2000.00323.x. PMID  10792464. S2CID  33454256.
• Langelier MF, Forget D, Rojas A, Porlier Y, Burton ZF, Coulombe B (октябрь 2001 г.). «Структурные и функциональные взаимодействия фактора транскрипции (TF) IIA с TFIIE и TFIIF в инициации транскрипции с помощью РНК-полимеразы II». Журнал биологической химии. 276 (42): 38652–7. Дои:10.1074 / jbc.M106422200. ЧВК  4492724. PMID  11509574.
• Ямамото С., Ватанабе И, ван дер Спек П.Дж., Ватанабе Т., Фудзимото Х., Ханаока Ф., Окума Й. (январь 2001 г.). «Исследования функции нематод TFIIE показывают связь между фосфорилированием Ser-5 РНК-полимеразы II и переходом от инициации транскрипции к элонгации». Молекулярная и клеточная биология. 21 (1): 1–15. Дои:10.1128 / MCB.21.1.1-15.2001. ЧВК  86563. PMID  11113176.
• Ватанабэ Т., Хаяси К., Танака А., Фурумото Т., Ханаока Ф., Окума Ю. (апрель 2003 г.). «Карбокси-конец малой субъединицы TFIIE регулирует переход от инициации транскрипции к удлинению с помощью РНК-полимеразы II». Молекулярная и клеточная биология. 23 (8): 2914–26. Дои:10.1128 / mcb.23.8.2914-2926.2003. ЧВК  152561. PMID  12665589.
• Джавхари А., Уринг М., Де Карло С., Распятие С., Токкини-Валентини Г., Морас Д., Шульц П., Потерсман А. (май 2006 г.). «Структура и олигомерное состояние человеческого фактора транскрипции TFIIE». Отчеты EMBO. 7 (5): 500–5. Дои:10.1038 / sj.embor.7400663. ЧВК  1479554. PMID  16547462.
• Орфаниды Г., Лагранж Т., Рейнберг Д. (ноябрь 1996 г.). «Общие факторы транскрипции РНК-полимеразы II». Гены и развитие. 10 (21): 2657–83. Дои:10.1101 / gad.10.21.2657. PMID  8946909.
• Ким Т.К., Эбрайт Р.Х., Рейнберг Д. (май 2000 г.). «Механизм плавления АТФ-зависимого промотора под действием фактора транскрипции IIH». Наука. 288 (5470): 1418–22. Дои:10.1126 / science.288.5470.1418. PMID  10827951.
• Ikeda K, Halle JP, Stelzer G, Meisterernst M, Kawakami K (январь 1998 г.). «Участие отрицательного кофактора NC2 в активной репрессии фактором транскрипции гомеодомена цинкового пальца AREB6». Молекулярная и клеточная биология. 18 (1): 10–8. Дои:10.1128 / mcb.18.1.10. ЧВК  121442. PMID  9418848.
• Holstege FC, Fiedler U, Timmers HT (декабрь 1997 г.). «Три перехода в транскрипционном комплексе РНК-полимеразы II во время инициации». Журнал EMBO. 16 (24): 7468–80. Дои:10.1093 / emboj / 16.24.7468. ЧВК  1170346. PMID  9405375.
• Cirulli ET, Kasperaviciūte D, Attix DK, Need AC, Ge D, Gibson G, Goldstein DB (июль 2010 г.). «Общие генетические вариации и результаты стандартизированных когнитивных тестов». Европейский журнал генетики человека. 18 (7): 815–20. Дои:10.1038 / ejhg.2010.2. ЧВК  2987367. PMID  20125193.
• Ю X, Ли П, Рёдер Р., Ван З. (июль 2001 г.). «Ингибирование транскрипции, опосредованной рецептором андрогена, с помощью аминоконцевого усилителя расщепления». Молекулярная и клеточная биология. 21 (14): 4614–25. Дои:10.1128 / MCB.21.14.4614-4625.2001. ЧВК  87125. PMID  11416139.
• Yokomori K, Verrijzer CP, Tjian R (июнь 1998 г.). «Взаимодействие между связывающим блоком ТАТА белком и факторами транскрипции IIE и IIA модулирует связывание ДНК и транскрипцию». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (12): 6722–7. Дои:10.1073 / пнас.95.12.6722. ЧВК  22611. PMID  9618479.
• Лю Л., Исихара К., Ичимура Т., Фудзита Н., Хино С., Томита С., Ватанабе С., Сайто Н., Ито Т., Накао М. (февраль 2009 г.). «MCAF1 / AM участвует в Sp1-опосредованном поддержании связанной с раком активности теломеразы». Журнал биологической химии. 284 (8): 5165–74. Дои:10.1074 / jbc.M807098200. PMID  19106100.
• De Graeve F, Bahr A, Chatton B, Kedinger C (март 2000 г.). «Мышиный ATFa-ассоциированный фактор с активностью репрессии транскрипции». Онкоген. 19 (14): 1807–19. Дои:10.1038 / sj.onc.1203492. PMID  10777215.
• Окамото Т., Ямамото С., Ватанабэ Ю., Охта Т., Ханаока Ф., Рёдер Р.Г., Окума Ю. (июль 1998 г.). «Анализ роли TFIIE в регуляции транскрипции посредством структурно-функциональных исследований субъединицы TFIIEbeta». Журнал биологической химии. 273 (31): 19866–76. Дои:10.1074 / jbc.273.31.19866. PMID  9677423.
• Festen EA, Stokkers PC, van Diemen CC, van Bodegraven AA, Boezen HM, Crusius BJ, Hommes DW, van der Woude CJ, van der Woude JC, Balschun T, Verspaget HW, Schreiber S, de Jong DJ, Franke A, Dijkstra Г., Вейменга С., Веерсма РК (февраль 2010 г.). «Генетический анализ образца голландского исследования позволяет выявить больше локусов восприимчивости к язвенному колиту и показать их аддитивную роль в риске заболевания». Американский журнал гастроэнтерологии. 105 (2): 395–402. Дои:10.1038 / ajg.2009.576. PMID  19861958. S2CID  10250290.