HOXC10 - HOXC10

HOXC10
Идентификаторы
Псевдонимы	HOXC10, HOX3I, гомеобокс C10
Внешние идентификаторы	OMIM: 605560 MGI: 96192 ГомолоГен: 9680 Генные карты: HOXC10
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.13 Начинать 53,985,065 бп[1] Конец 53,990,279 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 F3 | 15 58,03 см Начинать 102,966,796 бп[2] Конец 102,971,893 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • последовательное связывание ДНК • Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • холоферментный комплекс киназы, активирующий циклин-зависимую протеинкиназу • ядро клетки • ядерное тело • нуклеоплазма Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • развитие скелетной системы • формирование проксимального / дистального рисунка • нервно-мышечный процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • эмбриональный морфогенез конечностей • транскрипция, ДНК-шаблон • положительное регулирование пролиферации клеток • спецификация переднего / заднего рисунка • Спецификация судьбы клеток моторных нейронов спинного мозга • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3226	209448
Ансамбль	ENSG00000180818	ENSMUSG00000022484
UniProt	Q9NYD6	P31257
RefSeq (мРНК)	NM_017409	NM_010462
RefSeq (белок)	NP_059105	NP_034592
Расположение (UCSC)	Chr 12: 53,99 - 53,99 Мб	Chr 15: 102.97 - 102.97 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомеобокс протеин Hox-C10 это белок что у людей кодируется HOXC10 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген принадлежит к гомеобокс семейство генов. Гены гомеобокса кодируют высококонсервативное семейство факторы транскрипции которые играют важную роль в морфогенезе всех многоклеточных организмов. Млекопитающие обладают четырьмя похожими кластерами генов гомеобокса, HOXA, HOXB, HOXC и HOXD, которые расположены на разных хромосомах и состоят из 9-11 генов, расположенных тандемно. Этот ген является одним из нескольких генов HOXC гомеобокса, расположенных в кластере на хромосоме 12. Уровень белка контролируется во время дифференцировки и пролиферации клеток, что может указывать на то, что этот белок играет роль в активации источника.^[6]

Патология

• HOXC10 - это чрезмерно выраженный в рак молочной железы и транскрипционно регулируется эстроген через участие гистоновые метилазы MLL3 и MLL4.^[7]
• Метилирование репрессированного эстрогеном гена HOXC10 при раке груди определяет устойчивость к ингибиторы ароматазы. Этот эпигенетическое перепрограммирование HOXC10 наблюдается в эндокринно-резистентный рак груди.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000180818 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022484 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Скотт MP (ноябрь 1992 г.). «Номенклатура генов гомеобокса позвоночных». Клетка. 71 (4): 551–3. Дои:10.1016/0092-8674(92)90588-4. PMID  1358459. S2CID  13370372.
6. "Entrez Gene: HOXC10 гомеобокс C10".
7. Ансари К.И., Хуссейн И., Касири С., Мандал СС (февраль 2012 г.). «HOXC10 сверхэкспрессируется при раке груди и транскрипционно регулируется эстрогеном через участие гистоновых метилаз MLL3 и MLL4». Журнал молекулярной эндокринологии. 48 (1): 61–75. Дои:10.1530 / JME-11-0078. PMID  22143955.
8. Патираджа Т.Н., Наяк С.Р., Си И., Цзян С., Гари Дж. П., Эдвардс Д. П., Ли А. В., Чен Дж., Ши М. Дж., Сантен Р. Дж., Ганнон Ф., Кангаспеска С., Джелинек Дж., Исса Дж. П., Ричер Дж. , Янг Л.С., Дэвидсон Н.Э., Шифф Р., Ли В., Эстеррайх С. (март 2014 г.). «Эпигенетическое репрограммирование HOXC10 при эндокринно-резистентном раке груди». Научная трансляционная медицина. 6 (229): 229ra41. Дои:10.1126 / scitranslmed.3008326. ЧВК  4277862. PMID  24670685.

дальнейшее чтение

• Acampora D, D'Esposito M, Faiella A, Pannese M, Migliaccio E, Morelli F, Stornaiuolo A, Nigro V, Simeone A, Boncinelli E (декабрь 1989 г.). «Семейство генов HOX человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (24): 10385–402. Дои:10.1093 / nar / 17.24.10385. ЧВК  335308. PMID  2574852.
• Рабин М., Фергюсон-Смит А., Харт С. П., Раддл Ф. Х. (декабрь 1986 г.). «Познайте локусы гомео-бокса, картированные на гомологичных хромосомах человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 83 (23): 9104–8. Дои:10.1073 / пнас.83.23.9104. ЧВК  387083. PMID  2878432.
• Апиу Ф, Флагиелло Д., Силло С., Малфой Б., Поупон М. Ф., Датрилло Б. (1996). «Тонкое картирование кластеров генов HOX человека». Цитогенетика и клеточная генетика. 73 (1–2): 114–5. Дои:10.1159/000134320. PMID  8646877.
• Flagiello D, Gibaud A, Dutrillaux B, Poupon MF, Malfoy B (октябрь 1997 г.). «Отличительные паттерны полностью транс-ретиноевой кислоты зависимой экспрессии гомеогенов HOXB и HOXC в клеточных линиях эмбриональной и мелкоклеточной карциномы легких человека». Письма FEBS. 415 (3): 263–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 01118-6. PMID  9357979. S2CID  26075369.
• de Stanchina E, Gabellini D, Norio P, Giacca M, Peverali FA, Riva S, Falaschi A, Biamonti G (июнь 2000 г.). «Выбор гомеотических белков для связывания с источником репликации ДНК человека». Журнал молекулярной биологии. 299 (3): 667–80. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3782. PMID  10835276.
• Sandrock B, Egly JM (сентябрь 2001 г.). «Дрожжевая четырехгибридная система идентифицирует Cdk-активирующую киназу как регулятор геликазы XPD, субъединицы фактора транскрипции IIH». Журнал биологической химии. 276 (38): 35328–33. Дои:10.1074 / jbc.M105570200. PMID  11445587.
• Косаки К., Косаки Р., Сузуки Т., Ёсихаши Х., Такахаши Т., Сасаки К., Томита М., МакГиннис В., Мацуо Н. (февраль 2002 г.). «Полная панель анализа мутаций 39 генов HOX человека». Тератология. 65 (2): 50–62. Дои:10.1002 / tera.10009. PMID  11857506.
• Габеллини Д., Колалука И.Н., Водермайер Х.С., Биамонти Дж., Джакка М., Фаласки А., Рива С., Певерали Ф.А. (июль 2003 г.). «Ранняя митотическая деградация гомеопротеина HOXC10 потенциально связана с развитием клеточного цикла». Журнал EMBO. 22 (14): 3715–24. Дои:10.1093 / emboj / cdg340. ЧВК  165610. PMID  12853486.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Берриз Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Чжай Ю., Куик Р., Нан Б., Ота И., Вайс С.Дж., Trimble CL, Fearon ER, Чо КР (ноябрь 2007 г.). «Анализ экспрессии генов преинвазивной и инвазивной плоскоклеточной карциномы шейки матки определяет HOXC10 как ключевой медиатор инвазии». Исследования рака. 67 (21): 10163–72. Дои:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-2056. PMID  17974957.

внешняя ссылка

• HOXC10 + белок, + человек в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.