Ядерный фактор гепатоцитов 4 альфа - Hepatocyte nuclear factor 4 alpha

Смотрите также: MODY 1

HNF4A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1PZL, 3CBB, 3FS1, 4B7W, 4IQR
Идентификаторы
Псевдонимы	HNF4A, HNF4, HNF4a7, HNF4a8, HNF4a9, HNF4alpha, MODY, MODY1, NR2A1, NR2A21, TCF, TCF14, FRTS4, ядерный фактор гепатоцитов 4 альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 600281 MGI: 109128 ГомолоГен: 395 Генные карты: HNF4A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q13.12 Начните 44,355,700 бп[1] Конец 44,434,596 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H3 | 2 84,32 см Начните 163,506,808 бп[2] Конец 163,572,910 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • последовательное связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • РНК-полимераза II, активирующая связывание фактора транскрипции • активность рецепторов стероидных гормонов • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 активность ядерного рецептора • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора транскрипции, связывание с дистальной энхансерной последовательностью РНК-полимеразы II • рецепторное связывание • связывание жирных кислот • активность гомодимеризации белков • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядро клетки • цитоплазма • нуклеоплазма Биологический процесс • гомеостаз триглицеридов • метаболический процесс орнитина • фосфолипидный гомеостаз • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • Передача сигнала белка SMAD • гомеостаз глюкозы • регулирование секреции инсулина • липидный обмен • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • сигнальная трансдукция участвует в регуляции экспрессии генов • половая дифференциация • коагуляция крови • ответ на глюкозу • транскрипция, ДНК-шаблон • положительная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция липидного обмена • путь передачи сигнала внутриклеточного рецептора • регуляция сигнального пути рецептора гормона роста • отрицательная регуляция роста клеток • липидный гомеостаз • ксенобиотический метаболический процесс • инициация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регулирование гаструляции • сигнальный путь, опосредованный стероидными гормонами • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • отрицательное регулирование пролиферации клеток • гомеостаз холестерина • развитие клеток поджелудочной железы типа B • дифференцировка гепатоцитов • регулирование циркадного ритма • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ритмический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3172	15378
Ансамбль	ENSG00000101076	ENSMUSG00000017950
UniProt	P41235	P49698
RefSeq (мРНК)	NM_000457 NM_001030003 NM_001030004 NM_001258355 NM_001287182 NM_001287183 NM_001287184 NM_175914 NM_178849 NM_178850	NM_008261 NM_001312906 NM_001312907
RefSeq (белок)	NP_000448 NP_001025174 NP_001025175 NP_001245284 NP_001274111 NP_001274112 NP_001274113 NP_787110 NP_849180 NP_849181	NP_001299835 NP_001299836 NP_032287
Расположение (UCSC)	Chr 20: 44.36 - 44.43 Мб	Chr 2: 163,51 - 163,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ядерный фактор гепатоцитов 4 альфа (HNF4A) также известен как NR2A1 (подсемейство ядерных рецепторов 2, группа A, член 1) представляет собой ядерный рецептор что у людей кодируется HNF4A ген.^[5][6]

Функция

HNF-4α является ядерным фактор транскрипции который связывает ДНК как гомодимер. Кодируемый белок контролирует экспрессию нескольких генов, в том числе ядерный фактор гепатоцитов 1 альфа, фактор транскрипции, который регулирует экспрессию нескольких генов печени. Этот ген играет роль в развитии печень, почка, и кишечник. Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к множеству вариантов транскриптов.^[7]

HNF4A требуется для PXR и МАШИНА -опосредованная активация транскрипции CYP3A4.^[8] Генетические мутации в HNF4A ген может влиять на активность нижестоящих белков HNF4α, таких как CYP2D6, in vitro и in vivo.^[9][10]

Алкалоид берберин активирует экспрессию HNF4A.^[11]

Этот ген также играет ключевую роль в экспрессии и синтезе SHBG, важно гликопротеин сделано в основном в печень, который помимо снижения инсулинорезистентности также способствует снижению уровня свободных Эстроген а также продление периода полураспада Тестостерон.^{[нужна цитата ]}

Функцию гена HNF4A можно эффективно исследовать путем нокдауна siRNA на основе независимой проверки.^[12]

Клиническое значение

Мутации в гене HNF4A связаны с формой диабета, называемой зрелость, диабет у молодых (МОДИМ).^[13]

Повышенное усиление ядерного фактора гепатоцитов 4 альфа наблюдалось в колоректальный рак.^[14]

Это также связано с появлением фенотипов синдрома Фанкони, который возникает из-за миссенс-мутации гена.^[15]

Взаимодействия

Было показано, что ядерный фактор гепатоцитов 4 альфа взаимодействовать с:

• Бета-катенин,^[16]
• CREB-связывающий белок,^[17][18]
• MED1,^[19][20]
• MED14,^[19][20]
• Малый гетеродимерный партнер^[21]
• Рецептор яичек 4,^[22]

Смотрите также

• Ядерный фактор гепатоцитов 4
• Ядерные факторы гепатоцитов

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101076 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017950 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Chartier FL, Bossu JP, Laudet V, Fruchart JC, Laine B (сентябрь 1994 г.). «Клонирование и секвенирование кДНК, кодирующих ядерный фактор 4 гепатоцитов человека, указывают на присутствие двух изоформ в печени человека». Ген. 147 (2): 269–72. Дои:10.1016/0378-1119(94)90079-5. PMID  7926813.
6. Argyrokastritis A, Kamakari S, Kapsetaki M, Kritis A, Talianidis I, Moschonas NK (февраль 1997 г.). «Ген ядерного фактора-4 гепатоцитов человека (hHNF-4) отображается в 20q12-q13.1 между PLCG1 и D20S17». Генетика человека. 99 (2): 233–6. Дои:10.1007 / s004390050345. PMID  9048927. S2CID  10943721.
7. «Ген Entrez: HNF4A, ядерный фактор гепатоцитов 4, альфа».
8. Тирона Р.Г., Ли В., Лик Б.Ф., Лан Л.Б., Клайн С.Б., Ламба В., Парвиз Ф., Дункан С.А., Иноуэ И., Гонсалес Ф.Дж., Шуэц Э.Г., Ким Р.Б. (февраль 2003 г.). «Орфанный ядерный рецептор HNF4alpha определяет PXR- и CAR-опосредованную ксенобиотическую индукцию CYP3A4». Природа Медицина. 9 (2): 220–4. Дои:10,1038 / нм815. PMID  12514743. S2CID  8925996.
9. Ли СС, Ча ЭЙ, Юнг Х.Дж., Шон Дж.Х., Ким ЭЙ, Йео Ч.В., Шин Дж.Г. (2008). «Генетический полиморфизм ядерного фактора гепатоцитов-4альфа влияет на активность человеческого цитохрома P450 2D6». Гепатология. 48 (2): 635–45. Дои:10.1002 / hep.22396. PMID  18666237. S2CID  205866107.
10. Цзян Ф., Йео CW, Ли СС, О МК, Гхим Дж.Л., Шон Дж.Х., Ким Х.С., Ким ЭЙ, Ким Д.Х., Шин Дж.Г. (2013). «Влияние генетического полиморфизма G60D HNF4α на фармакокинетику толтеродина субстрата CYP2D6 у здоровых корейцев». Фармакогенетика и геномика. 23 (3): 175–9. Дои:10.1097 / FPC.0b013e32835de25e. PMID  23292115. S2CID  19230792.
11. Wang ZQ, Lu FE, Ленг SH, Fang XS, Chen G, Wang ZS, Dong LP, Yan ZQ (октябрь 2008 г.). «Облегчение воздействия берберина на островки поджелудочной железы крыс за счет модуляции экспрессии ядерного фактора 4 альфа в печени и активности глюкокиназы». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 14 (39): 6004–11. Дои:10.3748 / wjg.14.6004. ЧВК  2760199. PMID  18932278.
12. Мункачи, Дьёнджи; Штупински, Жофия; Герман, Петер; Бан, Бенце; Пензвальто, Жофия; Сарвас, Нора; Дьёрфи, Балаж (01.01.2016). «Проверка эффективности подавления РНКи с использованием данных по массиву генов показывает 18,5% отказов в 429 независимых экспериментах». Молекулярная терапия - нуклеиновые кислоты. 5 (9): e366. Дои:10.1038 / mtna.2016.66. ISSN  2162-2531. ЧВК  5056990. PMID  27673562.
13. Ямагата К. (2014). «Роль HNF1α и HNF4α в β-клетках поджелудочной железы: уроки моногенной формы диабета (MODY)». Витамины и гормоны. 95: 407–23. Дои:10.1016 / B978-0-12-800174-5.00016-8. PMID  24559927.
14. Чжан Б., Ван Дж., Ван Х, Чжу Дж., Лю Цюй, Ши З и др. (2014). «Протеогеномная характеристика рака прямой и толстой кишки человека». Природа. 513 (7518): 382–7. Bibcode:2014Натура.513..382.. Дои:10.1038 / природа13438. ЧВК  4249766. PMID  25043054.
15. Kashoor I, Batlle D (сентябрь 2019 г.). «Проксимальный почечный канальцевый ацидоз с синдромом Фанкони и без него». Исследование почек и клиническая практика. 38 (3): 267–281. Дои:10.23876 / j.krcp.19.056. ЧВК  6727890. PMID  31474092.
16. Mulholland DJ, Read JT, Rennie PS, Cox ME, Nelson CC (август 2003 г.). «Функциональная локализация и конкуренция между рецептором андрогена и Т-клеточным фактором за ядерный бета-катенин: средство для ингибирования оси передачи сигналов Tcf». Онкоген. 22 (36): 5602–13. Дои:10.1038 / sj.onc.1206802. PMID  12944908.
17. Ёсида Е., Аратани С., Ито Х, Миягиши М., Такигучи М., Осуму Т., Мураками К., Фукамизу А. (декабрь 1997 г.). «Функциональная ассоциация между CBP и HNF4 в трансактивации». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 241 (3): 664–9. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7871. PMID  9434765.
18. Делл Х., Хадзопулу-Кладарас М. (март 1999 г.). «CREB-связывающий белок является коактиватором транскрипции ядерного фактора-4 гепатоцитов и усиливает экспрессию гена аполипопротеина». Журнал биологической химии. 274 (13): 9013–21. Дои:10.1074 / jbc.274.13.9013. PMID  10085149.
19. Маэда Й., Рашез К., Хавел Л., Биус CV, Фридман LP, Sladek FM (июль 2002 г.). «Полиамины модулируют взаимодействие между ядерными рецепторами и белком 205, взаимодействующим с рецептором витамина D». Молекулярная эндокринология. 16 (7): 1502–10. Дои:10.1210 / исправление.16.7.0883. PMID  12089346.
20. Малик С., Валлберг А.Е., Канг Ю.К., Родер Р.Г. (август 2002 г.). «TRAP / SMCC / медиатор-зависимая активация транскрипции из ДНК и хроматиновых матриц под действием ядерного фактора 4 гепатоцитов-сиротских ядер». Молекулярная и клеточная биология. 22 (15): 5626–37. Дои:10.1128 / MCB.22.15.5626-5637.2002. ЧВК  133960. PMID  12101254.
21. Ли Ю.К., Делл Х., Доухан Д.Х., Хадзопулу-Кладарас М., Мур Д.Д. (январь 2000 г.). «Орфанный ядерный рецептор SHP ингибирует ядерный фактор 4 гепатоцитов и трансактивацию рецептора ретиноида X: два механизма репрессии». Молекулярная и клеточная биология. 20 (1): 187–95. Дои:10.1128 / MCB.20.1.187-195.2000. ЧВК  85074. PMID  10594021.
22. Лин В.Дж., Ли Дж., Ли Ю.Ф., Йе С.Д., Алтувайджри С., Оу Дж. Х., Чанг К. (март 2003 г.). «Подавление корового промотора вируса гепатита B ядерным орфанным рецептором TR4». Журнал биологической химии. 278 (11): 9353–60. Дои:10.1074 / jbc.M205944200. PMID  12522137.

дальнейшее чтение

• Winter WE, Nakamura M, House DV (декабрь 1999 г.). «Моногенный сахарный диабет в молодости. Синдромы MODY». Клиники эндокринологии и метаболизма Северной Америки. 28 (4): 765–85. Дои:10.1016 / S0889-8529 (05) 70101-8. PMID  10609119.
• Заннис В.И., Кан Х.Й., Критис А., Занни Э., Кардассис Д. (март 2001 г.). «Транскрипционная регуляция генов аполипопротеинов человека». Границы биологических наук. 6: D456-504. Дои:10.2741 / Заннис. PMID  11229886.
• Гупта Р.К., Кестнер К.Х. (ноябрь 2004 г.). «HNF-4alpha: от MODY до диабета 2 типа с поздним началом». Тенденции в молекулярной медицине. 10 (11): 521–4. Дои:10.1016 / j.molmed.2004.09.004. PMID  15519277.
• Mohlke KL, Boehnke M (апрель 2005 г.). «Роль вариантов HNF4A в риске диабета 2 типа». Текущие отчеты о диабете. 5 (2): 149–56. Дои:10.1007 / s11892-005-0043-у. PMID  15794920. S2CID  1661923.
• Love-Gregory L, Permutt MA (июль 2007 г.). «Генетические варианты HNF4A: роль в диабете». Текущее мнение о клиническом питании и метаболическом лечении. 10 (4): 397–402. Дои:10.1097 / MCO.0b013e3281e3888d. PMID  17563455. S2CID  10318597.
• Белл Г.И., Сян К.С., Ньюман М.В., Ву Ш., Райт Л.Г., Фаянс СС, Спилман Р.С., Кокс, штат Нью-Джерси (февраль 1991 г.). «Ген инсулиннезависимого сахарного диабета (диабет молодого подтипа с началом зрелости) связан с полиморфизмом ДНК на хромосоме 20q человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 88 (4): 1484–8. Bibcode:1991PNAS ... 88.1484B. Дои:10.1073 / pnas.88.4.1484. ЧВК  51043. PMID  1899928.
• Ктистаки Э., Ктистакис Н.Т., Пападогеоргаки Э., Талианидис I (октябрь 1995 г.). «Рекрутирование ядерного фактора 4 гепатоцитов в определенные внутриядерные компартменты зависит от фосфорилирования тирозина, которое влияет на его ДНК-связывающий и трансактивационный потенциал». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 92 (21): 9876–80. Bibcode:1995PNAS ... 92.9876K. Дои:10.1073 / пнас.92.21.9876. ЧВК  40905. PMID  7568236.
• Ginsburg GS, Ozer J, Karathanasis SK (июль 1995 г.). «Транскрипция гена аполипопротеина AI кишечника регулируется множеством различных элементов ДНК и синергически активируется орфанным ядерным рецептором, ядерным фактором гепатоцита 4». Журнал клинических исследований. 96 (1): 528–38. Дои:10.1172 / JCI118065. ЧВК  185227. PMID  7615825.
• Jiang G, Nepomuceno L, Hopkins K, Sladek FM (сентябрь 1995 г.). «Исключительная гомодимеризация орфанного рецептора ядерного фактора 4 гепатоцитов определяет новый подкласс ядерных рецепторов». Молекулярная и клеточная биология. 15 (9): 5131–43. Дои:10.1128 / mcb.15.9.5131. ЧВК  230760. PMID  7651430.
• Chartier FL, Bossu JP, Laudet V, Fruchart JC, Laine B (сентябрь 1994 г.). «Клонирование и секвенирование кДНК, кодирующих ядерный фактор 4 гепатоцитов человека, указывают на присутствие двух изоформ в печени человека». Ген. 147 (2): 269–72. Дои:10.1016/0378-1119(94)90079-5. PMID  7926813.
• Дрюс Т., Сенкель С., Холева Б., Риффель Г.У. (март 1996 г.). «Изоформы ядерного фактора 4 гепатоцитов человека кодируются отдельными и дифференциально экспрессируемыми генами». Молекулярная и клеточная биология. 16 (3): 925–31. Дои:10.1128 / mcb.16.3.925. ЧВК  231074. PMID  8622695.
• Ямагата К., Фурута Х, Ода Н., Кайсаки П.Дж., Мензель С., Кокс Нью-Джерси, Фаянс С.С., Синьорини С., Стоффель М., Белл Г.И. (декабрь 1996 г.). «Мутации в гене ядерного фактора гепатоцитов-4альфа при диабете зрелого возраста у молодых (MODY1)». Природа. 384 (6608): 458–60. Bibcode:1996Натура.384..458л. Дои:10.1038 / 384458a0. HDL:2027.42/62605. PMID  8945471. S2CID  4253951.
• Kritis AA, Argyrokastritis A, Moschonas NK, Power S, Katrakili N, Zannis VI, Cereghini S, Talianidis I (сентябрь 1996 г.). «Выделение и характеристика третьей изоформы ядерного фактора 4 гепатоцитов человека». Ген. 173 (2): 275–80. Дои:10.1016/0378-1119(96)00183-7. PMID  8964514.
• Argyrokastritis A, Kamakari S, Kapsetaki M, Kritis A, Talianidis I, Moschonas NK (февраль 1997 г.). «Ген ядерного фактора-4 гепатоцитов человека (hHNF-4) отображается в 20q12-q13.1 между PLCG1 и D20S17». Генетика человека. 99 (2): 233–6. Дои:10.1007 / s004390050345. PMID  9048927. S2CID  10943721.
• Тено С., Анрике С., Рошфор Н., Кавай В. (май 1997 г.). «Дифференциальное взаимодействие ядерных рецепторов с предполагаемым коактиватором транскрипции человека hTIF1». Журнал биологической химии. 272 (18): 12062–8. Дои:10.1074 / jbc.272.18.12062. PMID  9115274.
• Bulman MP, Dronsfield MJ, Frayling T., Appleton M, Bain SC, Ellard S, Hattersley AT (июль 1997 г.). «Миссенс-мутация в гене альфа ядерного фактора 4 гепатоцитов в британской родословной с диабетом в зрелом возрасте». Диабетология. 40 (7): 859–62. Дои:10.1007 / s001250050760. PMID  9243109.
• Мёллер А.М., Урхаммер С.А., Далгаард Л.Т., Ренеланд Р., Берглунд Л., Хансен Т., Клаузен Дж. О., Лителл Г., Педерсен О. (август 1997 г.). «Изучение генетической изменчивости кодирующей области ядерного фактора гепатоцитов-4альфа у кавказцев с наступлением зрелости NIDDM». Диабетология. 40 (8): 980–3. Дои:10.1007 / s001250050778. PMID  9267996.
• Линднер Т., Граньоли С., Фурута Х., Кокберн Б.Н., Петцольд С., Рицш Х., Вайс Ю., Шульце Дж., Белл Г.И. (сентябрь 1997 г.). «Функция печени в семье с нонсенс-мутацией (R154X) в гене ядерного фактора гепатоцитов-4альфа / MODY1». Журнал клинических исследований. 100 (6): 1400–5. Дои:10.1172 / JCI119660. ЧВК  508318. PMID  9294105.
• Фурута Х., Ивасаки Н., Ода Н., Хинокио ​​Ю., Хорикава Ю., Ямагата К., Яно Н., Сугахиро Дж., Огата М., Огавара Х., Омори И., Ивамото Ю., Белл Г. И. (октябрь 1997 г.). «Организация и частичная последовательность гена ядерного фактора гепатоцитов-4 альфа / MODY1 и идентификация миссенс-мутации, R127W, в японской семье с MODY». Сахарный диабет. 46 (10): 1652–7. Дои:10.2337 / диабет.46.10.1652. PMID  9313765.
• Стоффель М., Дункан С.А. (ноябрь 1997 г.). «Сахарный диабет молодых людей (MODY1), транскрипционный фактор HNF4alpha регулирует экспрессию генов, необходимых для транспорта и метаболизма глюкозы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (24): 13209–14. Bibcode:1997PNAS ... 9413209S. Дои:10.1073 / пнас.94.24.13209. ЧВК  24288. PMID  9371825.

внешняя ссылка

• FactorBook HNF4A

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.