MXD1 - MXD1

MXD1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1E91, 1G1E, 1NLW, 1PD7, 1S5Q
Идентификаторы
Псевдонимы	MXD1, BHLHC58, MAD, MAD1, MAX димеризации белка 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 600021 MGI: 96908 ГомолоГен: 1767 Генные карты: MXD1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п13.3 Начните 69,897,688 бп[1] Конец 69,942,945 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 D1 | 6 37,75 см Начните 86,647,042 бп[2] Конец 86,669,161 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001104 активность корегулятора транскрипции • активность димеризации белков • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II Сотовый компонент • ядерный хроматин • ядро клетки • нуклеоплазма • митохондрия • цитозоль Биологический процесс • развитие многоклеточного организма • клеточная пролиферация • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4084	17119
Ансамбль	ENSG00000059728	ENSMUSG00000001156
UniProt	Q05195	P50538
RefSeq (мРНК)	NM_002357 NM_001202513 NM_001202514	NM_010751
RefSeq (белок)	NP_001189442 NP_001189443 NP_002348	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 2: 69.9 - 69.94 Мб	Chr 6: 86.65 - 86.67 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

MAD белок это белок что у людей кодируется MXD1 ген.^[5][6]

Белок димеризации MAD-MAX принадлежит к подсемейству MAX-взаимодействующих белков. Этот белок конкурирует с MYC за связывание с MAX с образованием специфичного для последовательности ДНК-связывающего комплекса, действует как репрессор транскрипции (в то время как MYC, по-видимому, действует как активатор) и является кандидатом в супрессор опухоли.^[6]

Взаимодействия

MXD1 был показан взаимодействовать с Гистоновая деацетилаза 2,^[7][8] SMC3,^[9] MLX,^[10][11] SIN3A^[12][13][14] и МАКСИМУМ.^{[9][15][16][17]}

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000059728 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001156 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шапиро Д. Н., Валентин В., Орел Л., Инь Х, Моррис С. В., Проховник Е. В. (февраль 1995 г.). «Отнесение генов MAD и MXI1 человека к хромосомам 2p12-p13 и 10q24-q25». Геномика. 23 (1): 282–5. Дои:10.1006 / geno.1994.1496. PMID  7829091.
6. «Ген Entrez: белок 1 димеризации MXD1 MAX».
7. Laherty, C D; Ян W M; Sun J M; Дэви Дж. Р.; Seto E; Эйзенман Р. Н. (май 1997 г.). «Гистоновые деацетилазы, связанные с корепрессором mSin3, опосредуют безумную репрессию транскрипции». Ячейка. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 89 (3): 349–56. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80215-9. ISSN  0092-8674. PMID  9150134. S2CID  13490886.
8. Спронк, C A; Тессари М; Kaan A M; Jansen J F; Vermeulen M; Stunnenberg H G; Vuister G W (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие Mad1-Sin3B включает новую спиральную складку». Nat. Struct. Биол. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 7 (12): 1100–4. Дои:10.1038/81944. ISSN  1072-8368. PMID  11101889. S2CID  12451972.
9. Гупта, К; Ананд Г; Инь X; Grove L; Проховник Е. В. (март 1998 г.). «Mmip1: новый белок лейциновой молнии, который отменяет подавляющее действие членов семьи Mad на c-myc». Онкоген. АНГЛИЯ. 16 (9): 1149–59. Дои:10.1038 / sj.onc.1201634. ISSN  0950-9232. PMID  9528857.
10. Каир, S; Merla G; Urbinati F; Ballabio A; Реймонд А. (март 2001 г.). «WBSCR14, ген, отображающий удаленную область синдрома Вильямса-Бёрена, является новым членом сети транскрипционных факторов Mlx». Гм. Мол. Genet. Англия. 10 (6): 617–27. Дои:10,1093 / чмг / 10.6.617. ISSN  0964-6906. PMID  11230181.
11. Meroni, G; Cairo S; Merla G; Messali S; Brent R; Ballabio A; Реймонд А. (июль 2000 г.). «Mlx, новый Max-подобный член семейства bHLHZip: центральный этап нового пути регуляции транскрипционных факторов?». Онкоген. АНГЛИЯ. 19 (29): 3266–77. Дои:10.1038 / sj.onc.1203634. ISSN  0950-9232. PMID  10918583.
12. Суонсон, Курт А.; Knoepfler Paul S; Хуанг Кай; Кан Ричард С; Коули Шон М; Лахерти Кэрол Д; Эйзенман Роберт Н; Радхакришнан Ишвар (август 2004 г.). «Репрессоры HBP1 и Mad1 связывают корепрессорный домен PAH2 Sin3 с противоположными спиральными ориентациями». Nat. Struct. Мол. Биол. Соединенные Штаты. 11 (8): 738–46. Дои:10.1038 / nsmb798. ISSN  1545-9993. PMID  15235594. S2CID  44324333.
13. Брубейкер, К; Cowley S M; Хуанг К; Loo L; Yochum G S; Ayer D E; Eisenman R N; Радхакришнан I (ноябрь 2000 г.). «Структура решения взаимодействующих доменов комплекса Mad-Sin3: последствия для рекрутирования хроматин-модифицирующего комплекса». Ячейка. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 103 (4): 655–65. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 00168-9. ISSN  0092-8674. PMID  11106735. S2CID  17476603.
14. Айер, Д. Э .; Лоуренс К. А.; Эйзенман Р. Н. (март 1995 г.). «Репрессия транскрипции Mad-Max опосредована образованием тройного комплекса с гомологами дрожжевого репрессора Sin3 млекопитающих». Ячейка. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 80 (5): 767–76. Дои:10.1016/0092-8674(95)90355-0. ISSN  0092-8674. PMID  7889570. S2CID  8749951.
15. Ли, Клемент М; Онесиме Джамила; Редди Си Дамодара; Дханасекаран Н; Редди Е. Премкумар (октябрь 2002 г.). «JLP: каркасный белок, который связывает сигнальные модули JNK / p38MAPK и факторы транскрипции». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. Соединенные Штаты. 99 (22): 14189–94. Bibcode:2002PNAS ... 9914189L. Дои:10.1073 / pnas.232310199. ISSN  0027-8424. ЧВК  137859. PMID  12391307.
16. Айер, Д. Э .; Kretzner L; Эйзенман Р. Н. (январь 1993 г.). «Безумный: гетеродимерный партнер Макса, который противодействует транскрипционной активности Myc». Ячейка. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 72 (2): 211–22. Дои:10.1016/0092-8674(93)90661-9. ISSN  0092-8674. PMID  8425218. S2CID  13317223.
17. Наир, Сатиш К; Берли Стивен К. (январь 2003 г.). «Рентгеновские структуры Myc-Max и Mad-Max, узнающей ДНК. Молекулярные основы регуляции протоонкогенных факторов транскрипции». Ячейка. Соединенные Штаты. 112 (2): 193–205. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 01284-9. ISSN  0092-8674. PMID  12553908. S2CID  16142388.

дальнейшее чтение

• Грандори С., Коули С.М., Джеймс Л.П., Эйзенман Р.Н. (2001). «Сеть Myc / Max / Mad и транскрипционный контроль клеточного поведения». Анну. Rev. Cell Dev. Биол. 16 (1): 653–99. Дои:10.1146 / annurev.cellbio.16.1.653. PMID  11031250.
• Люшер Б (2001). «Функция и регуляция факторов транскрипции сети Myc / Max / Mad». Ген. 277 (1–2): 1–14. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00697-7. PMID  11602341.
• Айер Д.Е., Лоуренс QA, Эйзенман Р.Н. (1995). «Репрессия транскрипции Mad-Max опосредована образованием тройного комплекса с гомологами дрожжевого репрессора Sin3 млекопитающих». Ячейка. 80 (5): 767–76. Дои:10.1016/0092-8674(95)90355-0. PMID  7889570. S2CID  8749951.
• Эдельхофф С., Айер Д.Е., Зервос А.С. и др. (1994). «Картирование двух генов, кодирующих членов отдельного подсемейства MAX взаимодействующих белков: MAD с хромосомой 2 человека и хромосомой 6 мыши и MXI1 с хромосомой 10 человека и хромосомой 19 мыши». Онкоген. 9 (2): 665–8. PMID  8290278.
• Айер Д.Е., Кретцнер Л., Эйзенман Р.Н. (1993). «Безумный: гетеродимерный партнер Макса, который противодействует транскрипционной активности Myc». Ячейка. 72 (2): 211–22. Дои:10.1016/0092-8674(93)90661-9. PMID  8425218. S2CID  13317223.
• Hassig CA, Fleischer TC, Billin AN, et al. (1997). «Активность гистон-деацетилазы необходима для полной репрессии транскрипции с помощью mSin3A». Ячейка. 89 (3): 341–7. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80214-7. PMID  9150133. S2CID  14233219.
• Laherty CD, Yang WM, Sun JM и др. (1997). «Гистоновые деацетилазы, связанные с корепрессором mSin3, опосредуют безумную репрессию транскрипции». Ячейка. 89 (3): 349–56. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80215-9. PMID  9150134. S2CID  13490886.
• Гупта К., Ананд Дж., Инь Х и др. (1998). «Mmip1: новый белок лейциновой молнии, который отменяет подавляющее действие членов семьи Mad на c-myc». Онкоген. 16 (9): 1149–59. Дои:10.1038 / sj.onc.1201634. PMID  9528857.
• Фитцджеральд М.Дж., Арсура М., Беллас Р.Э. и др. (1999). «Дифференциальные эффекты широко выраженного варианта сплайсинга dMax Max на E-box против регуляции c-Myc, опосредованной инициаторным элементом». Онкоген. 18 (15): 2489–98. Дои:10.1038 / sj.onc.1202611. PMID  10229200.
• Хан М.М., Номура Т., Ким Х. и др. (2001). «Роль PML и PML-RARalpha в Mad-опосредованной репрессии транскрипции». Мол. Ячейка. 7 (6): 1233–43. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00257-X. PMID  11430826.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Никифоров М.А., Попов Н., Котенко И. и др. (2003). «Базовые домены Mad и Myc функционально эквивалентны». J. Biol. Chem. 278 (13): 11094–9. Дои:10.1074 / jbc.M212298200. PMID  12538578.
• Наир СК, Берли СК (2003). «Рентгеновские структуры Myc-Max и Mad-Max, узнающей ДНК. Молекулярные основы регуляции протоонкогенных факторов транскрипции». Ячейка. 112 (2): 193–205. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 01284-9. PMID  12553908. S2CID  16142388.
• Сигел П.М., Шу В., Массагуэ Дж. (2003). «Безумная повышающая регуляция и репрессия Id2 сопровождают бета-опосредованное трансформирующим фактором роста подавление роста эпителиальных клеток». J. Biol. Chem. 278 (37): 35444–50. Дои:10.1074 / jbc.M301413200. PMID  12824180.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Bibcode:2005Натура.434..724H. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Zada AA, Pulikkan JA, Bararia D, et al. (2007). «Протеомное открытие Макса как нового взаимодействующего партнера C / EBPalpha: связь Myc / Max / Mad». Лейкемия. 20 (12): 2137–46. Дои:10.1038 / sj.leu.2404438. PMID  17082780.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q05195 (Максимальная димеризация белка 1) на PDBe-KB.